随机扩增多态性DNA技术研究发现二氧化钛纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性

研究目的：二氧化钛（TiO2）纳米颗粒已经广泛应用于化妆品、防晒霜、涂料和牙膏等。这些纳米颗粒性质非常稳定,能在废水和生物固体中转移和分散。现有研究表明,TiO2纳米颗粒对动物正常生理活动具有毒性等负面作用。但是,它们对植物是否具有毒性特别是是否会产生植物基因毒性至今尚不清楚。因此,本文使用随机扩增多态性DNA技术研究TiO2纳米颗粒是否对西葫芦具有基因毒性,为TiO2纳米颗粒排放进入环境后的潜在植物毒性风险评价提供依据。 创新要点：首次发现了TiO2纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性。 重要结论：采用随机扩增多态性DNA技术,发现TiO2纳米颗粒污染处理的西葫芦样品与未处理样品的基因组DNA图谱相比,不仅在谱带强度有明显差异,而且存在谱带消失和新谱带产生现象,表明TiO2纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性。     

细菌随机扩增DNA多态性反应体系优化

目的:对RAPD的反应体系进行优化,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.方法:用RAPD技术进行基因分型.结果:引物浓度:浓度为0.5μmol/L 时扩增最好.DNA模板:浓度在0.50ng/μl 、2ng/μl均得到了良好的扩增效果.镁离子浓度:在2.0mmol/L、4mmol/L时扩增效果较好.退火温度:在30℃时扩增条带最清晰.循环参数:在35、45个循环时扩增效果均好.结论:本试验对RAPD反应条件进行优化,建立了较稳定的临床检测体系.     

杂交稻亲本材料的随机扩增多态性DNA研究

在220个随机引物中,筛选出6个具有较高多态性检测能力的引物．用这6个随机引物对30份杂交水稻亲本材料进行了RAPD分析,共检测到56条多态性带．聚类分析表明,不同亲本材料可以被较为明确地区分,显示了应用RAPD技术鉴定稻种具有简便、灵敏、准确的特点及良好的应用前景．本研究对影响RAPD技术稳定性的因素进行探讨,并提出了克服这些不利因素的技术措施．     

铜绿假单胞菌随机扩增DNA多态性基因分型研究

目的:调查铜绿假单胞菌在临床各科中的流行情况,以期建立稳定的临床检测系统,在控制院内感染的流行病研究中发挥更大的作用.方法:用微量液体稀释法进行药敏检测,用RAPD技术进行基因分型.结果:耐药谱分6型,Ⅰ型占44.5%,Ⅱ型占18.5%,Ⅲ型占7.4%,Ⅳ型占7.4%,V型占11.1%,Ⅵ型(不定型)占1.1%;RAPD分9型,A型占51.9%,B型占7.4%,C型占7.4%,D型占7.4%,E型占7.4%,F型占3.7%,G型占3.7%,H型占7.4%,Ⅰ型占3.7%.结论:基因型A型、耐药谱Ⅰ型的铜绿假单胞菌是此次ICU医院感染暴发流行的菌株,其它型别为非流行相关菌株.RAPD基因分型的灵敏性、特异性及可靠性优于耐药谱分型,在医院感染流行病学调查中具有较大的应用价值.铜绿假单胞菌对哌拉西林、头孢唑啉、头孢呋肟耐药率高;对喹诺酮类抗生素较敏感;对氨基糖甙类抗生素有一定的耐药性;亚胺培南的耐药率最低.     

用随机扩增多态DNA技术对太白米基因组DNA的分析

目的：对野生太白米DNA进行分子标记分析，获得DNA指纹谱。方法：用随机扩增多态DNA(RAPD)标记方法对太白米进行遗传分析。结果：用RAPD标记方法可以从DNA分子水平看出种间差异。结论：本方法可为野生道地品种鉴别提供依据。     

随机扩增多态DNA在果树上的应用（综述）

综述了RAPD及其在构建果树遗传连锁图谱、目的性状基因标记、遗传关系鉴定及种属鉴定等方面的作用。     

应用RAPD技术对我国不同地区周期型马来丝虫DNA多态性的比较分析

寄生虫分类学的研究对于寄生虫病原学,流行病学及防治等诸多方面具有学术及实际意义,已知在生物学上有差异的亚种或株,具有不同的致病力,我国不同地区马来丝虫的致病性、周期性、主要传播媒介媒价以及其他生物学特性等方面都有不同程度的差异,为了弄清这些差异的原因究竟是由于丝虫本身还是由于传播媒介或患者生活环境不同等因素所致,国内学者已应用电镜、酶组织化学及同工酶电泳分析等技术对我国不同地区的周期型马来丝虫进行了比较研究,为直接从基因结构上探讨各地区的丝虫是否有差异,本实验采用随机扩增多态性DNA(RAPD)分析技术,对我国湖北谷城(H)、四川乐山(S)及浙江安吉(Z)三个地区的周期型马来丝虫进行种下分型的研究探讨,本实验采用RAPD分析技术,对我国三个地区周期型马来丝虫进行DNA多态性比较分析,结果表明,不同地区的马来丝虫在基因结构上既有同源性(三个地区的马来丝虫有共享a、c带,H、S两地区的丝虫有a、c、d、e、f g 6条共享带),又存在差异(各地区丝虫的条带数不同),说明我国不同地区的马来丝早已存在种内分化。     

蚕微卫星DNA的体外自我扩增条件初步研究

采用一种类似PCR的基因组自我引发PCR(GSP—PCR)法，初步研究了家蚕、野蚕、天蚕、蓖麻蚕和柞蚕的微卫星DNA的体外基因组自我引发PCR扩增的条件。结果发现。浓度为100ng/μl的基因组DNA在100℃变性15min后，与等量的同浓度的未变性的DNA混合作为模板。在80m扩增体系中[含0．2mM dNTPs、50mM KCl、10mM Tris—HCl(pH9．0)、4mM MgCl2、1．25U Tap plymerase]，加入1μl此混合模板，在92℃，1min→55℃，2min→72℃，2min，30→90次循环的扩增条件下，成功地得到了PCR产物。基因组DNA的适宜浓度为1．25ng/μl反应体系；GSP—PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后的部分片段经回收后，在同样条件下，30—60个循环可得到同样大小范围的产物。GSP—PCR产物经6％的变性测序胶电泳，得到典型的梯状带，表明为微卫星DNA。     

RAPD技术在果树种质资源和育种研究上的应用

介绍了RAPD技术、原理、特点及其在果树种质资源、遗传育种等方面的应用,并对RAPD技术进行了展望.     

黄瓜种子基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化

采用改良的SDS法提取黄瓜种子基因组DNA,并以其为模板对影响RAPD扩增反应的主要因子采用单因素递进分析方法进行优化,建立了黄瓜种子基因组DNA最佳RAPD反应体系,即20 μl的反应体积中含有60ng模板,1.2U Taq DNA聚合酶,3.0 mmol/L MgCl2,0.20 mmol/L dNTP,1.40 μmol/L引物.     

枇杷属植物RAPD反应体系的优化与应用

采用CTAB—蛋白酶K法提取了48份枇杷种质的DNA,以西班牙枇杷品种Ullera为模板DNA,对枇杷属植物RAPD反应体系进行优化研究,结果表明:25μL反应体系中,Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、模板DNA和dNTPs等5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:Mg2+为2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶为1.0 U,引物为0.25"mol/L,dNTPs为0.100—0.125 mmol/L,模板DNA为25—30 ng。利用该优化体系对48份枇杷种质进行RAPD随机扩增,经琼脂糖电泳获得了清晰的扩增图谱。     

RAPD的研究与应用进展

概述了DNA分子标记中RAPD的由来及其原理,叙述了RAPD在遗传学理论、遗传育种等许多方面的作用和最新研究应用进展.     

中国桫椤科6种植物的RAPD分析

应用随机扩增多态性DNA (RAPD)的方法分析中国桫椤科 6种植物 :小羽桫椤(Cyatheatsangii)、粗齿桫椤 (Alsophiladenticulata)、黑桫椤 (Alsophilapodophylla)、白桫椤(Sphaeropterisbrunoniana)、海南白桫椤 (Sphaeropterisbrunoniana)、桫椤 (Alsophilaspinulosa)。经筛选 4 0个引物 ,发现 14个引物的带型清晰并呈多态性。采用UPGMA法对求出的遗传距离进行聚类分析 ,得到的结果显示 :所研究 6种植物明显地聚合为 3个类群 ,支持夏群的分类处理     

蟋蟀基因组DNA提取方法

对直翅目蟋蟀总科部分种类酒精浸泡标本的基因组DNA进行了提取，样品经检测，谱带基本呈线形，无拖尾；OD(260／280nm)值86．11％在1．6—1．8之间。     

三叶木通RAPD最佳反应体系的研究

RAPD技术是一种新的分子标记技术,DNA质量是保证RAPD分析成功的关键。为获得高质量的木通属植物基因组DNA,本文采用SDS法、改良CTAB法、高盐低pH值法提取三叶木通总DNA。结果表明,高盐低pH值法不适用于木通属植物DNA的提取;改良CTAB法是合适的DNA提取方法,它们获得DNA模板纯度高、质量好,可直接用于RAPD分析。同时,对RAPD反应条件中的一些重要参数进行摸索和优化试验,建立适合木通属植物RAPD分析应用的体系,其组成为:反应液总体积为25μL,2.5μL 10×PCR缓冲液、0.16 mmol/L dNTPs2、.0 mmol/L Mg2 、0.64μmol/L引物、1 U/μL Taq酶4、0 ng/25μLDNA模板。PCR循环体系为:94℃,4 min-[-94℃,30 s-37℃,90 s-72℃,60 s-]-72℃,5 min,40个循环。     

棉花RAPD引物筛选及优质材料的遗传多样性分析

为了对本课题组得到的大批优质棉花种质资源进行RAPD分子标记遗传多样性鉴定,我们进行了对棉花有效的引物对的筛选,并完成了24个优质棉花材料的遗传多样性分析.结果从48个随机引物对中筛选出了20对引物,这些引物对这24个优质棉花材料的有效性非常高,共扩增出113条谱带,平均每个引物扩增出5.65条,而且这20个随机引物对这24个材料的多态性谱带扩增效果非常明显,多态率高,能明显分辨出来源不同的材料.将这些多态性标记通过聚类软件分析,可将这24种材料明显的分为六类群,遗传多态性得到明显的体现.     

中国特有濒危裸子植物白豆杉RAPD反应体系的优化

采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPDPCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500mmol/L KCl,100mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10mmol/L)0.4μL,模板1μL(35ng),Taq酶0.8μL(0.5U),水20.3μL.     

中国特有濒危裸子植物白豆杉RAPD反应体系的优化

采用改进的CTAB法提取中国特有濒危裸子植物白豆杉(Pseudotaxus chienii)嫩叶总DNA,进行RAPD分析.分别研究了模板DNA、引物、dNTPs、Mg2 和TaqDNA聚合酶用量对RAPD PCR扩增反应结果的影响.筛选并建立了适合于白豆杉RAPD扩增的反应体系:总体积25μL,其中10×PCR缓冲液(500 mmol/L KCl,100 mmol/L Tris-HCl,1.0%Triton X-100,20 mmol/L MgCl2)2.0μL,引物(1.5μmol/L)0.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.4μL,模板1μL(35 ng),Taq酶0.8μL(0.5 U),水20.3 μL.