柯萨奇病毒A10型VP1蛋白的线性B细胞表位预测 |
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引用本文: | 沈红元,陈玉蓉.柯萨奇病毒A10型VP1蛋白的线性B细胞表位预测[J].孝感职业技术学院学报,2015(2):107-109,95. |
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作者姓名: | 沈红元 陈玉蓉 |
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作者单位: | 湖北职业技术学院医学院;湖北汉川血防医院检验科 |
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基金项目: | 湖北职业技术学院2014年度校级课题“柯萨奇病毒A10型VPI蛋白的线性B细胞表位预测”(项目编号:2014B06)的阶段性研究成果 |
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摘 要: | 目的:预测柯萨奇病毒A组10型(CVA10)的VP1蛋白的线性B细胞抗原表位,为CVA10疫苗研制提供理论基础。方法:分析我国近年流行的CVA10分离株的VP1序列进化特征;选择代表株以DNAStar软件预测其VP1蛋白序列的二级结构、亲水性、柔韧性、表面可能性和抗原指数等指标,根据这些指标综合分析预测VP1蛋白中可能的B细胞表位区域。结果:相对于CVA10原型株,我国CVA10分离株的VP1序列已发生了较大的变化;CVA10代表株的VP1中存在较多的β转角,而无规则卷曲结构较少;根据VP1序列的理化性质和二级结构等多种特征,预测到9个可能的线性B细胞表位。结论:成功预测到我国CVA10分离株VP1可能的B细胞表位区域,为CVA10表位疫苗的研发提供了理论基础。
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关 键 词: | 手足口病 柯萨奇病毒 B细胞表位 |
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