三种全血基因组DNA提取方法的比较

目的 :比较三种不同的DNA提取方法提取人全血基因组DNA对DNA提取效率、纯度以及PCR扩增的效果影响。方法 :分别应用中山医科大学达安公司DNA提取液 ,珠海黑马医学仪器有限公司DNA提取液 ,胍盐酸法三种不同的方法提取人全血基因组DNA。结果 :三种方法提取的DNA纯度平均分别为 :1.4 8,1.5 1,1.5 6 ,各组间差异无显著性。 2 0 0 μL全血中所提取DNA总量平均分别为 1.6 μg ,2 .3μg ,4 .1μg。用 0 .8%琼脂糖凝胶电泳鉴定胍盐酸法制备的DNA效果较其它两种方法好 ,PCR扩增效果差异不明显。结论 :胍盐酸法提取的DNA总量明显高于其它两种方法 ,提取效率高 ,为三种全血基因组DNA提取方法中之首选。     

不同DNA提取方法对肺癌血浆循环DNA抽提效果比较

目的:研究不同DNA抽提方法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。方法:选取68例肺癌患者为研究对象,比较Gen Mag Bio磁珠法、San Prep柱式PCR产物纯化试剂盒方法、苯酚-氯仿法对肺癌血浆循环DNA的提取效果。结果:几种方法中,磁珠法具有最高的提取效率和最低的CV值。结论:磁珠法对肺癌血浆循环DNA具有最好的抽提效果,适合于对小片段DNA的提取。     

5种哺乳动物组织DNA提取比较研究

以大仓鼠、家兔、刺猬等动物新鲜冷冻样品为实验材料,比较了从不同动物的5种样品组织中提取的全基因组DNA.结果表明:从以上三种动物不同样品组织中均能提取到比较纯净完整的基因组DNA,而且从动物肝脏中提取的全基因组DNA纯度和浓度都优于其它材料,能够更好的适用于继后的分子生物学试验研究.     

盐土中微生物总DNA的提取方法的探究

文章初步探讨了用不同DNA提取方法,对盐土中微生物总DNA的提取效果.实验结果表明,由于盐土中微生物数量较少,溶菌酶-SDS-冻融裂解法、溶菌酶-SDS-蛋白酶K-冻融裂解法均无法提取到盐土中微生物的总DNA;变性剂-SDS-高盐法和试剂盒提取法能获得DNA,但效果不佳;只有用变性剂-SDS-高盐修改法能快速、有效地提取盐土中微生物的基因组DNA.     

DNA的粗提取与鉴定实验的改进

DNA的粗提取与鉴定实验是人教版全日制普通高级中学《生物》必修二中要求学生掌握并完成的一个重要实验。实验原理指出:DNA分子在不同浓度的氯化钠溶液中的溶解度不同,当氯化钠的物质的量浓度为0.14mol/L时,DNA的溶解度最低,DNA析出;利用DNA分子不溶于冷酒精,而细胞中的杂质可溶于冷酒精的性质差别提取含杂质较少的DNA;最后利用DNA遇二苯胺(沸水浴)显蓝色,鉴定DNA。     

油松种子胚乳DNA的提取

运用改良的CTAB法,从油松萌发种子的胚乳中提取到较高质量的DNA。为从松杉类植物的种子中提取基因组DNA或从胚乳中提取单倍体DNA提供了经济、快速和可靠的实验方法,也为进一步的分子生物学分析包括PCR、RAPD、SSR、AFLP和RFLP等研究提供高质量的DNA摸板。     

质粒DNA提取方法的比较

以含有原核表达载体pet21a和真核表达载体EGFP的DH5α系列菌株为材料,分别采用碱裂解法和试剂盒提取法提取质粒DNA,通过凝胶电泳分析,对两种质粒提取方法的各自特点进行了比较与分析。认为碱裂解法和试剂盒提取法提取质粒DNA均可进行后续试验,但试剂盒提取法具有省时、简洁、高效的优势。同时根据在实验过程中所遇到的问题,说明了在进行质粒DNA提取过程中应当注意的问题。     

简便快捷提取大蒜总DNA的方法

目的:探讨简便快速而高效的提取大蒜总DNA的方法。方法:采用十六烷基三甲基溴化胺(CTAB)法、简化CTAB法、改良十二烷基硫酸钠(SDS)法分别以大蒜的根、茎、叶为材料提取细胞总DNA,并进行紫外分光检测和琼脂糖凝胶电泳分析。结果:三种方法的提取率和纯度明显不同:CTAB法>SDS法>简化CTAB法,三种材料组织中以茎的提取效果最佳。结论:采用CTAB法或SDS法从茎中提取大蒜总DNA可获得产率与纯度符合要求的DNA样品。     

改进的CTAB提取植物DNA方法

根据DNA分子的物理化学特性及植物材料的特点,改进了传统利用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取植物叶片中DNA的操作方法,采用新鲜配制的CTAB溶液、液氮快速研磨植物材料、添加适量还原剂和适量吸取提取液中核酸层等措施,减少了提取过程中提取液的褐变和杂质对DNA产质量的影响.同时,列出了提取过程中各操作步骤的注意事项和关键点.该方法操作简便、快捷,提取出的DNA质量较好,能很好地用于DNA的分子遗传特性分析,可作为教学和研究工作中植物DNA的提取方法.     

黑糯玉米基因组DNA的提取方法

本研究以黑糯玉米幼叶、种子和盾片为材料分别采用CTAB法、SDS法和碱煮法提取黑糯玉米基因组DNA,并通过直接观察DNA形态、琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计法比较利用不同组织材料和方法提取的DNA质量.结果表明,用CTAB法提取的黑糯玉米幼苗的基因组DNA质量较好、纯度较高,能够满足后续分子生物学实验的要求.     

珙桐干种子总DNA提取方法的比较

以珙桐干种子为材料,采用简易CTAB法、SDS法、高盐沉淀法与高盐低pH值法分别对珙桐干种子进行了总DNA提取效果的比较分析。结果表明,四种方法均能有效地提取较高质量的珙桐种子DNA,其中SDS法效果最好,获得的DNA纯度最高,产量最大,CTAB法次之,高盐沉淀与高盐低pH值法获得DNA质量相对较低,低于其它两种方法。获得最佳的DNA提取方法,可为PCR扩增,引物设计,筛选珙桐种子中的相关基因奠定基础。     

Role of deubiquitinating enzymes in DNA double-strand break repair

DNA is the hereditary material in humans and almost all other organisms. It is essential for maintaining accurate transmission of genetic information. In the life cycle, DNA replication, cell division, or genome damage, including that caused by endogenous and exogenous agents, may cause DNA aberrations. Of all forms of DNA damage, DNA double-strand breaks(DSBs) are the most serious. If the repair function is defective, DNA damage may cause gene mutation, genome instability, and cell chromosome loss, which in turn can even lead to tumorigenesis. DNA damage can be repaired through multiple mechanisms. Homologous recombination(HR) and non-homologous end joining(NHEJ) are the two main repair mechanisms for DNA DSBs. Increasing amounts of evidence reveal that protein modifications play an essential role in DNA damage repair.Protein deubiquitination is a vital post-translational modification which removes ubiquitin molecules or polyubiquitinated chains from substrates in order to reverse the ubiquitination reaction. This review discusses the role of deubiquitinating enzymes(DUBs) in repairing DNA DSBs. Exploring the molecular mechanisms of DUB regulation in DSB repair will provide new insights to combat human diseases and develop novel therapeutic approaches.     

几种药用植物基因组DNA提取方法研究

采用改良2×CTAB法和改良SDS法提取富含多糖和次生代谢物质的几种药用植物不同器官基因组DNA,并用紫外分光光度计分析,凝胶电泳和PCR扩增进行鉴定。结果表明:改良2×CTAB法和改良SDS法均能有效去除不同药用植物材料中的蛋白质、多糖、酚类及其他次生代谢物质,获得较高质量基因组DNA。但与改良SDS法相比,改良2×CTAB法提取的基因组DNA质量更好。     

龙竹和麻竹FT同源序列的扩增与序列分析

根据拟南芥Flowering Locus T（FT）基因和水稻Heading date 3a（Hd3a）基因的序列设计引物,通过PCR扩增的方法分别从麻竹和龙竹基因组DNA中各得到长为334bp的DNA片段.经BLAST检索、基因结构分析和编码蛋白功能域预测等分析,初步确定所得DNA片段可能是麻竹和龙竹中的FT同源基因的部分序列.     

简并PCR法克隆L.starkeyi苹果酸酶基因

根据已报道的酵母苹果酸酶基因序列,利用CodeHop（Consensus Degenerate Hybrid Oligonucleotide Primers）软件设计两对简并引物,以斯达油脂酵母（L.starkeyi CICC 1809）总DNA为模板做简并PCR,得到2个基因片段（ME1,ME2）.对这2个目的片段进行测序,将结果翻译成氨基酸序列,blastp结果显示其中ME2片段为油脂酵母未报道苹果酸酶基因的序列（Gene Bank登录号GU348991）,并对巢式PCR方法检验简并PCR结果的有效性进行了评估.     

3种土壤微生物基因组DNA提取方法的比较

该实验通过SDS高盐法（常规法）、SDS高盐法（改良法）和Soil gDNA Kit法提取土壤微生物基因组DNA,用DNA Nanophotometer仪测定样本DNA的纯度和浓度,以确定最佳提取方法.结果表明,用SDS高盐法（常规法）、SDS高盐法（改良法）和Soil gDNA Kit法和土壤微生物基因组DNA的浓度分别为41.45 ng/μl、96.48 ng/μl和58.40 ng/μl,纯度（OD260/OD280）分别1.45、1.57和1.82.由结果可知,改良法提取DNA的浓度最高,而Soil gDNA Kit法的纯度最高,但其成本较高,因此,SDS高盐法（改良法）是节省成本且适合提取大批量土壤微生物基因组DNA的方法,今后在提取DNA过程中进一步优化,以提高其纯度.     

氧氟沙星与小牛胸腺DNA相互作用研究

用荧光光谱法研究水溶液中氧氟沙星与小牛胸腺DNA的结合作用，测定了两个不同温度下氧氟沙星与DNA的结合常数KA和结合位点数n，探讨了其荧光猝灭机制；根据热力学参数确定了氧氟沙星与DNA之间的作用力以静电作用为主；进一步考察了二种金属离子及盐效应对该结合反应的影响．     

Whole genome amplification in preimplantation genetic diagnosis

Preimplantation genetic diagnosis (PGD) refers to a procedure for genetically analyzing embryos prior to implantation, improving the chance of conception for patients at high risk of transmitting specific inherited disorders. This method has been widely used for a large number of genetic disorders since the first successful application in the early 1990s. Polymerase chain reaction (PCR) and fluorescent in situ hybridization (FISH) are the two main methods in PGD, but there are some inevitable shortcomings limiting the scope of genetic diagnosis. Fortunately, different whole genome amplification (WGA) techniques have been developed to overcome these problems. Sufficient DNA can be amplified and multiple tasks which need abundant DNA can be performed. Moreover, WGA products can be analyzed as a template for multi-loci and multi-gene during the subsequent DNA analysis. In this review, we will focus on the currently available WGA techniques and their applications, as well as the new technical trends from WGA products.     

几种海洋贝类基因组DNA的提取

海洋贝类中多糖和蛋白含量很高，不易获得高纯度、完整的基因组DNA，且海洋贝类很易死亡腐败，将引起DNA的降解。而获得高纯度的完整DNA是进行DNA指纹图谱、RAPD分析和DNA测序等技术操作的前提。SDS方法可有效地去除多糖、蛋白、RNA、酚等杂质。且可从无水乙醇固定的标本中提取高质量DNA。     

低温敏感不育水稻育性敏感时期的DNA含量

常规品种特青、叶片以及N-10S的叶片,30℃和23℃条件下的DNA含量经统计学检验表明,没有显著差异;但特青的幼穗中,30℃条件下的DNA含量均低于可育条件下的含量,其中花粉母细胞减数分裂期统计学检验表明不育条件下DNA含量显著低于可育条件下的DNA含量．