基因测序用超高通量物镜光学系统产业化

基因是维系一个民族生存与发展的命脉.基因测序是新兴产业,处于快速发展阶段.从全球范围来看,我国是全球基因测序市场增长较快的国家,但产业上游的高通量测序设备长期被国外公司主导和垄断,使处于中下游的服务提供商失去自主定价权,甚至会受到供应威胁.缺乏自主的高通量基因测序设备已成为我国基因测序行业发展的痛点.超高通量物镜是基因测序设备的核心光学部件,国外对我国实行严格的技术管控,成为自主测序设备的瓶颈环节和"卡脖子"问题.     

全球基因测序领域专利分析

精准医疗包含诊断和治疗两个方面,"精准"是核心,基因测序是基础。基因测序是指通过测序设备对DNA分子的碱基排列顺序进行的测定。基因测序为个体提供连续的基因大数据,结合大数据的存储和运算实现疾病的"精准"诊断和治疗。根据BBCResearch的预测,2018年全球基因测序市场规模将达117亿美元,未来四年年复合增速将达21%,中国基因测序市场增速将达20%以上,为全球增速最快的地区之一。目前全球基因测序领域的主要技术来源国和专利受理国均为中国和美国。从全球专利申请情况来看,有关基因测序的专利申请主要分布在C部、A部和G部,即关于DNA和蛋白质测序或检测的相关方法和设备的发明专利研发目前最为集中和热门。国外在中国的技术布局已经展开,美国在中国的专利申请量最多,其次为日本。国外主要申请人为美国人体基因组科学有限公司(Human Genome Sciences)和日本肿瘤疗法科学股份有限公司。与国外发达国家相比,我国在基因测序领域的起步稍晚,浙江大学在基因测序领域的申请量位居第一,上海人类基因组研究中心申请数量紧随其后。目前国内在基因测序领域的研究仍以高校和科研院所为主。     

外显子测序揭示小脑共济失调的致病基因

我国科学家应用外显子组测序技术进行单基因病研究获得一项突破,对促进国内单基因病研究的发展具有重要意义。近期,由深圳华大基因研究院、中南大学湘雅医院等单位合作研究“利用全外显子组测序技术发现小脑共济失调新的致病基因TGM6”在国际知名杂志《Brain》上在线发表。     

2014年基因领域的8项重大突破

<正>回首过去的2014年,可以说是基因组学由研究向临床应用转化的元年。科学家们通过基因测序测得了埃博拉病毒DNA的序列,首次通过下一代测序挽救了一位14岁少年的生命,1000美元基因组测序梦成为事实,无创产前基因检测市场逐步规范等等。本文带领你一起回首逝去的2014年:痛过、喜过、纠结过也分享过的基因测序技术!     

生命科学DNA测序云计算平台

正项目概况本项目通过和北京生命科学研究所、华大基因公司联合开发面向DNA测序方向的云计算平台,利用中国科学院所属单位深腾7000超级计算集群,以及中国科学院超级计算中心的技术团队,开发BLSCBIO云计算平台,加速国内基因测序的水平,提升基因测序软件的并行能力。     

生命科学DNA测序云计算平台

<正>i简介本项目通过和北京生命科学研究所、华大基因公司联合开发面DNA测序方向的云计算平台,利用中国科学院所属单位深腾7000超级计算集群,以及中国科学院超级计算中心的技术团队,开发BLSCBIO云计算平台,加速国内基因测序的水平,提升基因测序软件的并行能     

昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法取得重大突破

近日,昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法上取得新突破,这款针对三代测序技术的基因组装算法软件DBG2OLC测试表明,与目前用于三代测序最优秀的一些基因组装软件相比,DBG2OLC在计算时间和内存空间的消耗通常仅为其它算法的1/10。     

丹参与基因

中国医学科学院药用植物研究所的研究人员,利用第二代高通量测序技术对丹参全基因组进行测序,并完成丹参基因组框架图的组装。目前测序结果已覆盖92％的丹参全基因组和96％的基因编码区。     

基因测序的利弊

<正>在分子生物医学迅速发展的今天,基因测序是每个人都避不开的话题,因为人们的健康和疾病诊治需要基因测序。正式启动于1990年并初步完成于2005年的人类基因组计划曾耗资30亿美元,今天,随着测序技术的发展,对一个人进行全基因组测序只需要1000美元左右,时间只有一周左右。美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中宣布进行精准医学计划后,个人基因组测序更是迎来了大好的发展时机。但是,为什么要进行个人基因组测序以及这种测序有哪     

人到底有多少个基因？

基因这个词已经在我们的日常生活当中耳熟能详了,基因这个概念也已经有了1个多世纪的历史,人类基因组测序计划也已经取得了轰轰烈烈的成果,但是,人到底拥有多少个基因呢?这个答案却似乎越来越渺茫了,为什么呢?因为归根结底人们发现,问题出在我们还没有真正明白基因到底是什么。     

基因测序的是与非

正国家食品药品监督管理总局、国家卫生计生委日前联合发出通知,任何医疗机构不得开展基因测序临床应用,已经开展的要立即停止,仍继续开展的,卫生行政部门要依法依规予以查处。其实,这只是表面理由。深层的原因在于,基因测序在不同国家和地区都存在认识上的模糊和使用上的乱象。基因测序只是基因检测的方法之一,又称基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测     

浅析高通量测序过程质量监督管理

近年来随着高通量测序技术的不断发展和检测成本的持续下降,高通量测序也已经发展成为重要的临床基因分析技术。因此,对专业的技术人才、临床专家和信息分析人员的综合素质要求较高,同时也对实验室硬件设施及管理水平要求也提出了更高要求。为了保证检测结果的准确性,应建立测序全过程的质量控制体系,同时实施质量监督管理,及时识别检测过程中的质量风险。     

2013年最值得关注的十大热门技术

1.纳米孔基因排序2008年,DNA发现人之一詹姆斯·沃森的完整基因组排序用了4个月时间完成,耗资接近150万美元。现在,商业化的纳米孔基因排序技术已经近在眼前。借助于这项技术,完成排序只需要短短15分钟。这项技术是将数台测序机结合在一     

小鼠Endostatin基因的分子克隆、鉴定及双基因共表达质粒pEgr-IFNγ-Endostatin的构建

目的克隆小鼠内皮抑素(Endostatin)编码区cDNA序列及测序鉴定并构建pEgr-IFN(Y)-Endostatin双基因表达载体.方法从小鼠肝细胞提取总RNA,经逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增获得全长Endostatin基因,测序并利用基因重组技术构建pEgr-IFN(Y)-Endostatin双基因共表达质粒.结果分光光度计测定50倍稀释的总RNA抽提产物,A260=0.834,A280=0.407,A260A280=2.049,总RNA浓度为1.668g/L.EndostatincDNA的RT-PCR产物与载体pMD18T连接并经测序证实Endostatin序列与文献报道完全一致,并构建了含Egr-1启动子的IFNY和Endostain双基因共表达质粒pEgY-IFN(Y)-Endostatin.结论成功克隆小鼠Endostatin基因,构建了pEgr-IFN(Y)-Endostatin双基因共表达质粒.     

生物技术产业在中国崛起

中国已获得了一批具有知识产权的新基因、新表达系统，生物工程药物进入了创制阶段，建立了一系列关键平台技术、动、植物转基因技术已经成熟，具备了大规模基因测序和生物芯片、生物信息的研究条件。     

小鼠Endostatin基因的分子克隆、鉴定及双基因共表达质粒pEgr-IFNγ-Endostatin的构建

目的克隆小鼠内皮抑素（Endostatin）编码区cDNA序列及测序鉴定并构建pEgr-IFNγ-EndostatinA基因表达载体。方法从小鼠肝细胞提取总RNA，经逆转录一聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增获得全长Endostatin基因，测序并利用基因重组技术构建pEgr-IFNγ-EndostatinYT．基因共表达质粒。结果分光光度计测定50倍稀释的总RNA抽提产物，A260=0．834，A280=0．407，A260：A280=2．049，总RNA浓度为1．668g／L。EndostatincDNA的RT-PCR产物与载体pMD18T连接并经测序证实Endostatin序列与文献报道完全一致，并构建了含Egr-1启动子的IFNγ和DEndostain双基因共表达质粒pEgY-IFNγ-Endostatin。结论成功克隆小鼠Endostatin基因，构建了pEgr-IFNγ-Endostatin双基因共表达质粒。     

高通量测序技术在肿瘤临床上的应用

随着高通量测序技术的日渐成熟,技术原理和材料工程不断创新,基础科研在临床诊疗中的应用日趋广泛,NGS在癌症基因组学研究领域中的应用越来越广泛。最近,NGS已被用于临床肿瘤学以促进癌症的个体化治疗。本文列举了高通量测序技术在临床上的肿瘤诊断、治疗及预后方面的主要指导作用,并展望了其在肿瘤领域的应用前景。     

人DNA聚合酶Pol(ι)体细胞基因敲除载体的构建

应用体细胞基因敲除技术的方法和原理,通过PCR扩增获得同源短臂和长臂,将其插入骨架载体pPL622,酶切鉴定插入方向并测序确证,成功构建了人Polι基因的击靶载体PSP-PLA,其中同源短臂长980 bp,长臂长3 217 bp。     

上海生科院合作研究揭示复苏植物旋蒴苣苔的耐旱机理

<正>中科院上海生命科学院朱健康与其合作者通过测序获得了1.69 Gb的基因组草图,这是人们首次测序极端耐脱水的植物。基因组分析显示了进化过程中的两次全基因组加倍痕迹,也显示了大量的特有基因。该基因组含有49 374个蛋白编码基因,其中29.15%是旋蒴苣苔独有的基因,20%的基因在转     

《基因传：众生之源》

正在整个20世纪,有3项颠覆性的科学概念和技术应用把人类社会引领到新的历史阶段:"原子"的发现带来物理学的革命;"字节"的发现带来互联网的革命;"基因"的发现带来生物学的革命。基因既是遗传物质的基本单位,也是一切生物信息的基础,破解了基因的运行机制,也就破解了生命的奥秘。随着基因测序、基因克隆等基因技术的迅速发展,人类基因组计划也完成了