基于差异分析的方法挖掘肺腺癌不同时期的功能

肺腺癌是一种动态多样的疾病,在临床上可分为四个时期。通过研究肺腺癌不同时期基因表达与功能的特点,有助于理解肺腺癌的发生发展机制。从Array Express数据库下载肺腺癌不同时期的基因表达数据并进行整合,使用R语言Limma包筛选差异表达基因,对差异表达基因进行功能富集分析。肺腺癌分期数据整合后得到10998个基因和1102个样本。差异表达基因在I期的调控方式与其它时期不同,在I期上调(下调)的基因在II期、III期和IV期将下调(上调)。通过疾病富集分析挖掘到诸如AGER、TOP2A、CCNB1、AUR KB等与肺腺癌发生发展有很大相关性的基因。差异表达基因在肺腺癌不同时期的表达与功能不同,可能与肺腺癌的发展相关。     

黑猩猩为什么不如人

黑猩猩是与人类关系最近的“表亲”，但尽管两者携带遗传信息的DNA序列有９８．７％存在相似，其行为与思维等特征却明显不同，这颇让人费解。一个欧美科学家小组的最新研究成果，通过揭示人类与黑猩猩在大脑基因活动模式上所存在的显著差异，为此找了部分答案。德国、美国和荷兰研究人员发现，形成黑猩猩与人类之间差别的主要原因，不在于基因或蛋白质结构本身，而更多体现在基因表达和蛋白质表达上。科学家们还发现，黑猩猩和人类在大脑基因表达方式方面的差异，要大于两者身体其它部位。科学家们对比较结果进行分析后认为，在数百万年…     

DNA芯片—21世纪的新技术

ＤＮＡ芯片技术是９０年代期发展起来的分子生物学新的研究工具。它利用照相平板印刷,寡核苷酸合成以及微加工技术制成含有高密度探针的芯片,与放射性同位素或荧光标记的待测ＤＮＡ样品进行分子杂交,通过计算机检测技术,用于分析ＤＮＡ多态性、发现新基因及基因表达差异等领域。     

全球第一个肝癌基因图谱在港面世

香港大学肝病研究中心利用微型基因晶片描绘出肝癌的基因表达全图。这个基因表达全图为世界上第一个有关肝癌基因表达数据的图谱。据香港大学外科学系肝胆胰外科研究助理教授张兆恬介绍 ,基因微排列是新发展的研究技术 ,香港大学利用高度精确的自动仪器将 2 3万个不同的 c DNA固定在玻璃片上 ,从而制成微型基因晶片。有了基因晶片后 ,只需少量肝癌细胞就可以描绘出肝癌基因图谱。利用微型基因晶片描绘出的肝癌基因图谱 ,有助辨认出肝细胞的恶性特征 ,鉴别出每个肿瘤的独特性 ,从而可深入地了解肝癌的致病原因和发病机理 ,并且可为病人及早…     

Livin基因在肝癌中的表达及意义

本文旨在研究Livin基因在肝癌组织中的表达,探讨此基因表达与临床病理特征之间的关系。应用定量RT-PCR法检测30例肝癌组织和其相对应的癌旁组织中Livin基因mRNA的表达情况。在30例肝细胞肝癌组织中,Livin基因的表达均高于癌旁组织(P<0.05)。可以认为Livin基因表达与肝细胞肝癌的发生和发展密切相关,并可能起协同作用。     

产学研合作对共性技术创新的影响效用研究

以生物技术领域为例,在运用平均技术共现率（MTCR）和平均技术共类指数（MTCI）对生物技术领域专利技术进行共性特征的分析基础上,引入倾向得分匹配方法,对相同基本特征下的产学研合作专利、企业-企业合作专利、企业单独申请专利的技术共性特征进行了比较研究,实证检验了产学研合作对生物技术领域产业共性技术创新的影响效用。结果表明,产学研合作对生物技术领域共性技术研发创新有显著的正向影响,同时不同技术领域以及不同国别的产学研合作创新效应存在显著差异。在发挥产学研合作积极作用的同时,应考虑不同技术领域特点和区域政策的情景差异,从而实现产业共性技术突破,提升产业竞争力。     

知识基因视角下的技术融合机会发现研究

如何从多领域技术交叉融合过程中发现技术机会,预测具有创新性的技术组合关系,对企业进行新产品和服务的研发具有重要价值。针对现有研究仅从本领域识别技术机会以及传统外推方法预测结果局限性、数据时滞导致的结果失准等问题,提出以功能需求为导向,在广泛获取多领域技术解决方案的基础上,实现面向未来的技术融合机会研究,并建立了系统的知识基因视角下的技术融合机会研究框架,提高了技术机会发现的科学性和准确性。首先,采用结构主题模型(structural topic model,STM)方法从在线评论中提取产品功能需求,作为技术基因表达的性状特征;其次,将主—谓—宾(subject-action-object,SAO)短语与技术—关系—技术(technology-relationship-technology,TRT)短语语义分析方法相结合,从专利中提取多领域技术基因,获取技术基因特征要素并完成基因库构建;最后,采用STM方法识别专利中具有融合倾向的技术类别,将其与基因库中的技术要素进行比对,结合专家知识从基因库中筛选具有融合倾向且具有表达为产品性状特征潜力的目的基因,作为潜在技术融合机会,并将目的基因与产品原有技术方案融合,验证技术融合机会。以老年智能可穿戴式跌倒报警产品为研究对象挖掘出85个具有融合前景的目的基因,即85个技术融合机会,结果表明,知识基因的引入提高了技术融合创新过程的可行性和有效性,预测结果更精准。     

初发性系统性红斑狼疮患者外周血及T、B淋巴细胞疾病相关基因的筛选及鉴定

目的寻找在SLE分子发病机制中起关键作用的致病基因的候选基因。方法通过高密度基因芯片技术，得到初发性SLE患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群的基因表达谱，在差异表达显著的基因中挑选4个位于SLE易感区段的基因，通过TaqMan实时PCR技术在55例SLE患者中验证基因的差异表达。结果得到初发性SLE患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群的基因表达谱，确定TRIM，KLRCl，IL-4R及EGR-1基因为SLE易感基因的候选基因，实时PCR结果证明：SLE患者外周血单核细胞中，TRIM基因△Ct值显著低于正常人对照（P〈0．05），基因表达水平为正常对照的2．43倍，IL-4R基因与EGRl基因的△Ct值显著高于正常人对照（P〈0．05），基因表达水平分别为正常对照的0．33倍、0.26倍，KLRCl基因的△Ct值显著高于正常人对照（P〈0．01），基因表达水平为正常对照的0.56倍，在SLE患者外周血T细胞亚群中，TRIM基因△Ct值显著低于正常人对照（P〈0．01），基因表达水平为正常对照的2．94倍，IL4R基因与EGRl基因的△Ct值显著高于正常人对照（P〈0．01），基因表达水平分别为正常对照的0.32、0.21倍，LRCl基因的△Ct值显著高于正常人对照（P〈0．01），基因表达水平为正常对照的0.56倍。在SLE患者外周血B淋巴细胞亚群中，由于B细胞淋巴亚群所占淋巴细胞比率过低，基因检测数据不稳定，故未作统计学分析。结论在系统性红斑狼疮的发病中，患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群细胞基因表达水平发生了改变，主要集中于-系列免疫相关基因，其中TRIM，KLRC1，IL-4R及EGR-1基因在患者群中变化显著，初步断定为SLE易感基因的候选基因。     

作物杂种优势基础研究的进展

利用作物杂种优势提高产量是 2 0世纪农业科学的重大创举。相对于作物杂种优势的利用来说 ,杂种优势遗传基础的研究进展缓慢。回顾了杂种优势遗传基础研究的现状与进展 ,从遗传差异、基因效应、基因表达等几个方面分析杂种优势的遗传基础 ,并对深入开展杂种优势的基础研究提出了意见和建议。     

初发性系统性红斑狼疮患者外周血及T、B淋巴细胞疾病相关基因的筛选及鉴定

目的寻找在SLE分子发病机制中起关键作用的致病基因的候选基因.方法通过高密度基因芯片技术,得到初发性SLE患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群的基因表达谱,在差异表达显著的基因中挑选4个位于SLE易感区段的基因,通过TaqMan实时PCR技术在55例SLE患者中验证基因的差异表达.结果得到初发性SLE患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群的基因表达谱,确定TRIM,KLRC1,IL-4R及EGR-1基因为SLE易感基因的候选基因,实时PCR结果证明SLE患者外周血单核细胞中,TRIM基因△Ct值显著低于正常人对照(P＜0.05),基因表达水平为正常对照的2.43倍,IL-4R基因与EGR1基因的△Ct值显著高于正常人对照(P＜0.05),基因表达水平分别为正常对照的0.33倍、0.26倍,KLRC1基因的△Ct值显著高于正常人对照(P＜0.01),基因表达水平为正常对照的0.56倍,在SLE患者外周血T细胞亚群中,TRIM基因△Ct值显著低于正常人对照(P＜0.01),基因表达水平为正常对照的2.94倍,IL4R基因与EGR1基因的△Ct值显著高于正常人对照(P＜0.01),基因表达水平分别为正常对照的0.32、0.21倍,LRC1基因的△Ct值显著高于正常人对照(P＜0.01),基因表达水平为正常对照的0.56倍.在SLE患者外周血B淋巴细胞亚群中,由于B细胞淋巴亚群所占淋巴细胞比率过低,基因检测数据不稳定,故未作统计学分析.结论在系统性红斑狼疮的发病中,患者外周血单核细胞及T、B淋巴细胞亚群细胞基因表达水平发生了改变,主要集中于一系列免疫相关基因,其中TRIM,KLRC1,IL-4R及EGR-1基因在患者群中变化显著,初步断定为SLE易感基因的候选基因.     

基于引文内容分析的交叉领域知识内化过程研究

【目的/意义】不同学科知识的相互整合是交叉研究领域形成和发展的基础。对交叉领域知识整合过程的理解有助于促进交叉领域的知识发现和知识创新。【方法/过程】本文利用自然语言处理技术,从交叉领域文献题录数据、引文上下文和参考文献文本信息中抽取知识短语,以引证关系和词汇匹配关系为线索,提出吸纳知识和内化知识的识别方法,深入揭示交叉领域中“知识吸纳-知识内化”的知识整合过程。【结果/结论】以电子健康领域（eHealth）为例,揭示了该领域的知识内化总体特征和不同来源学科所提供知识的内化特征差异。【创新/局限】本文结合引文内容对交叉领域知识内化过程进行量化分析,提出了一种新颖的全文本量化分析方法,为理解交叉领域的知识生长过程提供了新的视角和分析方法。未来研究可以结合参考文献全文以进一步优化这一方法,同时在更多的交叉研究领域开展实证。     

“后基因组时代”的营养学研究

飞速发展的基因科技，已将我们带入了“后基因组时代”，伴随着基因组学、转录组学的迅链发展，营养学的研究转向了研究营养与基因的相互作用，即营养基因组学。我们每个人自身的基因不同，某种特定的食物不见得对每个人有相同的“好处”或“坏处”。要决定健康，关键要看基因和营养二老的相互作用。通过单核苷酸多态性，以及可以快速检测出mRNA水平的高通量基因表达谱，研究音可以更全面，更深入地了解营养与基因表达的关系，帮助指导人们根据自己的“基因要求”，合理的搭配营养，实现营养个体化。     

"后基因组时代"的营养学研究

飞速发展的基因科技,已将我们带入了"后基因组时代",伴随着基因组学、转录组学的迅猛发展,营养学的研究转向了研究营养与基因的相互作用,即营养基因组学.我们每个人自身的基因不同,某种特定的食物不见得对每个人有相同的"好处"或"坏处".要决定健康,关键要看基因和营养二者的相互作用.通过单核苷酸多态性,以及可以快速检测出mRNA水平的高通量基因表达谱,研究者可以更全面,更深入地了解营养与基因表达的关系,帮助指导人们根据自己的"基因要求",合理的搭配营养,实现营养个体化.     

碘酸钾和碘化钾对大鼠肝脏SIRT1 mRNA表达的影响

目的:观察不同剂量的碘酸钾和碘化钾对大鼠肝脏SIRT1基因表达的影响。方法:根据喂养碘剂和剂量不同将Wistar大鼠随机分为8组,即:适碘组(KI、KIO3),10倍高碘组(10KI、10KIO3)、50倍高碘组(50KI、50KIO3),100倍高碘组(100KI、100KIO3)。喂养半年后,利用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)分析大鼠肝脏SIRT1基因表达水平。结果:适碘组中,SIRT1在KI组中的mRNA表达量高于KIO3组,P<0.05;10倍剂量组中,SIRT1在10KI组中的基因表达水平明显高于10KIO3,P<0.01;50倍和100倍剂量组中,SIRT1的基因表达量在两种不同碘剂组中没有统计学差异,P>0.05;不论摄入何种碘剂,SIRT1在高剂量碘组中的基因表达量均高于适碘组。结论:高剂量的碘化剂和碘酸钾均可上调大鼠肝脏SIRT1基因表达量,肝脏SIRT1基因的表达上调可能是机体改善高碘致高脂血症的一种重要的分子机制。     

扩频非对称数字水印研究

作为数字水印领域的新的研究方向,非对称性水印因其嵌入水印信息使用的私钥与检测时使用的公钥的不同,在许多领域更加符合人们的要求。本文对非对称性水印的特征进行了分析,并对扩频非对称性水印算法进行了分析。     

基于动物纤维素酶基因工程的科学前沿动态可视化方法研究

为了系统、全面、准确地反映国内动物基因工程研究演进及知识结构,以CNKI为平台,采用多元统计等 可视化方法,在分时段分析国内该领域前沿热点特征的同时,增加对该研究密切相关的非热点主题的观察.结果显示:相关研究主要集中于纤维素酶产生菌的分离鉴定,纤维素基因的克隆、表达;纤维素酶基因的筛选集中于天牛、白蚁等真核生物;纤维素酶基因的研究更多集中于实际研究方法学的改进,建立宏基因组文库对瘤胃中产纤维素酶的微生物进行研究.通过精确检索,多视角科学观察,为该领域科研人员提供了科学决策参考依据.     

基于基因表达式编程的高层建筑物变形预测

近年来,随着我国城市化的加速发展,大量的高层建筑物随之产生,其安全问题也日益受到人们的关注,高层建筑物的变形问题就是其中之一,而常用的预测方法对高层建筑物变形监测存在一些不足。基因表达式编程是一种基于生物基因结构而发明的一种新型自适应演化算法,已经在金融、气象和灾害预警等领域广泛应用。因此,本文将探讨基因表达式编程在高层建筑物变形预测中的应用。     

基于知识基因表达的科技创新路径构建研究

[目的/意义]随着信息的爆炸性增长,科研人员摄取信息的途径越来越多,但对知识的控制能力越来越弱。因此,不论信息如何变化,科研人员需要抓住知识基因的进化过程(科技创新路径)寻找有价值知识,极大提高知识利用效率。[方法/过程]在前期充分辨析科技文献知识基因的基础上,根据科技文献知识基因的特征将科技文献知识基因分为通用知识基因与特定知识基因两种类型。提出利用知识基因表征科技创新路径的节点,根据知识流动的特点,将科技创新路径划分为基于知识基因扩散与知识基因流动的科技创新路径。通过计算知识基因之间遗传或变异的关系,嫁接引用路径构建出知识基因表达的科技创新路径,并通过知识基因间的连线实现可视化表达。[结果/结论]通过阿尔茨海默病领域实验证明,基于知识基因表达的科技创新路径能够从科技文献核心知识价值传承与发展的角度直观地展示出科技创新发展与演化过程。     

伯氏螺旋体在小鼠宿主中的关节特异性转录谱

目的建立伯氏疏螺旋体感染的小鼠模型,研究伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中的关节特异性基因表达谱。方法首先,建立伯氏疏螺旋体感染小鼠模型,在不同时间点处死小鼠,收集小鼠关节、心脏、皮肤和膀胱组织,从四种组织中分别提取总RNA;随后,用DECAL技术和微阵列技术分析不同时间点伯氏疏螺旋体在四种组织中的转录组;最后,将伯氏疏螺旋体在关节中的转录组依次与其他三种组织中的转录组进行比较,找出仅在关节中表达的伯氏疏螺旋体基因,从而获得伯氏疏螺旋体不同时间点的关节特异性基因表达谱。结果与其他组织相比,在感染后第15天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达21个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,8个基因位于质粒上;在感染后的第105天,伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织特异地表达24个基因,其中13个基因位于伯氏疏螺旋体染色体上,11个基因位于质粒上。结论伯氏疏螺旋体在小鼠关节组织中存在独特的基因表达谱,这些在关节中特异表达的基因可能与莱姆关节炎的发生、发展有关。     

教育经历对中国高层次科技人才成长的影响分析——以能源领域为例

本文以中国能源领域中杰出青年科学基金获奖者为研究对象,通过对其教育背景特征的分析,研究探讨了在高层次科技人才成长过程中,人才流动的一般规律,以及在不同的教育环境下,高层次科技人才在学术产出方面所表现的不同特征,以期为我国高层次科技人才的培养和教育提供相关借鉴.