新城疫病毒Mukteswar疫苗株全基因组序列分析

通过PCI％的方法对一市售的新城疫Muktesw＆r疫苗株的全长进行分段克隆,通过测序获得全长序列,该病毒全长为15186bp,将全长序列提交到NCBIGenBank中获得序列登录号为JF950509．将其与之前已提交到NOBI GenBank中的Mukteswar株全长序列（登录号为EF201805）比较,核苷酸序列有59处变异,各个蛋白的氨基酸序列总共有16处变异。序列的测定为进一步对Mukteswar抹的研究提供一个良好的平台。     

大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析

测定了大豆花叶病毒杭州分离物（SMV－HZ）的基因组全序列。该病毒基因组全长9588个核苷酸，3‘末端具poly(A)尾，包含单一开读框，编码一个350.07kD的多聚蛋白。基因组全序列与美国SMV G2、G7、N株系及我国黄淮5号株系（Y5）的核苷酸同一性分别为93％、93％、94％和96％。多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10成熟蛋白。SMV－YZ与G2、G7、N的不同成熟蛋白间的氨基酸同一性为89％－100％；SMV－HZ与Y5的不同成熟蛋白间氨基酸同一性则较高，达97％－100％。多重分析显示了SMV－HZ与G2、G7、N、Y5之间的序旬差异，G2、G7的P1蛋白氨基酸序列明显不同于其他株系，对SMV－HZ与我国其他株系。对SMV－HZ与我国其他分离物也进行了序列比较，对CP蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明SMV－HZ与BJ分离物的亲缘性最高。     

朱鹗全基因组序列图谱绘制完成

西安交通大学和华大基因召开新闻发布会,宣布“朱鹃全基因组序列图谱绘制完成”。这是世界上完成的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱,对于挽救保护朱鹃和注释生命现象具有重要科学价值和战略意义。     

斜纹夜蛾核型多角体病毒日本株(C3)ie0基因的序列分析和表达

从斜纹夜蛾核多角体病毒（Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV）日本株（C3）基因组中克隆了ie0基因。核苷酸序列分析表明,该克隆片断涵盖了864 bp的读码框及5′端启动子区475 bp和3′端终止区90 bp的序列。氨基酸序列分析显示,在SpltMNPV IE0蛋白N-端23～47位以及111～126位富含酸性氨基酸和疏水性氨基酸残基,C′端第225～271位具有典型的CX2CX14CCX4CX2CX15CX2C双锌指基序,该结构在所比较的9个昆虫杆状病毒IE0蛋白中是十分保守的。联配分析表明,SpltMNPV日本株（C3）的核苷酸序列和氨基酸序列与其他9种核多角体病毒的同源性有较大差异。以ie0基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树将家蚕核多角体病毒（Bombyx mori Nu-cleopolyhedrovirus,BmNPV）与苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒（Autographa californica multicapcid nucle-opolyhedrovirus,AcMNPV）归到同一分枝,这与以p10、gp37和egt基因为基础绘制的杆状病毒分子进化树结果一致。并进行了大肠杆菌表达和Western Blotting分析。     

对虾白斑综合征病毒VP19基因的克隆和序列分析

以东海宁波海区收集的甲壳内侧出现白斑为特征的发病中国对虾为材料，从中分离出一株病毒(ZJ2001)，经电镜和动物试验鉴定为对虾白斑综合征病毒；用煮沸法一步获得病毒基因组DNA，以此基因组为模板，利用PCR技术，扩增病毒囊膜蛋白VPl9的基因，将扩增得到的基因克隆并测序．用DNATools软件对测得的序列分析表明：VPl9基因序列与GeneBank中的比较(AF309029)，其核苷酸同源性为99％，氨基酸同源性为98％．     

我国科学家绘就石斑鱼全基因组序列图谱

近日,中山大学联手深圳华大基因研究院开展的“石斑鱼全基因组序列图谱”绘制宣布完成,这是我国完成的第三个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,也是世界上首个鲈形目（鱼旨）科石斑鱼类基因组序列图谱。     

我国科学家完成大黄鱼全基因组序列图谱绘制

浙江省科技厅、上海市科委近期在浙江省舟山市共同宣布,来自浙江海洋学院、复旦大学、上海交通大学等院所的科学家已绘制完成大黄鱼的全基因组测序、组装和序列图谱。     

首株H7N9病毒疫苗种子株中国造

不久前,我国科学家首次宣布,成功研制出人感染H7N9禽流感病毒疫苗株。这是由浙大一院与香港大学联合研发的针对H7N9禽流感病毒的疫苗"种子株"。该成果打破和改变了中国流感疫苗株需由外国提供的历史,为及时应对新型流感疫情提供了有力的技术支撑。首次摆脱外国疫苗依赖症今年3月,我国首先发现一种新的H7N9禽流感病毒可     

甜橙全基因组序列图谱绘制完成

记者近日从华中农业大学获悉,该校组织园艺学、基因组学、生物信息学等学科的科研人员,经过一年多的攻关,完成了甜橙基因组拼接与注释,获得了较高质量的甜橙基因组。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。     

“双峰驼基因组计划”取得重大突破——世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和破译工作完成

骆驼长期生活在干旱、寒冷的荒漠地区,经过长期的自然选择,具有许多其它动物所不具备的生理特性。比如极强的耐饥渴能力、对植被具有超强的适应力以及特殊的免疫系统。     

高通量序列分析人类乳腺癌和正常细胞的串联3’UTRs的差分全基因组剖析

由可变聚腺苷酸化产生的串联3’UTRs在基因表达中发挥重要的作用,可在细胞内影响mRNA稳定性、翻译和移位。多项研究已发现在多种生理状态下出现可变聚腺苷酸化位点切换。然而．这些研究仅聚焦于两个已知可变聚腺苷酸化位点和几个候选基因。在这里．我们报道了一种利用最新的第二代序列分析技术在全基因组范围内研究可变聚腺苷酸化位点,     

非典型性新城疫的预防和治疗

近年来,新城疫发生了新的变化,典型的新城疫已不多见,低发病率、低死亡率、高淘汰率、散发的非典型新城疫却呈上升趋势,是危害我国养鸡业的重要疫病之一,严重影响了广大养鸡户的经济效益。因此,为了更好地认识这一疾病,现将非典型新城疫的特点。病因及防治措施等作一探讨。     

世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成

内蒙古科技厅今天对外宣布,由内蒙古农业大学、内蒙古民族大学和深圳华大基因研究院合作开展的第一个蒙古族人的：奎基因组序列图谱绘制工作已经完成。科学家们将此周谱誉为“天骄一号”,这标志着我国的人类学、民族学、人类遗传学及医学健康研究进入基因组水平。     

HIV全序列中重复序列的研究

文章统计了HIV全序列中所有不同长度的重复序列,并分析了其重复序列的AT/GC含量。研究发现:(1)重复序列出现的次数n与出现次数为n的重复序列总数N(n)之间存在power-law关系,这表明在HIV全序列中,只有少数重复序列会出现很多次,大部分重复序列只会出现少数几次;(2)HIV全序列中的AT含量高于GC含量,并且对于不同长度K的重复序列,100%AT含量的重复序列总是多于100%GC含量的重复序列,最长的100%AT含量的重复序列比100%GC含量的重复序列要长,这表明HIV全序列在进化过程中可能经受了更多的AT压力。通过对HIV全序列中的重复序列的分析,进一步讨论HIV进化历程及特点。     

北京基因组所合作完成鲤鱼基因组序列图谱绘制

<正>中科院北京基因组所于军研究组与其合作者完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,这也是国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究团队完成了雌核发育鲤鱼的基因组深度测序、精细图谱绘制和基因组注释。在遗传图谱信息的基础上,科研人员利用基因组组装结果,将鲤鱼基因组定位到染色体上,得到了较完整的鲤鱼精细图谱。其基因组由16.9亿碱基组成,含有52610个功     

抗猪瘟病毒基因克隆猪问世

近期,三头“带有抗猪瘟病毒基因的克隆猪”先后顺利在吉林大学农学部诞生,体重分别为1050克、1100克和550克。这种“带有抗猪瘟病毒基囚的克隆猪”是由吉林大学农学部畜牧兽医学院赖良学教授为首席专家和军事医学科学院军事兽医研究所共同组成的课题组研究出来的,属世界首例。     

水生所揭示大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化

中科院水生生物所张奇亚、桂建芳研究员与其合作者就大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化开展研究,在新分离鉴定导致大鲵致死性出血病病原——大鲵虹彩病毒。     

杭州地区玉米病毒病dsRNA序列分析

从杭州地区采集花叶症状的玉米,抽提双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA).用单引物扩增方法(Single primer amplification technique,SPAT)对dsRNA进行RT-PCR扩增,获得了三条dsRNA片段的cDNA克隆并测定全序列.核苷酸水平上,三条片段(长度分...     

禽流感病毒与人类禽流感

禽流感病毒属甲型流感病毒，主要引起禽类流感。1997年首次证明禽 流感病毒(A/Ho ng Kong/156/97)H5N1亚型可感染人，其后在我国内地、香港及荷兰等地又至少发生了5起禽 流感病毒的人间感染。目前，禽流感病毒正在我国及亚洲部分地区肆虐，已造成很大的经济 损失和社会影响，禽流感已成为严重危害人类健康的新发传染病。本文拟就禽流感病毒的基 因特征、致病性及特异检测等方面的进展做一综述。     

掀开土壤生物“暗物质”——土壤病毒的神秘面纱

病毒是地球上数量最多的生命体,在调控寄主群落结构、促进元素生物地球化学循环和生物进化中起到重要的作用。病毒被喻为生物"暗物质"。近年来,海洋环境下病毒生态学研究进展迅速;与此相反,在陆地生态系统,特别是土壤环境中病毒研究进展缓慢。文章从生态学角度对目前有关土壤病毒丰度、形态多样性、基因多样性、研究方法和生态功能等进行简要的阐述,目的在于呼吁从事土壤微生物和土壤生态学研究的工作者重视对土壤病毒的研究工作,从而促进土壤病毒生态学科的发展。