蛋白质序列的一种新的二维图形表示

基于氨基酸的五字母模型,提出蛋白质序列的一种二维图形表示方法,然后证明这种图是非退化的.最后用该方法给出了8个物种的β球蛋白序列的图形表示.     

蛋白质序列的一类新的二维图形表示及其应用

基于20种氨基酸的一种5-字母模型,提出了蛋白质序列的一类CGR图形表示,并在此基础上给出蛋白质序列的一种36维向量表示.对11个物种的β球蛋白序列的相似性分析证实了我们的方法的有用性.     

DNA分类方法的探讨

ＤＮＡ序列分类的方法有很多种．本文给出了两种模型都是在图象的基础上，利用图象的直观、易于分析等优点，找到各种碱基不同的特征，得出一个比较合理的方法． 在建立模型时，先计算出给定的前２０种ＤＮＡ序列中各碱基Ａ，Ｇ、Ｃ、Ｔ的含量 （将一串长序列简化成了四个百分含量数值，大大简化了序列），并以此含量为数据作出直角坐标系下的二维曲线．根据曲线的特征，得出了两个算法，一个是以其中的一个ＤＮＡ序列中碱基的含量大于其它三种含量为特征分出类别，对２１至４０种序列的分类正确率达到 ８０％，对于题中所给的 １８２种序列分类正确率为 ４２％；另一个是通过转化曲线为直线的方法找出符合分类特征的区间，根据是否在此区间内而分出类别，对２１至４０种序列的分类正确率达到１００％，对于题中所给的１８２种序列分类正确率为８５％． 最后，通过对比两种模型的结果，判断出两种模型的优劣，并分析了其中的原因．     

神经网络模型对DNA序列分类问题的应用

从一个具体的DNA序列的分类问题出发,介绍应用感知器、BP网络和学习向量量子化神经网络模型解决识别问题的理论和算法.并且给出用MATLAB软件中的神经网络工具箱解决DNA序列分类这一具体问题的方法.     

基于BWT的DNA序列数值刻画及其应用

生物序列的数值刻画在对生物学数据进行分析方面有着重要的作用。通过对DNA序列的BWT序列进行分块处理,给出了DNA序列的一种7维向量表示,利用correlation函数计算序列之间的相似性,并把这种方法应用到15个物种的β球蛋白基因及12个汉坦病毒的相似性分析中。     

有关DNA指纹技术的几点思考

人教版必修二第58页“科学·技术·社会”部分介绍了DNA指纹技术,并配有DNA指纹图谱。思考之后不禁有这样的疑惑：DNA指纹图谱上的条带是否包含了所有的DNA序列？哪一部分是基因,哪一部分是非基因呢？人类都有相似的基因,酶解后DNA为什么条带位置不一样呢？带着这些疑问,查阅了大量资料之后发现要弄清这些问题首先要明确以下内容。     

DNA序列判读中的几个问题

通过对DNA序列判读过程中几个容易被忽视的问题的分析，提出了解决问题的方法以及进行序列正确判读的步骤。     

鱼类线粒体DNA研究技术在鱼类系统中的应用

鱼类线粒体DNA研究是80年代中期兴起的一项分子生物学研究技术。该技术在鱼类系统学中得到了很好的应用。本文综述鱼类线粒体DNA研究技术在鱼类系统学中的应用。     

2007年上海高考试题两个问题的商榷

1.(第40题B部分)下图表示人体内糖类、脂肪和蛋白质部分代谢途径,图中A、B、C、D、E、F、G表示物质,①、②、③、④表示过程。(3)在过程①、②、③、④中,释放能量最多的是____,需要消耗能量的是______,需要消耗氧气的是________。商榷之处:试题答案认为需要消耗能量的只有过程④,事实上,过程①也有能量的消耗。尽管一分子葡萄糖分解成2分子丙酮酸,得2分子ATP,但是在葡萄糖的磷酸化过程,以及果糖-6-磷酸的磷酸化过程中都要先消耗ATP,因此,我们不能认为糖酵解过程不需要消耗ATP,因为没有ATP供给葡萄糖就不可能转变成果糖—1,6—二磷…     

利用已知微卫星引物寻找目的DNA

利用聚合酶链式反应(PCR)方法特异性扩增河北省饶阳县大仓鼠(Circetulvs triton)基因组DNA通过琼脂糖凝胶电泳检测以期出现特异性条带，可以进一步回收进行序列分析．     

Graphical Representation of Missing Data Problems

Rubin’s classic missingness mechanisms are central to handling missing data and minimizing biases that can arise due to missingness. However, the formulaic expressions that posit certain independencies among missing and observed data are difficult to grasp. As a result, applied researchers often rely on informal translations of these assumptions. We present a graphical representation of missing data mechanism, formalized in Mohan, Pearl, and Tian (2013). We show that graphical models provide a tool for comprehending, encoding, and communicating assumptions about the missingness process. Furthermore, we demonstrate on several examples how graph-theoretical criteria can determine if biases due to missing data might emerge in some estimates of interests and which auxiliary variables are needed to control for such biases, given assumptions about the missingness process.     

用基于模糊聚类的Kruskal算法构建进化树

对线粒体DNA序列可通过图形表示及计算曲线的散度均值来构造模糊论中的相似矩阵，基于这些，提出一种新的方法：用模糊聚类图论法中的Kruskal算法来进行系统进化树的重构，并选取了8个物种的线粒体DNA序列来说明此方法．     

图示法在定积分中的应用

定积分是高等数学中最重要的内容之一，图示法是一种直观的解题方法，现从多个方面介绍图示法在定积分中的应用。     

浅谈二语习得者的心理表征和语言表征

从心理语言学的角度对母语习得者与二语习得者的心理表征进行了比较,提出两者在本质上是一致的;分析了二语习得者语言表征的构成和词汇学习的过程,指出语言表征是心理表征的语言实现;认为大学英语课堂教学应重视语言输入和输出过程,并以概念为中心引导学生避开母语的干扰作用。     

认知加工中的表象表征与命题表征

表象是人认知加工构建的基础,不同材料（字符、数字、汉字和图形）在认知加工中存在表象表征与命题表征的方式,根据加工材料难易的不同,表象表征与命题表征在认知加工中所占比例不同,二者可以进行相互的转化。表象表征的容量有限,大小为4个组块。     

双语词汇表征研究概述

文章主要对双语词汇表征的几个模型以及与各模型相关的一些实证研究进行了简要回顾，提出了双语词汇表征研究仍然存在的一些问题，以期人们对该领域的研究现状有更清晰的了解。     

Scaling behavior of nucleotide cluster in DNA sequences

In this paper we study the scaling behavior of nucleotide cluster in 11 chromosomes of Encephalitozoon cuniculi Genome. The statistical distribution of nucleotide clusters for 11 chromosomes is characterized by the scaling behavior of P（S） ∝ e^-αs＇ where S represents nucleotide cluster size. The cluster-size distribution P（S1＋S2） with the total size of sequential C-G cluster and A-T cluster S1＋S2 were also studied. P（S1＋S2） follows exponential decay. There does not exist the case of large C-G cluster following large A-T cluster or large A-T cluster following large C-G cluster. We also discuss the relatively random walk length function L（n） and the local compositional complexity of nucleotide sequences based on a new model. These investigations may provide some insight into nucleotide cluster of DNA sequence.     

头孢替唑钠合成路线图解

头孢替唑钠2002年开始在我国应用,用量逐年增长,目前国内生产厂家较少。头孢替唑钠的分子结构中,头孢烯酸的7_氨基部分连接的为1H_1_四氮唑乙酰基(A部分),3_亚甲基部分连接的为1,3,4_噻二唑_2_硫醚基(B部分),我们根据其A、B部分在合成过程中引入的先后顺序,对其合成路线进行了图解。     

有限群表示特征标的几个基本性质

特征标是在群上定义的一个函数,它完全刻划了群的表示.文中通过对有限群表示特征标的基本性质的归纳和证明,得到关于群表示的简单而本质的数量化信息.