丹参与基因

中国医学科学院药用植物研究所的研究人员,利用第二代高通量测序技术对丹参全基因组进行测序,并完成丹参基因组框架图的组装。目前测序结果已覆盖92％的丹参全基因组和96％的基因编码区。     

家蚕从基因组到蛋白质组的研究

家蚕基因组计划实施以来,用DNA限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增片段多态性(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、微卫星序列长度多态性(SSR)等多种分子标记技术进行了家蚕基因组多态性分析,构建了家蚕分子连锁图谱;开展了家蚕基因组序列测定和功能基因的研究.在后基因组时代,蛋白质组研究是基因功能研究的重要内容.家蚕蛋白质组研究虽然刚刚起步,但已确立了家蚕蛋白质样品制备方法,利用双向电泳技术和图像分析技术进行了家蚕功能蛋白质研究.该文对家蚕基因组和蛋白质组的研究进展进行了综述.     

红水河鳙线粒体D-loop和Cyt b基因序列分析

研究了红水河野生鳙Aristichthys nobilis上游、中游和下游3个群体29个个体的线粒体控制区(D-loop)和细胞色素b(Cyt b)基因序列,通过PCR扩增与测序,分别获得了长度为823bp和1090 bp的D-loop和Cyt b基因片段。分析表明,D-loop序列共定义了15个单倍型,存在17个多态位点,发生转换4次,插入/缺失13次。Cyt b序列共定义了5个单倍型,存在7个多态性位点,发生转换2次,插入/缺失5次。两序列分析结果表明,群体间和群体内遗传距离较小,遗传变异的分子变异等级不显著。上、中、下游均有共享单倍型,3个群体间遗传分化不大。     

葡萄膜黑色素瘤中Rb和p16基因位点杂合性缺失和微卫星不稳定性的研究

目的检测葡萄膜黑色素瘤中Rb和p16基因位点的杂合性缺失（Loss of heterozygosity,LOH）和微卫星不稳定性（microsatellite instability,MSI）情况。方法采用PCR-SSLP-银染的方法,各选择Rb和p16位点三对多态性微卫星标记（人群中的杂合度在70%以上）,对15例葡萄膜黑色素瘤样本进行杂合性缺失和微卫星不稳定的研究。结果葡萄膜黑色素瘤Rb位点D13S153、D13S118、D13S119的LOH发生频率分别为53.3%、20%、26.7%,6个样本（40%）出现MSI现象;p16位点D9S171、D9S157、D9S942LOH的发生频率分别为6.7%、6.7%、20%,13.3%出现微卫星不稳定现象。结论Rb位点的LOH和MSI是葡萄膜黑色素瘤中常见的染色体改变,p16位点（LOH频率为26.7%）的基因变异需进一步研究证实。     

山东半岛东部地区精神分裂症13号染色体的基因扫描研究

目的通过微卫星遗传标记对精神分裂症患者及对照者的13号染色体进行扫描,查找精神分裂症关联区域。方法在13号染色体上间隔约10cM（厘摩）遗传距离选择14个微卫星遗传标记,对119例精神分裂症患者与119例正常对照者组成的DNA混合样本分别进行了基因扫描及分型。经过卡方（χ2）检验统计学分析。比较患者组与对照组每个等位基因蜂型比率的差异。结果在D13S265（13q31.3）位点患者与对照组等位基因频率差异存在显著性意义（P＜0.01）,结论山东半岛东部人群中精神分裂症患者的13号染色体上存在与本病的关联位点。     

昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法取得重大突破

近日,昆明动物所与美国马里兰大学在三代基因测序组装算法上取得新突破,这款针对三代测序技术的基因组装算法软件DBG2OLC测试表明,与目前用于三代测序最优秀的一些基因组装软件相比,DBG2OLC在计算时间和内存空间的消耗通常仅为其它算法的1/10。     

水稻第四号染色体精确测序完成

水稻是最重要的粮食作物之一,是世界约一半以上人口的主要口粮。水稻作为禾本科植物基因组研究的模式作物,具有十分重要的意义。中国科学院国家基因研究中心率先完成了国际水稻基因组计划的第4号染色体全长序列的精确测序,该成果已在英国的《自然》杂志发表。本文简要报告水稻基因组测序的意义和目前我国在这一领域已取得的进展,并着重介绍水稻基因组4号染色体精确测序和分析的成果。     

21号染色体：与黑猩猩疾病对比

2000年5月8日,人类基因组科学家绘制出了第21号染色体的基因图谱,对21号染色体所含的基因数的统计表明,它只有225个基因,是人类最小的染色体。染色体的号码是依染色体的长度,由长到短而定的。但为什么实际上21号染色体却是最短的呢?原来,在50年前定染色体号码时,因当时染色技术     

上海生科院合作研究揭示复苏植物旋蒴苣苔的耐旱机理

<正>中科院上海生命科学院朱健康与其合作者通过测序获得了1.69 Gb的基因组草图,这是人们首次测序极端耐脱水的植物。基因组分析显示了进化过程中的两次全基因组加倍痕迹,也显示了大量的特有基因。该基因组含有49 374个蛋白编码基因,其中29.15%是旋蒴苣苔独有的基因,20%的基因在转     

人类基因组和白血病的分化,凋亡诱导

一、人类基因组计划的提出及意义 人类基因的现代定义为:合成有功能的人体蛋白质多肽链或RNA所必需的全部DNA顺序。DNA是遗传信息的载体,其长度用碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)表示。人类基因组则是指人的24条染色体(22条常染色体和X、Y2条性染色体)上全部DNA所携带的遗传信息的总和,总长度为     

樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析

文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析,用Bioedit软件与Gen Bank数据库中相关植物的序列进行序列比对,并用MEGA6.0软件做系统进化树(NJ),运用Codon W软件计算密码子的RSCU值。通过PCR扩增获得了10种藏药材的长度为750bp的目的片段,通过序列比对发现cox3基因在不同植物中变异位点较少,序列比较保守;基于cox3部分基因序列构建的NJ树反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的补充;密码子偏好性分析发现,cox3基因偏好使用以AU结尾的密码子。樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析从序列比对分析、构建系统进化树、密码子偏好性分析水平上分析了cox3基因部分序列在樱草杜鹃等10种藏药材的差异,为植物cox3基因的功能、表达研究奠定了基础。     

明党参的遗传多样性研究

 对珍稀特有单种属植物明党参的4个居群的材料,从物种生物学及保护生物学的角度,对它们 的遗传多样性进行了研究和分析。研究结果表明：各居群染色体数目恒定(2n=20),核型类型均为2A型,居群间存在核型多型性,主要表现为染色体的杂合性及随体染色体的位置也有一定变化。采用淀粉凝胶电泳方法,分析了10个酶系统,获得19个基因位点的资料,分析结果表明：居群的遗传变异处于较低水平,多态性位点比率P=33.35％,等位基因平均数A=1.43,等位酶基因多样度指数 Ho：0.03,He=0.07。总的基因位点变异中,有58％的变异来自于居群间,42％的变异存在于居群内,居群杂合体过量的位点仅为13％。偏东部居群的遗传多态性比西南部居群高。根据明党参居群遗传变异式样并结合相关研究,提出了其遗传多样性保护策略。     

两院院士评出2002年中国和世界十大科技进展新闻

中国科学院学部联合办公室、中国工程院学部工作部等联合主办，宋键、路甬祥、徐匡迪等５６８位中国科学院院士和中国工程院院士投票评选出２００２年中国十大科技进展新闻和世界十大科技进展新闻。２００２年中国十大科技进展新闻一、我国科学家率先绘制出水稻基因组精细图和水稻第四号染色体精确测序图中科院基因组信息学中心等单位完成的水稻基因组精细图，覆盖了籼稻９７％的基因序列，其中９７％的基因被精确地定位在染色体上；覆盖基因组９４％染色体定位序列的单碱基准确性达９９．９９％，已达到国际公认的基因精细图标准。中科院国…     

理性面对“基因和基因组“

面对人类基因组,我们既是客体,也是主体,这种两重性将深刻影响人类自身.伴随着人类和其他一些生物种属(如模式生物等)基因组测序和作图的初步完成,以功能基因组为中心的探索已经大规模展开.结构和功能基因组学概念的提出,促使人们在全基因组的框架下,以全新的视角研究、认识和理解基因与基因组的生物学涵义及人类学的尊严.其中,人类基因组测序被称为这个时代最具突破性的科学事件.……     

重要农艺性状的全基因组关联分析取得进展

北京基因组所／上海生科院植生生态所韩斌课题组,通过与中国水稻所、中科院遗传与发育所等单位的研究人员合作,结合第二代测序技术和自主开发的基因型分析方法。对517份中国水稻地方品种材料进行测序,构建了高密度的水稻单体型图谱（HapMap）,并对籼稻品种的14个重要农艺性状进行全基因组关联分析,     

基因测序的利弊

<正>在分子生物医学迅速发展的今天,基因测序是每个人都避不开的话题,因为人们的健康和疾病诊治需要基因测序。正式启动于1990年并初步完成于2005年的人类基因组计划曾耗资30亿美元,今天,随着测序技术的发展,对一个人进行全基因组测序只需要1000美元左右,时间只有一周左右。美国总统奥巴马在2015年国情咨文演讲中宣布进行精准医学计划后,个人基因组测序更是迎来了大好的发展时机。但是,为什么要进行个人基因组测序以及这种测序有哪     

美科学家绘出玉米基因组草图

美国科学家2月28日在华盛顿宣布,他们成功测序得出了玉米基因组的草图,这是人类成功测序的第二种农作物基因组,第一种被测序的农作物是水稻。科学家们以代号为B73的高产玉米品种为研究对象,完成了约95％的基因组测序工作。结果显示,玉米基因组的基因数量为5万至6万个,碱基对数量大约为20亿个。相比之下,水稻基因组的规模要小得多,仅有大约4．3亿个碱基对。今后科研人员就可以更加准确、高效地研究玉米的基因组,培育玉米新品种,提高玉米产量,增强玉米的抗旱、抗病虫害能力。玉米基因组测序项目始于2005年,美国全国科学基金会、农业部、能源部为这个项目提供了2950万美元的经费。     

首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布．第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究的目的是建立韩国人标准染色体数据库。研究人员期待,在染色体碱基序列图谱基础上进一步分析韩国人特有的遗传特性．有助于探明韩国人种发病率较高的遗传性疾病的病因,找到后基因时代的解决办法。研究还发现,金圣镇的染色体具有323万个单核苷酸多态性位点．     

人DNA聚合酶Pol(ι)体细胞基因敲除载体的构建

应用体细胞基因敲除技术的方法和原理,通过PCR扩增获得同源短臂和长臂,将其插入骨架载体pPL622,酶切鉴定插入方向并测序确证,成功构建了人Polι基因的击靶载体PSP-PLA,其中同源短臂长980 bp,长臂长3 217 bp。     

高通量序列分析人类乳腺癌和正常细胞的串联3’UTRs的差分全基因组剖析

由可变聚腺苷酸化产生的串联3’UTRs在基因表达中发挥重要的作用,可在细胞内影响mRNA稳定性、翻译和移位。多项研究已发现在多种生理状态下出现可变聚腺苷酸化位点切换。然而．这些研究仅聚焦于两个已知可变聚腺苷酸化位点和几个候选基因。在这里．我们报道了一种利用最新的第二代序列分析技术在全基因组范围内研究可变聚腺苷酸化位点,