小麦SOD基因的电子克隆及生物信息学分析

以NCBI中的EST数据库为主要数据来源,以一系列生物信息学软件为工具,进行了超氧化物歧化酶（SOD）基因的电子克隆及生物信息学分析。结果表明：通过电子克隆方法获得了SOD基因的编码区全长序列,该预测的SOD蛋白质氨基酸序列与数据库中同类基因的蛋白质氨基酸序列具有极高的相似性,并且含有完整的保守结构域;电子克隆到的SOD基因编码的不是分泌蛋白,也不是膜蛋白,而是胞质蛋白。通过某个基因的一个EST序列采用电子克隆的手段进行基因全长的电子拼接是可行的。     

一份人类自己的“生命说明书”——谈人类基因组测序计划的圆满完成

英美科学家于17日公布了人类1号染色体的基因序列，这表明人类最大和最后一个染色体的测序工作已经完成，人类基因组测序计划已经画上了句号。     

麂亚科动物中一段未知序列的克隆及其亲缘关系分析

用PCR方法,在扩增钾通道蛋白基因的同时获得了一条未知序列,经序列分析,进行4种麂亚科动物(黑麂、赤麂、小麂和毛冠鹿)的同源性比较,发现麂属动物种间的DNA差异在1.64％-2.54％之间;毛冠鹿与麂属3种动物的差异在2.76％-3.33％之间。另外毛冠鹿的序列中有一段连续的序列(约17个碱基)在麂属动物中是没有的,表明毛冠鹿与麂属动物有着明显的差异。     

基于序列、结构和芯片数据的聚类算法

运用图论中的一系列思想对生物序列、蛋白质结构和基因芯片数据进行综合分析,将多物种的序列进行聚类,为生物基因的功能研究提供了新的思路.其算法首先根据生物序列的相似度、蛋白质结构的相似度和基因芯片数据的相似度建立一级图,然后根据一级图建立二级图,进而通过二级图的分析来挖掘基因的聚类关系.算法聚类的结果可以对各种基因的功能进行预测,可广泛应用于后基因组计划的基因和蛋白质研究.     

枇杷果实液泡膜V-ATPase D亚基基因的克隆及表达

提取枇杷果实总RNA,根据RNAseq数据库查找得到的(液泡膜质子泵V-ATPase)基因片段序列11个。设计引物,采用RACE技术,获得质子泵V-ATPase cDNA的全长,对测序结果进行分析,并将序列在NCBI上进行blast比对,结果显示核苷酸序列和氨基酸同源性均在80%以上,为质子泵酶基因V-ATPase D亚基基因。经qPCR分析表明,该基因对枇杷果实有机酸具有明显调控作用。     

柔嫩艾美耳球虫(广东株)子孢子折光体抗原p28基因的分析

将克隆的柔嫩艾美耳球虫广东株p28基因与柔嫩艾美耳球虫MerckstrainLS18株的折光体抗原p28基因和USDA－APIno．24株折光体抗原GX3262基因进行了序列比较．发现广东株和MerckstrainLS18株的折光体抗原核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别为99．9％和100％，且基因内富含AGC重复顺序；而GX3262的基因序列为P28基因C-端的组成部分，并无特别的疏水和亲水区．     

中华绒螯蟹丝氨酸蛋白酶及其同源物的比较分析

文章对中华绒螯蟹丝氨酸蛋白酶及其同源物以及与其它物种同源序列进行了序列同源性比对和系统进化分析,旨在为进一步开展中华绒螯蟹功能基因组学研究提供依据,并为发现和定义任意基因或基因产物的同源成员打下基础。     

牛ANGPTL1基因的电子克隆与序列分析

以牛的ANGPTL1基因为研究对象,利用生物信息学方法,对牛的ANGPTL1基因进行了电子克隆和序列分析,并对推导出的ANGPTL1蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛的ANGPTL1基因序列长为2576 bp,该基因的编码序列长为1 476 bp,编码492个氨基酸,编码序列的两翼有135 bp的5’非编码区和785 bp的3’非编码区。DNA序列的G+C百分含量为44.31%,A+T百分含量为55.69%。该基因的核苷酸序列与人、黑猩猩、鼠和狗ANGPTL1基因的cDNA序列的相似性分别为91%、90%、82%和93%。在氨基酸序列上与人、黑猩猩、鼠和狗的相似性分别为95%、95%、92%和95%。用氨基酸序列构建的进化树显示,在人、牛、黑猩猩、狗、褐鼠、原鸡几种动物中,牛与狗的亲缘关系最近。     

猪生长激素基因研究进展

生长激素基因是一个重要的功能基因。本文主要就猪生长激素基因的序列分析、多态性位点及各多态性位点同生产性能的关系进行了阐述。     

基于BWT的DNA序列数值刻画及其应用

生物序列的数值刻画在对生物学数据进行分析方面有着重要的作用。通过对DNA序列的BWT序列进行分块处理,给出了DNA序列的一种7维向量表示,利用correlation函数计算序列之间的相似性,并把这种方法应用到15个物种的β球蛋白基因及12个汉坦病毒的相似性分析中。     

干旱胁迫对不同玉米品种叶片膜透性的影响

对不同玉米品种进行干旱处理,对叶片含水量、土壤含水量、叶片质膜透性进行测定．结果表明,土壤干旱胁迫条件下,玉米叶片含水量下降,叶片质膜透性上升;随着胁迫时间的延长,即土壤含水量的降低,叶片质膜透性不断的增加,其中新实1号的变化幅度最小,而叶片含水量则随之不断的减少,与叶片质膜透性的结果相符．这说明幼苗期新实1号的抗旱能力较强．因此,对叶片含水量、土壤含水量、叶片质膜透性的测定可以作为幼苗期抗旱鉴定的重要指标．     

干旱胁迫对不同玉米品种幼苗叶片SPDA值影响的研究

以玉米品种天紫23号、黄甜脆1号、白甜糯1号、早鲜黄甜脆幼苗为试验材料,研究了干旱胁迫、干旱胁迫时间和解除干旱胁迫恢复生长后叶片中叶绿素SPDA值的变化。结果表明:利用干旱胁迫处理四个品种玉米幼苗,其叶片中的叶绿素SPDA值均随胁迫时间的增加而下降;解除干旱胁迫恢复正常灌溉7天后,叶绿素SPDA值均上升逐渐恢复接近正常水平,但依然低于对照组。不同玉米品种在干旱胁迫时叶绿素SPDA值的变化有一定的差异,白甜糯1号叶绿素SPDA值相较于其他三个品种在干旱胁迫时下降得最多,恢复的程度也最差。     

干旱胁迫下不同作物品种叶片含水量的测定

通过干旱胁迫处理测定了玉米、小麦及三叶草的土壤含水量、叶片含水量和叶片细胞膜透性．实验表明,当植物受到干旱胁迫时,质膜受到不同程度的破坏进而膜透性（电导率）增大;叶片含水量随土壤含水量下降而降低;在干旱胁迫下,越耐旱的植物,植物含水量下降越平缓,保水能力越强;不同作物保水能力从大到小依次为三叶草、玉米、小麦．     

Overexpression of the phytochrome B gene from Arabidopsis thaliana increases plant growth and yield of cotton (Gossypium hirsutum)

The phytochrome B (PHYB) gene of Arabidopsis thaliana was introduced into cotton through Agrobacterium tumefaciens. Integration and expression of PHYB gene in cotton plants were confirmed by molecular evidence. Messenger RNA (mRNA) expression in one of the transgenic lines, QCC11, was much higher than those of control and other transgenic lines. Transgenic cotton plants showed more than a two-fold increase in photosynthetic rate and more than a four-fold increase in transpiration rate and stomatal conductance. The increase in photosynthetic rate led to a 46% increase in relative growth rate and an 18% increase in net assimilation rate. Data recorded up to two generations, both in the greenhouse and in the field, revealed that overexpression of Arabidopsis thaliana PHYB gene in transgenic cotton plants resulted in an increase in the production of cotton by improving the cotton plant growth, with 35% more yield. Moreover, the presence of the Arabidopsis thaliana PHYB gene caused pleiotropic effects like semi-dwarfism, decrease in apical dominance, and increase in boll size.     

农杆菌介导的TaLEA1 基因对拟南芥的遗传转化

将含有TaLEA1基因的表达载体pBI121-TaLEA1经根癌农杆菌介导,利用花粉管通道法转入拟南芥,得T0代种子,抗Kan筛选得转基因植株.经PCR检测,初步证明外源TaLEA1基因已整合到拟南芥基因组中.     

Seed priming with chitosan improves maize germination and seedling growth in relation to physiological changes under low temperature stress

Low temperature stress during germination and early seedling growth is an important constraint of global production of maize. The effects of seed priming with 0.25%, 0.50%, and 0.75% (w/v) chitosan solutions at 15 ℃ on the growth and physiological changes were investigated using two maize (Zea mays L.) inbred lines, HuangC (chilling-tolerant) and Mo17 (chilling-sensitive). While seed priming with chitosan had no significant effect on germination percentage under low temperature stress, it enhanced germination index, reduced the mean germination time (MGT), and increased shoot height, root length, and shoot and root dry weights in both maize lines. The decline of malondialdehyde (MDA) content and relative permeability of the plasma membrane and the increase of the concentrations of soluble sugars and proline, peroxidase (POD) activity, and catalase (CAT) activity were detected both in the chilling-sensitive and chilling-tolerant maize seedlings after priming with the three concentrations of chitosan. HuangC was less sensitive to responding to different concentrations of chitosan. Priming with 0.50% chitosan for about 60～64 h seemed to have the best effects. Thus, it suggests that seed priming with chitosan may improve the speed of germination of maize seed and benefit for seedling growth under low temperature stress.     

拟南芥抗病基因克隆研究现状

对抗病基因的种类、特性、克隆策略及其应用前景进行论述．探讨拟南芥抗病基因克隆的研究现状、图位克隆技术和转座子标签技术的原理及在拟南芥抗病基因克隆中的应用．抗病基因的克隆不但有利于深入研究植物与病原物的分子互作机理，而且为植物重要病害的防治提供有效的措施．     

植物生长调节剂对拟南芥菜生长发育的影响

植物生长调节剂对植物的生长发育有重要影响。本实验以模式植物拟南芥菜为材料,调查了外加生长素类和细胞分裂素类生长调节剂对拟南芥菜子叶、下胚轴和根生长的影响,使人们对植物生长调节剂在植物发育调控中的作用,以及在器官发育中的功能和作用的分子机理有更进一步的认识。