一种基于极大团扩展的蛋白质相互作用网络可视化方法

后基因组时代,如何从大量的蛋白质相互作用(PPI)数据中寻找特定信息并以图形方式显示是迫切需要解决的问题.为此,本文提出了一种基于极大团扩展的蛋白质复合物聚类算法,该算法通过一种基于极大团扩展的蛋白质符合物识别算法构造功能模块,对PPI网络中的功能模块进行聚类,通过将功能模块用抽象节点代替的方法将PPI网络层次化,这样不但降低了复杂性而且提高了PPI网络中信息的可阅读性.同时采用增加、删除、修改数据的方法对算法进行稳定性分析.结果表明,该算法具有较好稳定性.对于其他具有相似结构的网络,该方法也具有借鉴意义.     

植物迁地保育与土壤生物互作机制

植物迁地保育是植物园的重要功能之一,而植物资源保育及合理利用与我国生物产业发展有着紧密联系。有效保育是合理利用的前提和基础,也是可持续利用的根本。植物迁地保育中出现的植物生长不良或繁殖障碍等现象,严重制约了我国对经济价值高或者珍稀濒危植物的有效保护和可持续利用,因此,分析和鉴别影响植物迁地保育的各种因素,有利于保障植物迁地保育的策略研究。土壤生物群落与植物迁地保育关系密切,而相关研究工作较为薄弱,为此建议加强土壤生物互作机制对植物迁地保育影响的研究。     

基于互引网络的管理学部重要期刊内部关系研究

以管理学部认定的30种重要期刊1980—2008年互引数据为研究样本,运用社会网络分析工具UCINET探讨了重要期刊互引网络的整体结构及中心性特征。模块化研究结果显示:重要期刊可划分为科学研究类子群、经济类子群、管理科学类子群和交叉学科类子群,子群内的期刊与中国期刊网的划分具有高度相似性;科学研究类子群较多地引用其他子群期刊,交叉科学类子群较多地引用管理科学类子群期刊;管理科学类子群、科学研究类子群、经济类子群和交叉学科类子群内部期刊收录文章主题的相似性从高到低。     

基于网络层次的蛋白质相互作用网络功能模块检测方法

为了在蛋白质相互作用网络上预测蛋白质复合物和功能模块,文章提出了WCFM聚类算法,提高了在人类PPI网络上预测蛋白质复合物准确率,并且将D3可视化技术应用到PPI网络可视化领域,为生物网络模块的挖掘和分析提供了有益的参考。     

基于互引网络的管理科学部重要期刊相对影响研究

以1980-2008年管理科学部第二次认定的30种重要期刊群互引数据为研究样本,运用社会网络分析工具UCINET对这些期刊的相对影响进行探讨,发现其中26种期刊间的知识交流较为频繁.从知识的贡献、吸收、传播速度和媒介能力等角度分析了各刊在重要期刊群中的相对地位.通过聚类分析,将重要期刊群分为管理科学、经济综合和科学研究三个子群,管理科学子群和经济综合子群是整体群的知识输出源,而科学研究子群表现出对整体群知识的梳理和储备.进一步探讨了各子群中期刊的相对影响,比较各刊在整体群和子群中的情况,发现媒介能力是变化较为明显的一个方面.     

花椰菜主要农艺性状的遗传效应及其与环境互作分析

利用包括基因与环境互作的加性-显性遗传模型对6个花椰菜品种(系)完全双列杂交实验的2年观察资料进行单球重、球径、球高、株高、株幅和叶片数等农艺性状的遗传分析。结果表明,年份间的环境差异对亲本和F1的表现影响较小;单球重、球径和球高以加性效应为主,通过早代选择可取得较好的改良效果,株高、株幅和叶片数以显性效应为主,且具有较大的环境互作效应,以高世代选择为好;单球重、球径和球高的狭义遗传率均较高(63.98%～86.16%),且都以普通狭义遗传率为主,对其进行遗传改良能够取得较好的效果,株高、株幅和叶片数都以互作狭义遗传率为主,选择效果易受到环境条件的影响。基因效应预测值表明,c-5、c-8和福州80天是提高单球重的良好亲本;c-5是增加球径的良好亲本;c-8和福州80天是增加球高的良好亲本。     

基于三者互作解析的虫媒植物病害前沿防控技术研发策略

虫媒病害是我国农业高产稳产的重大威胁之一,粮食作物、经济作物以及柑橘等多年生木本作物的病毒病害、细菌病害给我国乃至全球农业生产带来了严重的损失。介体昆虫在虫媒病害的流行和传播过程中发挥着重要作用,而虫媒病原的抗性基因研究在主要作物中匮乏,介体昆虫的抗性基因研究尚属空白,所以目前农业生产高度依赖化学杀虫剂对虫媒病害进行防治,导致昆虫耐药性和环境污染等问题,严重影响了我国和世界人民"舌尖上的安全"和生态文明建设。因此,深入探索病原—昆虫—植物三者互惠共生、协同进化的机制,研究农业生态系统中多病原、微生物组、昆虫群落包括天敌等生态因子和环境因子,明确病害流行、爆发、控制过程中的机制和调控关键节点,设计靶向性强、生态安全的新型调控剂和植物保护方案,均将为虫媒病毒的绿色防控提供新的理论基础。本文提出了病原—昆虫—植物三者互作的理论假说体系,包括了三者互作的核心、内层和外围组成;简要总结了三者互作的主要科学问题和目前研究现状;明确了现阶段主要集中于植物挥发物、植物激素以及外界环境在病原—昆虫—植物三者互作中的作用研究;分析了未来在三者互作研究过程中可能存在的瓶颈问题;力求为虫媒病害的绿色防控提供有...     

病毒——昆虫—植物三者互作研究进展及展望

全球气候变暖,极端天气频发,入侵型、新发和重发昆虫传作物病毒病害已经成为限制我国农作物优质高产的主要因素。因缺乏抗病抗虫的种质资源、育种周期长,虫传病害防治难度极大,目前我国农业处于几乎完全依赖化学防控媒介昆虫的被动应付局面,生态与环境成本极大。以往研究虫传病毒病害往往注重病毒和植物寄主两个方面,这些研究为理解作物病毒病害的暴发机制提供了基础知识,但尚未能深入到病害防控的关键节点——媒介昆虫介导的病毒侵染循环这一根本性问题上,导致目前在病毒病害防治实践上缺乏有效抓手。近年来,随着分子生物学和组学研究的飞速发展,以及微观生物学技术和理念对宏观生物学的快速渗透与交叉,病毒—昆虫—植物三者互作机制研究取得了诸多重要进展,在寻找病毒病害流行暴发的宏观生态学现象背后的分子生物学与生物化学机制上取得了长足进步,不但为复杂生态系统多元互作分子机制提供了参考模型,也为通过人工干扰和操纵生物间互作关键节点,从而促进虫传病毒病害的持久防控提供了科学依据和新的有效抓手,变被动应付为主动调控病害灾变过程。文章简要回顾了近年来病毒—昆虫—植物三者互作领域的主要研究进展和发展趋势,并抛砖引玉提出了对未来发展的建议和思考。建议国家组织研究力量,大力加强:(1)大田生产条件下病毒病害发生的多元生物体系互作机制及科学防控科技支撑能力建设;(2)前沿基础和新方法新策略探索及应用平台建设;(3)虫媒病害绿色防控的微生物组学颠覆性技术等方向的探索与突破,力求在虫传作物病毒病害绿色生态防控方面为农业供给侧改革提供强有力的科技创新和支撑能力。     

基于社会网络分析的出版社微博互链网络研究

微博是目前广泛应用的社会化媒体之一,出版社也利用微博开展营销活动提升影响力。本文选择了腾讯微博中经官方认证且有一定影响力的15家出版社微博,以它们组成的微博互链网络为研究对象,运用社会网络分析方法,从密度分析、中心性分析、凝聚子群分析三方面对出版社微博互链网络进行分析评价,并对出版社微博的发展提出建议。     

陆地棉F2产量性状杂种优势及与环境互作的预测

根据加性－显性与环境互作的遗传模型,采用ＭＩＮＱＵＥ（１）方法分析了陆地棉１０个亲本和２０个Ｆ１和Ｆ２皮棉产量、单株铃数、单铃重、衣分和前期收花率等产量性状的两年试验资料．利用亲本和Ｆ１的资料预测了Ｆ２基因型值和杂种优势及与环境的互作．结果表明,Ｆ２皮棉产量、前期收花率、单株铃数和单铃重的群体平均优势分别为１４％、１６％、１０％和３％．Ｆ２皮棉产量、前期收花率、衣分的群体超亲优势分别为５％、８％和－６％．Ｆ２衣分和单铃重杂种优势与环境互作较小．Ｆ２皮棉产量、单株铃数和前期收花率杂种优势与环境互作较大．分析了组合在不同方面的稳定性表现．比较了利用亲本和Ｆ１与用亲本、Ｆ１和Ｆ２资料对Ｆ２产量性状在不同年份中遗传表现的预测结果．     

系统生物学的现状与展望

作为生物学的一个新领域,系统生物学的兴起及发展为研究生命活动提供了一个全新的思路和方法,它将各种组学的方法综合起来,通过高通量的实验手段,从转录组、蛋白质组、代谢组等方面多层次、全方位地对生物体内的生命活动进行检测,同时利用生物信息学的方法和手段对相关的数据进行分析及整合,并在此基础上,对相关的生命活动进行模拟,以期系统地研究和阐明生命活动的规律。本文简单介绍了系统生物学的现状,研究的内容及方法,并对今后的发展提出了一些想法。     

基于复杂网络的ADHD患者脑功能连接分析

基于复杂网络理论,对ADHD患者进行功能连接分析对研究ADHD病理具有重要意义。这一过程中,阈值的选择是至关重要的。本文研究了不同阈值下ADHD患者大脑拓扑特性和健康人的差别,并以K均值聚类分析结果为依据找出比较合适的阈值,为阈值选择提供依据。     

大数据环境下网络舆情信息交互模型研究

[目的/意义]面向大数据研究多个网络传播平台之间网络舆情信息交互模型,能够准确把握大数据环境下网络舆情演化趋势以及网络信息在多个平台之间的传播规律,为政府治理网络舆情提供参考依据。[方法/过程]定性分析大数据环境下网络舆情信息交互机理,通过定义交互系数,基于微分方程理论构建网络舆情信息交互模型,并应用差分回归法对各个媒体平台的网络舆情信息交互趋势开展预测。[结论/结果]经过理论建模和实证分析得出本文构建的信息交互模型及趋势预测方法是可行的,以上理论研究可为政府准确把握大数据环境下网络舆情演化规律,制定网络舆情治理对策提供参考依据。     

交互设计在电子商务网站中的应用研究

交互设计是从人机交互HCI领域分支并发展起来的一门新兴学科，它是一个跨学科领域，涉及了计算机科学、工程学、信息学、人类工程学、美学、心理学和社会科学等诸多学科。从目前应用系统开发的发展趋势看。已从面向功能的开发转向以用户为中心的开发，更注重可用性和用户体验，这正是交互设计的目标。本文对在一种典型的交互式产品一电子商务网站中引入交互设计的思想，以及如何进行交互设计以实现其目标做了研究和探讨。     

学术社交网络中iSchool成员机构的学科交互关系研究

[目的/意义]学术社交网络吸引了众多科研人员参与并使用,对学术社交网络中的学科交互研究有利于促进科研人员利用学术社交网络开展非正式交流及跨学科合作。[方法/过程]文章以ResearchGate(RG)为例,将iSchool成员机构作为研究对象,获取61所iSchool机构成员用户的交互关系数据,并对其中的2798所机构及其间所形成的30393条交互关系数据进行社会网络分析。[结果/结论]从交互数量来看,iSchool成员机构在学术社交网络中的学科交互范围较广,但跨学科影响力有限,其跨学科交互情况反映了目前图情学科领域的跨学科研究趋势和研究热点;从交互关系网络来看,iSchool成员机构整体学科交互关系网络结构较为松散,网络还呈现出iSchool成员机构分别主要与人文与社会科学类和工程与技术科学类的机构产生交互关系的两种趋势。此外,对学术社交网络中交互关系的拓展和学术影响力的提高有利于科研合作的开展和学术声望的提升。     

大数据网络交互环境下图书馆赋能与馆员服务创新研究

[目的/意义]旨在为大数据网络环境下馆员服务创新提供参考。[方法/过程]采用问卷调查方法,以湖北等地部分高校图书馆及国家一级、二级公共图书馆基层馆员为调查对象,调查图书馆赋能、工作自主性、网络交互、馆员前摄型人格、馆员服务创新以及个体层面的特征信息,探讨大数据环境下馆员服务创新的作用机理,构建网络交互与工作自主性对馆员创新服务影响路径模型。[结果/结论]图书馆赋能、馆员前摄型人格对馆员创新服务均具有显著的正向影响;网络交互调节了工作自主性与馆员创新服务的关系;图书馆赋能通过工作自主性影响馆员创新服务;馆员前摄型人格调节了图书馆赋能与网络交互的关系,对馆员创新服务的正向调节通过网络交互的中介作用实现。     

浅析网络言论理性表达的重要性

"一言以兴邦,一言以丧邦"。网络时代的今天,网络言论足以影响民意,左右民心,网络言论理性表达事关国家安全、社会稳定和人民幸福。     

网络众意条件下草根NGO影响政府决策路径探析

草根NGO自20世纪80年代在全球范围内兴起以后,逐渐成为保持社会稳定的重要因素之一,特别是随着网络社会的到来,为各类社会公益组织提供了更为宽广的发展空间。草根NGO如何利用好网络众意这把"双刃剑"来提高自己的影响力并进而影响政府决策,是未来NGO发展的一个重要趋势。本文通过分析草根NGO在网络众意条件下影响政府决策的可行性,提出了草根NGO通过加强网络监管,改善影响政府决策的外部环境以及不断完善自身,提高内部环境两个措施,希望能够为草根NGO影响政府决策之路径提供帮助。     

基于Moodle的在线互动网络教学平台设计

随着教育信息化的逐步发展,网络教育也在一定程度上改变着人们的学习和工作的生活方式。如何有效地利用信息化技术来开展在线动态教学并形成有效的跟踪评价机制,成为目前网络教育的重要研究方向。本文在对网络教学系统研究现状调查的基础上．运用Moodle、Sakai、DrUPa]、PhPBB等开源工具,研究开发了在线互动网络教学平台,文中详细介绍了开发关键技术路线及各功能模块功能设计。     

基于社会网络分析的企业内部知识专家的识别

隐性知识的难以评价,使得企业内部知识网络中的关键人物不易识别。为了识别对企业内部知识传播起关键作用的员工,探讨利用社会网络分析中的点出度、特征向量、权力指数、中间度等指标识别知识传播网络中的知识专家。结合案例分析说明知识专家识别的过程和结果,并对各指标的特点和效果进行总结。