基于网络药理学和分子对接探讨五子衍宗丸对骨质疏松的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨五子衍宗丸对骨质疏松（Osteoporosisi,OP）的作用机制。方法：对五子衍宗丸的有效成分进行多个数据库及文献检索,确定对应靶点,从多个数据库中检索骨质疏松靶点,并构建蛋白互作网络图,通过可视化软件Cytoscape构建化合物-靶点图,分析五子衍宗丸治疗骨质疏松的机制,并运用分子对接进行验证。结果：筛选到五子衍宗丸对应靶点有470个,五子衍宗丸与骨质疏松共有靶点29个,富集到179个与骨质疏松相关的信号通路,其中糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、雌激素信号通路、JAK-STAT信号通路等富集显著。分子对接结果显示对接结果稳定。结论：五子衍宗丸活性成分可能通过调节激素水平、抗炎、改善骨代谢等药理作用在骨质疏松症中发挥作用。     

基于网络药理学及分子对接联合GEO芯片分析红花治疗冠心病的作用机制

运用网络药理学及分子对接联合GEO芯片分析的方法,分析红花治疗冠心病的分子靶点和作用机制。通过TCMSP平台筛选红花的有效成分和靶点;在GEO芯片数据库检索、分析、筛选芯片数据并提取冠心病的差异表达基因;将获得的药物靶点与疾病靶点取交集基因,使用STRING平台对关键靶点构建蛋白互作网络;利用Metascape数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析,应用AutoDockTools软件进行分子对接,预测作用机制。共获得红花17个有效成分,对应218个作用靶点,药物靶点与疾病靶点交集基因22个;筛选到核心活性成分黄芩素、β-胡萝卜素、β-谷甾醇等,核心靶点VEGFA、MMP9、JUN等;GO和KEGG分析呈现生物过程199个,细胞组分17个,分子功能19个,富集通路涉及到IL-17信号通路、糖尿病并发症相关AGE-RAGE信号通路等;分子对接结果β-胡萝卜素、豆甾醇等与核心基因结合良好。文章初步揭示红花治疗冠心病的活性成分、作用靶点及信号通路,红花通过多成分、多靶点、多通路的方式发挥治疗冠心病的效用。     

基于网络药理学探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变的分子机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术,探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变（Diabetic peripheral neuropathy,DNP）的药理分子机制,为经典方剂临床应用提供初步的现代理论依据。方法：通过Batman-TCM数据库（http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/）获取黄芪、石斛、牛膝、远志、金银花五味中药的主要化学成分及靶点信息;利用String11.0数据库（https://www.string-db.org/）进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并进行可视化分析,预测其中发挥作用的主要蛋白靶点。在Metascape数据库进一步分析核心靶点参与的生物过程及通路,采用CytoScape 3.8.0软件构建“四神煎成分-核心靶点-通路”关系网,分析其中主要发挥作用的成分及关键靶标,最后运用AutoDockTools-1.5.6进行分子对接,对接结果用PyMOL显示。结果：得到四神煎治疗DNP的活性成分79个,对应靶点456个,交集核心靶点113个,预测四神煎治疗DNP的主要活性成分为茉莉酮,核心基因ALB、TNF、PTGS2、CREB1、CA...     

基于网络药理学和分子对接技术探究天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用机制

抑郁症作为一种常见的精神障碍性疾病已经严重危害人类的健康,其发生发展过程伴随着严重的免疫紊乱现象。而天然冬虫夏草多糖具有良好的免疫调节药理活性,因此,本研究采用网络药理学联合分子对接技术,对天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用的潜在机制进行了研究。研究结果表明,天然冬虫夏草多糖可能通过调节PI3K-AKT、HIF-1和JAK-STAT等通路及EGFR、STAT3、PRKACA、TP53和IL-1β等靶点,发挥了其免疫调节功能,从而实现抗抑郁作用。     

基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制

目的:基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制.方法:利用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库结合文本挖掘方式,提取竹节参的化合物成分、化合物靶点关系,利用OMIM和Gene Cards网站提取竹节参的疾病靶点,R语言V4.0.3绘制Venny图以获得交集靶点,相关信息导入Cytoscap...     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨当归芍药散治疗糖尿病肾病(DKD)的机制.方法:使用TCMSP数据库检索当归芍药散的活性成分,并利用PubChem数据库与Swiss Target Prediction平台收集当归芍药散6味中药活性成分的作用靶点;通过OMIM、DrugBank、TTD、GeneCards数据库获取糖尿病肾病...     

基于体外实验和分子对接研究枫杨果抑菌活性及分子机制

目的:基于体外实验和分子对接研究枫杨抑菌活性及机制。方法:以枫杨果、树皮、叶为研究对象,分别研究其水提物和醇提物(70%乙醇)对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、伤寒沙门菌、化脓性链球菌、表皮葡萄球菌的抑菌活性,确定抑菌谱和最小抑菌浓度(MIC)。利用活性追踪方法,通过硅胶吸附色谱、薄层色谱等手段,分离单体化合物,并进行抑菌活性研究,选择PBP5、FabI、FabH、Fts Z 4个抑菌关键蛋白靶点,利用Systems Dock Web Site软件进行分子对接,研究其抑菌机制。结果:实验发现枫杨果的醇提物抑菌效果最好,对伤寒沙门菌最小抑菌浓度为7.81 mg/mL,首次从枫杨果中分离得到β-谷甾醇、β-胡萝卜苷、齐敦果酸,三个化合物对于PBP5、FabH、FtsZ蛋白靶点Docking score均大于7,结果活性很好。结论:枫杨果醇提物抑菌谱广、抑菌能力强,其可能是通过抑制革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖的合成,以及细菌脂肪酸的生物合成,干扰其生物膜的形成从而抑制细菌的生长和繁殖,从而起到广谱的抗菌效果。     

基于网络药理学方法探讨瑶药四方藤抗类风湿性关节炎的作用机制

文章运用反向分子对接的手段探讨四方藤抗类风湿性关节炎的机制。选择四方藤中11个主要化学成分,应用Chem Bio Draw软件画出化学结构式,通过Pharm Mapper数据库分析预测潜在作用靶点,运用DAVID和KEGG数据库预测其作用通路信息,并构建四方藤作用机制网络。得到EGFR,MAPK1 PDPK1等四方藤主要成分作用靶点122个,并聚焦到21条相关通路,这些通路主要与炎症反应、糖尿病、癌症相关。结果表明,瑶药四方藤抗类风湿性关节炎作用可能与炎症反应中的相关靶点和通路有关。     

基于网络药理学探究益肾活血方治疗糖尿病肾病的活性成分及作用机制

目的:基于网络药理学探究益肾活血方治疗糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)的活性成分和作用机制.方法:通过TCMSP数据库分析益肾活血方的活性成分及靶点;借助GeneCards、OMIM及TTD数据库收集DN的靶点;利用韦恩工具取二者的交集靶点,借助STRING平台构建交集靶点的蛋白互作网络;采用Cytoscape 3.7.2软件构建"成分-疾病-靶点"网络图;通过DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析.结果:筛选出益肾活血方活性化合物123个,核心化合物为槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、异鼠李素、丹参酮ⅡA.核心靶点为IL-6、VEGFA、CASP3、BCL2、PTGS1等.KEGG通路主要涉及AGEs/RAGE信号通路、PI3K/Akt信号通路等.结论:黄酮类化合物及丹参酮ⅡA为益肾活血方治疗DN的核心成分.益肾活血方可能作用于IL6、VEGFA、PTGS1等核心靶点基因调控AGEs-RAGE通路,作用于CASP3、BCL2、VEGFA等核心基因调控PI3K/Akt信号通路,延缓糖尿病肾病的发展.     

基于网络的药理学问题式学习教学平台的实现

从2002年开始就有人探讨在网络环境下进行PBL教学的可行性,但是实际上使用网络进行PBL(Problem-Based Learning,简称PBL,也称作问题式学习)教学的实例并不多见.随着网络环境日新月异的发展和编程技术的不断提高,实现网络PBL已变成一种趋势.为了实现网络环境药理学PBL教学,开发了这个药理学基于网络的PBL教学平台.这个平台具有较强的实用性.     

瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的网络药理学研究

目的:基于网络药理学分析中医经典方瓜蒌薤白半夏汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制.方法:借助TCMSP检索瓜蒌、半夏、薤白有效成分和对应靶基因,绘制"中药-成分-靶基因"网络图.利用GeneCards获得疾病相关靶基因,制作疾病-药物共同作用靶点韦恩图,再构建PPI网络图,并进行网络拓扑分析,对共同...     

基于文本的人类疾病基因网络的重构和分析

利用预定义的疾病基因关联决定方法来构建人类疾病基因网络,该网络提供了一个以疾病基因为中心的人类遗传疾病的关联图谱。由此,我们可以以疾病基因为中心,从这个角度去研究绝大多数人类遗传疾病潜在的分子机制。     

"非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制"重大研究计划结题综述

本文介绍了"非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制"重大研究计划的立项背景、总体科学目标、总体布局、实施思路及总体完成情况,并概述了该领域下一步发展的建议.     

企业社会网络对创新绩效的作用机制研究——基于浙江的实证

构建了企业社会网络、创新资源与创新绩效相互关系的理论模型,利用来自杭州、宁波和绍兴等地企业的调研问卷验证理论模型及所提出的假设.研究结果表明企业社会网络的网络规模、网络中心度、关系强度和互惠性等各维度都与企业所能获取的知识资源正相关;企业社会网络的关系强度、关系稳定性和互惠性等各维度都与企业所能获取的资金资源正相关;知识资源和资金资源在企业社会网络特征各维度与创新绩效关系中起中介作用.     

基于信号通路探讨针灸治疗支气管哮喘作用机制的研究进展

信号通路在支气管哮喘发病机制及针灸治疗支气管哮喘作用机制的研究中都具有举足轻重的作用.针灸通过多靶点调控信号通路从而影响支气管哮喘的预后与转归.文章从TGF-β1/Smads、PI3K/AKT、JAK/STAT、NF-κB、ERK等信号通路入手,对基于信号通路探究针灸治疗哮喘的作用机制进行综述,可为深入探究针灸治疗哮喘...     

基于S-MAC和T-MAC协议的无线传感器网络技术之节能探讨

在无线传感器网络协议设计中,针对碰撞、串音、空闲侦听和协议开销造成传感器网络更多能量的消耗,从减少能量消耗出发,探讨S-MAC和T-MAC协议在设计中的考虑.     

电商平台与双边市场价值共创对网络效应的作用机制——基于淘宝网案例分析

运用规范的案例研究方法,选取淘宝电商平台与买卖双方之间价值共创案例为研究对象,研究发现:在创业期,平台通过提供第三方支付、阿里旺旺、信用互评与网商概念,创造了平台规则价值,满足了用户安全基础上的实惠网购需求与商家低成本网络创业需求,激发了网络数量效应;在成长期,平台通过提供用户购买习惯的统计分析等增值服务,创造了平台数据价值,满足了用户的品质需求与商家的精准营销,优化了网络质量效应;在成熟期,平台通过开放式创新,聚集了众多专业服务商为商家提供精准化与个性化服务来满足商家差异化需求,创造了平台生态价值,扩大了网络增量效应。     

隐私关注对网络精准广告点击意愿影响机制研究——消费者风险感知和自我效能的作用

以204份消费者调研数据为样本,实证分析了消费者隐私关注对网络精准广告点击意愿的影响机制。研究发现,隐私关注是网络精准广告失效的主要因素之一;隐私关注对网络精准广告点击意愿有显著的负向影响,且受到消费者风险感知的中介作用;消费者自我效能对风险感知与网络精准广告点击意愿间关系起到负向调节作用。