基于16S rRNA高通量测序技术的生态学实验教学

利用微生物16 S基因特定区域的通用引物对16 S rRNA进行扩增,采用高通量二代测序技术,结合QIIME数据处理软件进行序列的筛选、比对和微生物鉴定,从而获得土壤中大量微生物物种OTU(Operational Taxonomic Unit)的分布信息.结果表明,该实验激发了学生的实验操作兴趣,拓展了本科生态学实验教...     

基于16S rRNA基因分析虫草寄主蝠蛾的系统进化关系

为了解虫草寄主昆虫的系统进化关系,基于线粒体DNA(mtDNA)16S rRNA基因对7种虫草寄主蝠蛾、2种其他蝠蛾及其他科蛾类的系统进化关系进行研究.用ClustalX 2.1软件对11种蝠蛾16S rRNA基因进行序列对位排列,DAMBE软件分析基因序列的碱基组成及AT或GC偏斜性.用MEGA 7.0统计不同基因序列间的位点数目以及蝠蛾科蝠蛾种间遗传间距,并以果蝇(Drosophila yakuba)做外群,构建分子系统进化树.结果表明:11种蝠蛾的16S rRNA基因序列进行比对排列后,共1 411 bp,其A+T的平均含量为85.3%,保守位点1 054个,简约位点143个,可变位点310个. 11种蝠蛾种间遗传距离为0.005～0.117,其中人支蝠蛾与阿尔泰蝠蛾和贡嘎蝠蛾的种间遗传距离均为0.005,Triodia sylvina与蒲氏钩蝠蛾遗传距离最大(0.117).分别以16S rRNA和16S rRNA联合COⅠ基因构建分子系统树,分析表明蝠蛾科虫草寄主蝠蛾间的关系较近,而与其他蛾类关系较远,其亲缘关系远近与其地理分布有一定关系,与形态学分类观点相吻合.以上结果说明,16S rRNA基因是适用于虫草寄主蝠蛾分类研究的一种有效标记基因.     

室外空气污染和不良出生结局的相关性研究:一项系统回顾和荟萃分析（英文）

目的:孕期妇女暴露于室外空气污染与子代不良出生结局的发生风险有关,但是结果仍然有争议。本研究旨在定量评估这种相关性并探讨异质性的来源。创新点:报告了三种不良出生结局和七种污染物之间的联系,进行了一系列的亚组分析和敏感性分析。同时,考虑了之前荟萃(meta)分析中未涉及到的气象因素的作用。此外,首次使用系统回顾偏倚风险(ROBIS)工具评估相关领域meta分析的偏倚性。方法:收集已发表的评估室外空气污染与低出生体重、早产、小于胎龄儿关系的病例对照研究或队列研究,具体的纳入标准和分析方法已在PROSPERO网站(CRD42018085816)提供。本研究评估了混合效应和异质性,进一步进行了亚组分析和出版偏倚分析,并采用ROBIS工具评估总体的偏倚性。结论:这项系统回顾和荟萃分析是在低偏倚风险下完成的。结果发现高浓度的空气污染暴露与子代不良出生结局的发生风险有关,且研究间异质性较大。不同的暴露测量方式等亚组分析在一定程度上解释了异质性来源,但仍需进一步探讨。     

COVID-19大流行对接受辅助生殖技术（ART）的妇女妊娠结局的影响：系统评价和荟萃分析（英文）

目的：2019年全球新型冠状病毒病肺炎(COVID-19)的爆发导致大多数辅助生殖技术(ART)治疗的暂停。然而,随着最近中国成功控制了大流行,公众迫切需要恢复全面的生殖保健。因此,本文讨论COVID-19大流行是否对女性生育能力和接受ART治疗的妇女的妊娠结局有任何不利影响。方法：使用中英文电子数据库进行了系统评价和荟萃分析。二分类结局总结为患病率和比值比(OR),连续结局总结为标准化均数差(SMD),置信度为95%。使用Stata/SE 15.1和R 4.1.2评估偏倚风险和亚组分析。结论：结果显示,与COVID-19前接受ART治疗的妇女相比,COVID-19大流行后接受ART治疗的妇女在临床妊娠率(1.07,0.97～1.19;I²=0.0%)、流产率(0.95,0.79～1.14;I²=38.4%)、胚胎冷冻保存率(2.90,0.17～48.13;I²=85.4%)和卵母细胞冷冻保留率(0.30,0.03～3.65;I2=81.6%)等方面没有显著差异。该评价为妇科医生提供了额外的证据,以指导在COVID-19...     

关于免疫抑制冲击治疗百草枯中毒的安全性和有效性评价系统回顾和荟萃分析（英文）

目的:评估免疫抑制冲击治疗百草枯中毒患者的安全性和有效性.创新点:报告了在百草枯中毒的患者中,使用免疫抑制冲击治疗的效果,确定了其是否会增加患者发生肝炎和肾衰的风险.方法:我们检索了截止于2018年6月,发表在PubMed,EMBASE和Cochrane三个数据库中关于免疫抑制冲击治疗百草枯中毒患者的文献.经过筛选,最终有7篇文献符合纳入标准,总共426位病人,并采用RevMan软件进行数据分析.结论:对纳入的7篇文献进行荟萃分析,发现使用免疫抑制冲击治疗能够有效的降低百草枯中毒患者的死亡率,而且是相对安全的,不会增加患者发生肝炎或者肾衰的发生率.部分文献报道一些患者出现了白细胞减少,但都在停药后1~2周内恢复正常.另外,文献还报道了两例非致死性的脓毒症,这可能是免疫抑制治疗造成的免疫功能低下引起的.