基于生物信息学数据库的研究与应用

随着生物信息学的发展,生物信息数据库日趋完善.本文阐述了生物信息学数据库在生物信息学的发展过程中发挥的巨大作用;介绍了世界上主要的生物信息学数据库及其分类和特点;论述了如何利用生物信息学数据库以及对生物信息学数据库的展望.     

分布式空间数据集成在国土资源系统的应用

分布式空间数据集成是当前解决异构空间数据库的共享的主要手段；通过对分布式空间数据库集成的深入探讨和研究，结合国土资源系统的异构空间数据库的特点和现状，提出了相对简单的分布式空间数据库集成模式来实现系统内异构空间数据的整合，并在国土资源系统内得到了应用。     

图书馆网络信息资源整合工具——MAP及其启示

通过屏蔽各个数据库之间的异构性,对数据库资源进行整合实现电子资源的"一站式"查询成为当前图书馆建设的一个新课题。文章介绍了MAP可以整合的资源类型、工作机制等相关理论,同时阐述MAP给我国异构信息资源整合管理系统开发商和信息服务提供者带来的启示。     

基于XML和中间件的异构数据库集成研究探索

文章分析了当前国内外关于异构数据库的研究现状,以智能楼宇管理系统建设为基础,提出基于B/S三层结构模式的异构数据库集成方案,采用XM L设定不同类型数据的转换格式,采用中间件技术整合异构数据库,实现整个智能楼宇信息资源的合理共享与分配,实现智能建筑管理的统一化、规范化和智能化。     

现代信息技术在生物信息学研究中的应用

通过对生物信息学研究内容和目的的分析,阐明了现代信息技术在生物信息的采集、存储、处理、获取、分析中的重要作用．重点介绍了数据库技术、数据仓库技术及数据挖掘技术在生物信息学中的具体应用。     

一种新型异构数据信息整合与分析系统的构建

基于XML和Java技术,构建了异构数据信息整合与分析系统JavaXML,lavaXML将关系数据库和Native XML数据库相结合作为后台数据库,可存储和管理收集到的异构数据信息;利用JSp技术构建网络数据库,以XML形式的半结构化数据进行信息动态发布.JavaXML包含了一个数据挖掘与分析平台,该平台提供了多种数值与统计计算方法,如显著性标记的聚类分析.显著性标记的相关分析,模式识别算法等等.本平台在动态数据库访问、计算方法、运行环境、即时更新与跨平台等方面有明显优点.JavaXML具有灵活性、可移植性、高效性和轻便性等特点.有利于方便、快捷地整合与分析各种异构数据信息资源,为实现异构数据信息的存储、检索、传输和分析提供了一种新的解决方案.     

基于XML的异构数据的整合与集成模式探讨

文章提出了基于XML的信息交换模型。为实现异构数据库信息系统间信息的整合与集成提供了一种有力的方法和手段。     

生物信息学研究方法探讨

分析了生物信息学的内涵、主要内容、研究方向和面临严峻的挑战;探讨了生物信息学的主要研究方法:动态规划算法、启发式方法、聚类分析、机器学习方法、非参数统计、建模和仿真、序列分析软件包、生物信息数据库、序列对位排列方法等。还专门分析了生物信息学的新兴研究方法——大数据分析方法产生的背景、突出特点和适用于生物信息学研究的具体方法技术。     

基于共享的异构数字化资源整合

由于网络互联在一起的分布信息仓储的异构及各自提供的检索方法不同，难以实现跨仓储的统一利用，必需解决网络环境下的信息集成、共享，使得异构环境下的海量信息对用户来说就像管理和应用单一数据源那样方便，为社会和个人提供一体化的信息支持。而现有的技术还不足以完全清足用户不断提高的信息服务需求，异构数据库的整合、海量信息的组织管理，目前还存在许多需要解决的诸多问题。     

GMOD:通用生物模型数据库

近年来随着生物信息数据的爆炸性增长,管理数据的数据库建设就变得极为重要,甚至成为当代基于各种"组学"的生物学研究的瓶颈步骤。本文通过对通用生物模型数据库(GMOD)系统进行研究和分析,对其发展的过程、主要特点、结构框架等方面进行了系统的分析总结,并重点对该系统的3个重要应用模块:Chado、GBrowse和Apoll,从特点、结构、功能等各个方面进行了详细介绍。最后我们对GMOD应用模块在不同生物信息数据库中的使用情况进行了收集、整理和分类,以方便研究人员借鉴参考。通过以上工作,我们希望为国内广大生物科技研究人员介绍这套国际通用的数据库建立方法和工具,方便研究人员对生物信息数据进行管理和分析,推动GMOD在中国的使用以及生物信息学在中国的发展。     

引文索引系统再开发研究

本文通过建立协作机制把引文索引与全文库进行映射，借助接口函数实现访问权限，克服数据库之间的异构性，实现全文库的浏览，为网络信息资源的整合和利用指明了一条道路。     

生物信息数据挖掘应用研究

生物信息学是以计算机为工具对生物信息进行存储、检索和分析的科学。人类基因组计划的启动和实施使得生物数据迅速增长,如何从海量数据中获取有效信息成为生物信息学迫切要解决的问题。数据挖掘技术应用于生物信息分析成为当前的研究热点。文中介绍了数据挖掘技术和常用的生物信息处理软件,重点研究生物信息数据挖掘的典型应用,研究表明数据挖掘技术是生物信息处理的强有力工具。     

一种异构数据转换系统的实现

本文提出了一种异构数据转换算法并实现了异构数据库转换系统。通过建立树型结构和树节点对应关系,加快了数据搜索速度。通过建立数据映射,信息对接,数据汇总等步骤实现了数据整合。基于所设计的算法,建开发了建立标准库结构,配置库结构,配置转化关系三个模块,实现了异构数据库的互联互通。     

数字资源整合技术研究现状述评

从异构数据库资源整合技术、链接访问技术、元数据整合技术和基于Web的信息资源整合技术四个方面．对当前数字资源整合技术发展的优缺点进行了深入分析,并探讨了数字资源整合技术的发展趋势。     

基于XML技术的异构数据库间信息共享

由于历史等原因，各商务网站现有的大量数据库是异构的，随着网站间电子商务的发展．异构数据库之间的数据交互日益频繁，提出了一个基于XML技术实现异构数据库之间信息共享的模型。     

WEBGIS在“数字气田”信息系统中的应用

介绍WEBGIS在天然气多源异构信息系统中的应用，融合了多源异构数据库的整合与地理信息系统(GiS)的WEB展示的特点，论述了其系统功能和开发技术，具体系统构架和实施方案。     

生物信息学序列库与文献库的整合模式浅析

在分析生物信息学领域已有数据库、整合平台的基础上,归结了目前生物学数据库融合的两种模式:交叉引用模式和集成模式,并总结了目前系统的不足及数据库融合面临的困难,为进一步研究序列库与文献库的整合打下基础.     

一种解决分布式异构信息资源整合的方法研究

本文在全面分析当前已有的分布式异构信息资源整合方法的基础上,提出了一种基于虚拟数据中心与XML数据库技术的分布式异构信息资源整合方法以及相应的系统模型.围绕这一方法和模型,论述了在信息资源跨平台整合过程中兼顾全局统一应用模式的基本思想,分析了信息资源整合模型实现的工作原理和体系结构,并结合实例分析了实际应用的方向和前景.     

BLAST序列比对与生物医学文献检索

生物信息学的急速发展及其数据库的急剧增长给文献检索提出了新课题。利用生物信息相关数据库需要结合生物信息学知识。本研究从新基因的名词与序列入手，介绍NCBI的ENTREz、BLAST检索，阐明与基因相关的文献检索的方法与技巧，着重介绍了BLAST序列比对在信息检索中的步骤和作用。     

企业数字资源整合系统的设计与实现

随着企业对竞争情报的重视,越来越倾向于购买和共享各种数字资源,然而,如何整合这些电子资源,为用户提供更好的服务,是需要重点解决的问题.针对这一现状,提出了企业数字资源整合系统,实现了对各类异构数据库的有效整合,满足各层面用户的信息需求.