基于网络药理学和分子对接探讨五子衍宗丸对骨质疏松的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨五子衍宗丸对骨质疏松（Osteoporosisi,OP）的作用机制。方法：对五子衍宗丸的有效成分进行多个数据库及文献检索,确定对应靶点,从多个数据库中检索骨质疏松靶点,并构建蛋白互作网络图,通过可视化软件Cytoscape构建化合物-靶点图,分析五子衍宗丸治疗骨质疏松的机制,并运用分子对接进行验证。结果：筛选到五子衍宗丸对应靶点有470个,五子衍宗丸与骨质疏松共有靶点29个,富集到179个与骨质疏松相关的信号通路,其中糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、雌激素信号通路、JAK-STAT信号通路等富集显著。分子对接结果显示对接结果稳定。结论：五子衍宗丸活性成分可能通过调节激素水平、抗炎、改善骨代谢等药理作用在骨质疏松症中发挥作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨护肝宁片治疗乙型肝炎的作用机制

目的：通过网络药理学研究护肝宁片治疗乙型肝炎的作用机制。方法：利用TCMSP数据库收集护肝宁片活性成分,构建化合物—靶点图。通过GeneCards和OMIM数据库获取乙型肝炎相关靶点,将护肝宁片活性成分靶点与乙型肝炎疾病靶点取交集,得到关键靶点。通过对共有核心靶点进行蛋白质相互作用分析,分析蛋白相互作用（PPI）中度中心度（DC）、中间性中心性（BC）、紧密性中心性（CC）筛选核心靶基因。选取的护肝宁片主要活性成分与关键靶点进行分子对接。结果：筛选到护肝宁片中木樨草素、槲皮苷、隐丹参酮、丹参酮等81种主要化学成分和198个相关靶点,其中关键靶点有TP53、AKT1、VEGFA、STAT3等。护肝宁片中的活性成分可能通过线粒体、膜筏等细胞组分参与DNA生物合成、细胞凋亡、星形胶质细胞的激活等多种生物学过程,作用通路为乙型肝炎、PI3K-AKT等。分子对接结果显示主要化学成分与核心靶点的结合力均较强,蛋白结晶复合物构象稳定。结论：研究初步表明了护肝宁片通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗乙型肝炎的作用机制。     

基于网络药理学探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变的分子机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术,探究四神煎治疗糖尿病周围神经病变（Diabetic peripheral neuropathy,DNP）的药理分子机制,为经典方剂临床应用提供初步的现代理论依据。方法：通过Batman-TCM数据库（http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/）获取黄芪、石斛、牛膝、远志、金银花五味中药的主要化学成分及靶点信息;利用String11.0数据库（https://www.string-db.org/）进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并进行可视化分析,预测其中发挥作用的主要蛋白靶点。在Metascape数据库进一步分析核心靶点参与的生物过程及通路,采用CytoScape 3.8.0软件构建“四神煎成分-核心靶点-通路”关系网,分析其中主要发挥作用的成分及关键靶标,最后运用AutoDockTools-1.5.6进行分子对接,对接结果用PyMOL显示。结果：得到四神煎治疗DNP的活性成分79个,对应靶点456个,交集核心靶点113个,预测四神煎治疗DNP的主要活性成分为茉莉酮,核心基因ALB、TNF、PTGS2、CREB1、CA...     

基于网络药理学和分子对接技术探究天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用机制

抑郁症作为一种常见的精神障碍性疾病已经严重危害人类的健康,其发生发展过程伴随着严重的免疫紊乱现象。而天然冬虫夏草多糖具有良好的免疫调节药理活性,因此,本研究采用网络药理学联合分子对接技术,对天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用的潜在机制进行了研究。研究结果表明,天然冬虫夏草多糖可能通过调节PI3K-AKT、HIF-1和JAK-STAT等通路及EGFR、STAT3、PRKACA、TP53和IL-1β等靶点,发挥了其免疫调节功能,从而实现抗抑郁作用。     

瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的网络药理学研究

目的:基于网络药理学分析中医经典方瓜蒌薤白半夏汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制.方法:借助TCMSP检索瓜蒌、半夏、薤白有效成分和对应靶基因,绘制"中药-成分-靶基因"网络图.利用GeneCards获得疾病相关靶基因,制作疾病-药物共同作用靶点韦恩图,再构建PPI网络图,并进行网络拓扑分析,对共同...     

基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制

目的:基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制.方法:利用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库结合文本挖掘方式,提取竹节参的化合物成分、化合物靶点关系,利用OMIM和Gene Cards网站提取竹节参的疾病靶点,R语言V4.0.3绘制Venny图以获得交集靶点,相关信息导入Cytoscap...     

基于体外实验和分子对接研究枫杨果抑菌活性及分子机制

目的:基于体外实验和分子对接研究枫杨抑菌活性及机制。方法:以枫杨果、树皮、叶为研究对象,分别研究其水提物和醇提物(70%乙醇)对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、伤寒沙门菌、化脓性链球菌、表皮葡萄球菌的抑菌活性,确定抑菌谱和最小抑菌浓度(MIC)。利用活性追踪方法,通过硅胶吸附色谱、薄层色谱等手段,分离单体化合物,并进行抑菌活性研究,选择PBP5、FabI、FabH、Fts Z 4个抑菌关键蛋白靶点,利用Systems Dock Web Site软件进行分子对接,研究其抑菌机制。结果:实验发现枫杨果的醇提物抑菌效果最好,对伤寒沙门菌最小抑菌浓度为7.81 mg/mL,首次从枫杨果中分离得到β-谷甾醇、β-胡萝卜苷、齐敦果酸,三个化合物对于PBP5、FabH、FtsZ蛋白靶点Docking score均大于7,结果活性很好。结论:枫杨果醇提物抑菌谱广、抑菌能力强,其可能是通过抑制革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖的合成,以及细菌脂肪酸的生物合成,干扰其生物膜的形成从而抑制细菌的生长和繁殖,从而起到广谱的抗菌效果。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨当归芍药散治疗糖尿病肾病(DKD)的机制.方法:使用TCMSP数据库检索当归芍药散的活性成分,并利用PubChem数据库与Swiss Target Prediction平台收集当归芍药散6味中药活性成分的作用靶点;通过OMIM、DrugBank、TTD、GeneCards数据库获取糖尿病肾病...     

基于网络药理学探究益肾活血方治疗糖尿病肾病的活性成分及作用机制

目的:基于网络药理学探究益肾活血方治疗糖尿病肾病(Diabetic nephropathy,DN)的活性成分和作用机制.方法:通过TCMSP数据库分析益肾活血方的活性成分及靶点;借助GeneCards、OMIM及TTD数据库收集DN的靶点;利用韦恩工具取二者的交集靶点,借助STRING平台构建交集靶点的蛋白互作网络;采用Cytoscape 3.7.2软件构建"成分-疾病-靶点"网络图;通过DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析.结果:筛选出益肾活血方活性化合物123个,核心化合物为槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、异鼠李素、丹参酮ⅡA.核心靶点为IL-6、VEGFA、CASP3、BCL2、PTGS1等.KEGG通路主要涉及AGEs/RAGE信号通路、PI3K/Akt信号通路等.结论:黄酮类化合物及丹参酮ⅡA为益肾活血方治疗DN的核心成分.益肾活血方可能作用于IL6、VEGFA、PTGS1等核心靶点基因调控AGEs-RAGE通路,作用于CASP3、BCL2、VEGFA等核心基因调控PI3K/Akt信号通路,延缓糖尿病肾病的发展.     

基于网络药理学方法探讨瑶药四方藤抗类风湿性关节炎的作用机制

文章运用反向分子对接的手段探讨四方藤抗类风湿性关节炎的机制。选择四方藤中11个主要化学成分,应用Chem Bio Draw软件画出化学结构式,通过Pharm Mapper数据库分析预测潜在作用靶点,运用DAVID和KEGG数据库预测其作用通路信息,并构建四方藤作用机制网络。得到EGFR,MAPK1 PDPK1等四方藤主要成分作用靶点122个,并聚焦到21条相关通路,这些通路主要与炎症反应、糖尿病、癌症相关。结果表明,瑶药四方藤抗类风湿性关节炎作用可能与炎症反应中的相关靶点和通路有关。     

基于网络的药理学问题式学习教学平台的实现

从2002年开始就有人探讨在网络环境下进行PBL教学的可行性,但是实际上使用网络进行PBL(Problem-Based Learning,简称PBL,也称作问题式学习)教学的实例并不多见.随着网络环境日新月异的发展和编程技术的不断提高,实现网络PBL已变成一种趋势.为了实现网络环境药理学PBL教学,开发了这个药理学基于网络的PBL教学平台.这个平台具有较强的实用性.     

基于社会网络分析的我国芯片产业加权专利合作网络研究*

芯片产业是现代产业体系中基础性、战略性和先导性的产业,基于合作专利数据研究芯片产业加权网络的结构特征,有助于揭示我国芯片专利合作网络的内在耦合机制以及互补机制,为决策者制定合理的产学合作政策和芯片产业发展战略提供理论依据。本文以中国芯片产业为研究对象,运用社会网络分析方法,通过构建芯片产业加权专利合作网络,从网络结构、关联性、社群和重要节点等方面,研究了芯片产业加权专利合作网络的结构特征。研究结果表明：中国芯片产业加权专利合作网络具有幂律分布的特性；企业在芯片产业的专利合作申请中占据主导地位,北京、上海和广东等经济发达地区是该网络节点的重要组成；度值较大的专利申请人呈现明显的连接偏好,节点的权重比度值增加的更快,网络具有同配性质；国家电网公司是该网络最为重要的节点,电子科大、台积电占据该网络中的重要位置。据此,本文对提升中国芯片产业发展提出了建议。     

冠心病的临床症状及药物治疗分析

目的:随着社会状态的改变,脂质代谢异常高发,冠心病发病率逐年上升,治疗成了人民关注棘手问题,综述冠心病的类型和临床常用药物治疗冠心病心绞痛特点。方法;大量查阅相关文献资料及治疗指南。结果:分别从西药和中成药论述了冠心病心绞痛的效果。结论:中医药在冠心病心绞痛的疗效领域有着不可替代的地位。     

基于文本的人类疾病基因网络的重构和分析

利用预定义的疾病基因关联决定方法来构建人类疾病基因网络,该网络提供了一个以疾病基因为中心的人类遗传疾病的关联图谱。由此,我们可以以疾病基因为中心,从这个角度去研究绝大多数人类遗传疾病潜在的分子机制。     

基于超网络的舆情信息传播机制分析

通过对网络舆情的分析,将舆情系统映射为舆情事件网络和网民社会网络构成的超网络体系。利用网络链接分析法,就舆情事件网络、网民社会关系网络和事件—网民网络对舆情事件信息传播的机制进行系统分析,从舆情事件链接预测、网络意见领袖的传播影响、网络信息推荐方式等方面,提出了网络舆情信息传播控制的建议。     

网络舆情与非常规突发事件作用机制——基于系统动力学建模分析

非常规突发事件因其爆发性、演变不确定性、群体扩散性等特点备受学者们关注.随着互联网技术的发展与互联网应用的普及,网络作为非常规突发事件信息传播的载体和平台,令英信息传播更迅速,也使事件影响力剧增.利用系统动力学建模认识非常规突发事件涨落规律是一个新的研究角度,其能够分析系统中作用主体之间相互影响关系,以及相关因素的作用力大小,从而探究事物自身演化机理,找寻规律,为控制非常规突发事件网络舆情扩散,引导非常规突发事件舆情传播提供有力依据.     

"非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制"重大研究计划结题综述

本文介绍了"非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制"重大研究计划的立项背景、总体科学目标、总体布局、实施思路及总体完成情况,并概述了该领域下一步发展的建议.     

企业网络的边界及演化分析:基于网络科学视角

本文基于网络科学的视角从网络属性出发,选择联接强度、联接频率、多企业节点、动态稳定性四个维度对企业网络边界的确定进行研究。企业网络是不断演化的过程,本文借用网络科学的复杂网络模型,对企业网络演化的特性和动态过程进行分析。     

基于无标度网络的产学研合作网络功能及培育机制研究

产学研合作网络具有无标度网络增长性与择优连接性这两个基本特征.从无标度网络的这两个特征出发,结合产学研合作网络的演化规律,从增长性、节点的异质性、网络的稳健性和脆弱性以及自组织性四个角度分析了产学研合作无标皮网络的功能,并在此基础上提出了产学研合作无标度网络的培育机制.     

基于关系嵌入的创新网络知识共享及协调机制研究

知识经济时代,知识要素在国家创新系统建设及创新生态系统优化过程中的核心地位日益得到实践验证。从创新网络的知识共享博弈过程入手,从关系联结强度、关系质量、关系稳定性等多个维度重点探析关系嵌入对知识共享的协调作用,并提出创新网络知识共享的法律协调、管理协调和社会协调机制,以提高企业间知识资源的转移与创新开发效率,为国家创新系统建设及创新生态系统的优化提供思路与建议。