DNA序列判读中的几个问题

通过对DNA序列判读过程中几个容易被忽视的问题的分析，提出了解决问题的方法以及进行序列正确判读的步骤。     

关于DNA分子中碱基的数量计算

一、DNA分子中碱基的数量关系 核酸所含的碱基有A、T、C、G、U五种。DNA分子与 RNA分子的区别在于 DNA分子中含有碱基T.而不含碱基U,以此可以判别一个未知核酸片段是属于DNA还是RNA。双链DNA分子与单链DNA分子的区别在于双链DNA分子中碱基是互补配对的,存在A=T、G=C的数量关系。如果一个DNA分子中A≠T,G≠C,则说明该DNA分子单链。单链DNA分子较少,仅存在于某些噬菌体(M14)中。对双链DNA分子来说,存在以下关系。     

神经网络模型对DNA序列分类问题的应用

从一个具体的DNA序列的分类问题出发,介绍应用感知器、BP网络和学习向量量子化神经网络模型解决识别问题的理论和算法.并且给出用MATLAB软件中的神经网络工具箱解决DNA序列分类这一具体问题的方法.     

基因诊断技术与DNA解旋酶有关吗

2005年全国理综卷生物选择题第3题是这样的：细胞贫血症的病因是血红蛋白基因碱基序列发生了变化。检测这种碱基序列发生了变化必须使用的酶是（）     

DNA复制的忠实性

DNA复制的高度忠实性，保证了生物遗传的稳定性，是生物体的一种很重要的进化力，本讨论了维持DNA复制高民实性的四个方面：（1）DNA聚合酶的选择作用；（2）DNA聚合酶的校正作用；（3）RNA引物的合成与切除是提高DNA复制准确性的重要因素；（4）DNA复制后错配碱基的修正，同时也指出了影响DNA复制忠实性的其它因素。     

DNA序列的分类模型

应用模糊分类的思想，利用多元统计方法完成对DNA序列的分类界定。     

双链DNA分子中碱基含量的规律性变化及其应用

在高中生物课的教学中,经常可以遇到一些有关双链DNA分子中碱基含量的计算题.要求根据某些碱基的含量,求出其它碱基的含量.如果总结出双链DNA分子中碱基含量的变化规律,就能快速而准确地计算出结果.双链DNA分子结构的最大特点就是遵循碱基互补配对原则,由此而产生四种碱基的基本关系:A=T,G≡C.由此基本关系可推理出以下几种变化:     

利用DNA分子简图解碱基类习题

在高中生物“遗传的物质基础”一节教学中，往往涉及有关碱基含量的计算问题，解这类习题有不少方法，下面笔者介绍一种利用DNA分子简图解碱基类习题的方法，供同行参考。     

RBF网络在DNA序列分类中的应用

针对RBF网络易于陷入局部最小值和网络训练时间过长的问题,引入免疫多克隆遗传算子对RBF网络的权值进行优化。仿真结果表明,采用优化后的网络模型具有更高的分类效率和准确率。     

自由基引起DNA氧化性损伤的化学本质

自由基通过各种反应途径对DNA造成多种损伤,如碱基修饰糖等,损伤产生的各类产物能与DNA进一步反应,本讨论自由基经不同途径对DNA造成损伤和相关的化学本质。     

基于BWT的DNA序列数值刻画及其应用

生物序列的数值刻画在对生物学数据进行分析方面有着重要的作用。通过对DNA序列的BWT序列进行分块处理,给出了DNA序列的一种7维向量表示,利用correlation函数计算序列之间的相似性,并把这种方法应用到15个物种的β球蛋白基因及12个汉坦病毒的相似性分析中。     

Regularities in the E. coli promoters composition in connection with the DNA strands interaction and promoter activity

INTRODUCTION It is well known that the physical properties, namely DNA strands interaction in promoter are connected with their activity. As it was established the two promoter regions ?35 and ?10 are the most important for the promoter functioning, all bases in the ?35 (TTGACA) and ?10 (TATAAT) hexamers were highly conserved (Harley and Reynolds, 1987; Hawley and McClure, 1983). The functional impor- tance of these sequences was proved in many inves- tigations (Record et al., 199…     

几种海洋贝类基因组DNA的提取

海洋贝类中多糖和蛋白含量很高，不易获得高纯度、完整的基因组DNA，且海洋贝类很易死亡腐败，将引起DNA的降解。而获得高纯度的完整DNA是进行DNA指纹图谱、RAPD分析和DNA测序等技术操作的前提。SDS方法可有效地去除多糖、蛋白、RNA、酚等杂质。且可从无水乙醇固定的标本中提取高质量DNA。     

蝴蝶不同部位提取DNA效果的研究

提取高质量的蝴蝶基因组是蝶类分子系统学研究的重要步骤。本文通过对蝴蝶干标本不同部位DNA提取效果的比较,找出了最适合蝴蝶干标本基因组DNA提取的部位,同时用PCR扩增的方法进行了检验,力争为开展蝴蝶的分子生物学研究奠定基础。结果表明,足部的提取效果最佳。     

针对脱氧核糖核酸电分析化学研究

脱氧核糖核酸(DNA)是生物遗传信息的载体,通过对DNA进行电分析化学研究,能够加深对DNA特性的了解,可以为解决DNA损伤、临床诊断等提供依据。本文就DNA电分析化学研究中,DNA碱基电活性以及金属离子的相互作用做出陈述。     

Statistical properties of nucleotide clusters in DNA sequences

Using the complete genome of Plasmodiumfalciparum 3D7 which has 14 chromosomes as an example, we have examined the distribution functions for the amount of C or G and A or T consecutively and non-overlapping blocks of m bases in this system. The function P(S) about the number of the consecutive C-G or A-T content cluster conforms to the relation P(S)oce-as;values of the scaling exponent αCG are much larger than αAT; and αAT of 14 chromosomes are hardly changed, whereas αCG of 14chromosomes have a number of fluctuations. We found maximum value of A-T cluster size is much larger than C-G, which implies the existence of large A-T cluster. Our study of the width function ξ(m) of cluster C-G content showed that follows good power law ξ(m)ocm-γ. The average γ for 14 chromosomes is 0.931. These investigations provide some insight into the nucleotide clusters of DNA sequences, and help us understand other properties of DNA sequences.