番茄LeNHX2基因的生物信息学分析

应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX2蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性,亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析,结果表明此蛋白为疏水性不稳定蛋白,包含一个氨氯吡嗪咪结合位点FFFLFLLPPI区域,相对分子量为58．6kD,等电点为5．50,可能存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,同源性分析发现番茄LeNHX2和其它植物的Na佃饭转运蛋白同源性较低,但LeNHX2具有一个Na^＋／H^＋交换结构域和氨氯吡嗪咪结合位点,由此可推断LeNHX2是一个耐盐相关基因,在提高植物的耐盐能力方面可能有重要作用。     

家蚕中一未知基因的生物信息学分析

对家蚕中一未知基因进行生物信息学分析,结果显示:该基因开放阅读框大小为858 bp,编码285个氨基酸,预测分子量为31.1kD,等电点为4.75;该基因编码蛋白含有TPR(Tet ratrico Peptide Repeat)结构域,具有个蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶11磷酸化位点、肉豆蔻酰基化位点,糖基化位点及cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化功能位点.     

药用植物中鲨烯环氧酶的生物信息学分析

从系统进化角度对药用植物中三萜皂苷合成通路中的关键酶——鲨烯环氧酶(Squalene epoxidase,SE)进行生物信息学分析。通过检索已发表的相关文献,从NCBI数据库中下载文献中实验验证的SE基因序列,然后使用生物信息分析软件对所搜集序列进行同源性分析,并构建系统进化树。结果表明,刺五加与拟南芥、丹参的同源性较高,刺五加actin1,2,3SE(拟南芥)和刺五加actin SE(丹参)亲缘关系较近,而枇杷SE(拟南芥)的亲缘关系较远。     

药物生物信息学的多媒体教学

药物生物信息学作为一门发展迅速的交叉学科，也是药学课程建设的一门日益重要的课程。本文论述如何结合药物生物信息学学科的特点进行多媒体教学，包括在线网络数据库的介绍，生物大分子三维结构的演示等，以优化该课程的教学模式。     

PPⅡ螺旋结构探微

PPII螺旋结构是一种重要的蛋白质二级结构类型。本文首先从2303条高质量的多肽链中提取出PPII螺旋结构形成结构数据集,然后对结构数据集进行了统计分析。统计表明:PPII螺旋结构是种稀有的蛋白质二级结构类型,约占数据集的2.1%,但是PPII螺旋结构经常出现在多肽链中,大约50%的蛋白链中至少包含一条PPII螺旋结构;PPII螺旋结构比较短,超过90%的PPII螺旋结构只有4个或5个氨基酸残基;PPII螺旋结构的长度分布与310螺旋很相似;PPII螺旋结构最偏爱Pro残基,但不是每条PPII螺旋结构都必须包含Pro残基,不过对于长度较长的PPII螺旋结构,一般至少包含一个Pro残基;另外,残基Gln,Thr,Ser和Leu在PPII螺旋结构中也较常出现;极性残基不常出现在PPII螺旋结构中;残基Gly最不倾向于PPII螺旋结构。     

师范院校生物信息学教学的现状分析

生物信息学是生命科学在信息时代发展的核心内容,将在"后基因组"时代发挥极其重要的作用。本文结合实际工作,从教学内容、师资力量、教学模式和方法、跨学科合作、教学实践实施情况等方面对师范院校生物信息学课程教学中的现状进行了分析。     

生物信息学的现状与前景

生物信息学是生物科学中的一门新兴的交叉学科，它运用现代信息技术．在对DNA测序、功能基因组等大量的数据进行分析的基础上．进行蛋白质结构的模拟与顶测．并用于药物设计．将对生命科学的发展起巨大的推动作用.     

杉木CAD基因生物信息学分析

杉木CAD片段为信息探针,利用序列拼接方法获得了738bp的cDNA序列.利用MEGA4.0软件对不同进化层次的代表植物相应CAD基因进行比对,构建系统进化树.利用生物信息学方法分析了杉木CAD基因的结构与功能,其中包括核苷酸序列的组成、ORF识别、CpG岛、限制性酶切位点分析、卷曲螺旋、亲水性、糖基位点及二级结构.结果表明:杉木与铁杉的CAD基因具有99.00%的同源性;该序列在88～737bp片段上有一个开放性阅读框,该序列编码的是一个碱性蛋白,亲水性较强,疏水性较弱,信号肽序列为第1位～第11位,二级结构以α-螺旋(27.50%)与不规则盘绕(41.50%)为主,延伸链(22.50%)也是该蛋白的重要结构元件,β转角区域仅为8.50%.     

E-Learning在高校生物信息学教学实践中的初步建设和应用

单纯的网络化学习和单纯的传统课堂学习都无法很好的达到教学目标。结合生物信息学学科特点,我们在高校精品课建设过程中积极为学生构建E-Learning的学习环境,并与课堂教学实践有机结合,形成一种现代化的立体教学方式,既兼顾网络化学习的优势又能将课堂学习的长处发扬光大。我们的经验为高校精品课程建设提供了良好的范例。     

生物信息学的研究进展

简要论述了生物信息学的产生与发展,介绍了该学科当前的研究热点及学科发展的人才和资金问题.     

人体运动能力与蛋白质需要量浅析

对蛋白质的若干生理作用、蛋白质在机体内的有关代谢及与体育运动的关系进行了分析     

利用SPA提取鼠IgG制备兔抗鼠IgG血清的尝试

本文首次用 SPA 提取鼠 IgG,制备兔抗鼠 IgG 血清,效价高,纯度好,方法简便,可靠。     

由氯桥联的一维链状锰配位聚合物[Mn(C10H8N2)Cl2]n的合成及晶体结构表征

合成了一维链状锰配位聚合物[Mn(C10H8N2)Cl2]n,该配合物晶体属单斜晶系,C2/c空间群,晶胞参数是a=1.7757(2)nm,b=0.91776(11)nm,c=0.69953(9)nm,β=111.895(6)°,V=1.0578(2)nm3,Z=4。每个锰离子周围有4个氯离子和2个由2,2’–联吡啶提供的氮原子与之配位形成畸变的八面体配位构型。相邻两个锰离子通过两个氯离子相连,将配合物扩展成一维链状结构。     

家蚕bHLH转录因子BmASCa_4基因的生物信息学分析及功能预测

家蚕的基因测序工作已于2003年10月完成,但是对于其bHLH转录因子BmASCa4基因的生物信息学分析及功能预测鲜有报道。文章利用生物信息学的方法,就家蚕bHLH转录因子BmASCa4基因结构及功能进行了分析,研究结果表明：家蚕bHLH转录因子BmASCa4基因结构信息只来自一条EST序列,该基因在编码区内无内含子;BmASCa4由l＇sc基因编码,在促进神经前体的形成中发挥作用。     

绿色荧光蛋白及其在分子生物学上的应用

许多海洋无脊椎动物体内都含有绿色荧光蛋白,这种蛋白质结构很特殊,在受到蓝光或紫外线刺激时可以发射绿色荧光,并不需要任何协同因子、底物,适合用作普遍的报告标记,尤其适合于活体细胞或组织。而且它发出的荧光稳定,检测简单,结果真实可靠。并且GFP对光漂白、氧化剂、还原荆以及其他许多化学试剂具有极强的稳定性．易于构建载体。它独特的性质引起了生物学界的广泛关注。本文简要地概述了绿色荧光蛋白及其在分子生物学上的应用,包括蛋白融合,细胞筛选,定位标记,基因表达调控,计算细胞生长速度等。     

关于西非高粱细胞质中含有A_2雄性不育可育基因的推论

过去有关文献都认为西非高粱具有细胞质雄性不育基因，本文以植物雄性不育综合理论为依据，并根据一些高粱品种对Ａ１Ａ２两种雄性不育类型的反应结果论证了西非高粱细胞质中不仅有Ａ１型雄性不育基因，同时含有Ａ２型可育基因。     

Effect of microcystin-LR on protein phosphatase 2A and its function in human amniotic epithelial cells

Due to their toxicity, the increased distribution of microcystins (MCs) has become an important worldwide problem. MCs have been recognized as inhibitors of protein phosphatase 2A (PP2A) through their binding to the PP2A catalytic subunit. However, the exact mechanism of MC toxicity has not been elucidated, especially concerning the cellular response and its autoregulation. To further dissect the role of PP2A in MC-induced toxicity, the present study was undertaken to determine the response of PP2A in human amniotic epithelial (FL) cells treated with microcystin-LR (MCLR), one of the MC congeners. The results show that a low-dose treatment of MCLR in FL cells for 6 h induced an increase in PP2A activity, and a high-dose treatment of MCLR for 24 h decreased the activity of PP2A, as expected. The increased mRNA and protein levels of the PP2A C subunit may explain the increased activity of PP2A. Furthermore, MCLR altered microtubule post-translational modifications through PP2A. These results further clarify the underlying mechanism how MCLR affects PP2A and may be helpful for elucidating the complex toxicity of MCLR.     

Unique-MU(2)和SYM-MU(2)的结构和复杂度

SAT问题(可满足性问题)是计算机科学的核心问题,研究问题的方法很多,利用极小不可满足公式的性质来研究SAT问题是近几年兴起的一个热点研究方向. 文章主要利用,(1,*)-消解和分裂方法研究了差为2的唯一极小不可满足公式集(Unique-MU(2))和差为2的对称极小不可满足公式集(SYM-MU(2))的结构和复杂度.     

头孢他啶侧链酸乙酯合成工艺研究

以去甲氨噻肟酸乙酯为原料,在碱性条件下与α-澳代异丁酸叔丁酯合成了头孢他啶侧链酸乙酯,分析了不同溶剂、碱的用量对反应收率的影响．较佳的反应条件为：溶剂DMF350mL,摩尔比为去甲氨噻肟酸乙酯：α-澳代异丁酸叔丁酯：无水碳酸钾=1：1．2：2,反应温度45℃,反应时间24h．在此条件下,反应收率达89．6％．     

铬-氨三乙酸桥联双核配合物的合成及结构表征

在水溶液中合成了[Ba（H2O）6][Cr（nta）（OH）]2配合物,对该配合物进行X-衍射表征,结果表明,该配合物为三斜晶系,空间群为P-1,a=11．002（5）A,b=11．078（5）A,c=11．632（5）A,V=1172．0（8）A^3。