已报道的全基因组选择性消除分析中发现IGF2BP2基因的插入/缺失变异与山羊产羔数相关（英文）

目的:验证IGF2BP2插入/缺失与陕北白绒山羊产羔数之间的关系,并选择有利的等位基因。创新点:首次筛选、验证山羊IGF2BP2基因的In Del位点,确定其与山羊产羔性状的相关性及作用,为山羊经济性状改良及新品种培育提供理论依据。方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(q RT-PCR)方法分析IGF2BP2在单羔组和多羔组中的表达水平;通过PCR扩增-琼脂糖凝胶电泳在918只陕北白绒母山羊中鉴定IGF2BP2基因P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp缺失/插入位点基因型,并进行测序以验证突变;利用SHEsis平台分析两个位点的连锁不平衡;采用方差分析(ANOVA)和χ2检验分析山羊IGF2BP2基因变异与产羔数的关系;并利用在线数据库预测转录因子(TF)和突变区域序列的结合。结论:本研究发现,IGF2BP2的m RNA表达水平在单羔组明显高于多羔组。在陕北白绒母山羊中验证了IGF2BP2基因内的插入/缺失(indels),包括P4-Ins-13bp和P5-Del-12bp。χ2检验表明,P4-Ins-13bp基因型(χ2=14.479,P=0.006)在单羔和多羔组间分布差异显著;相关分析表明,P4-Ins-13bp与山羊产仔数显着相关(P=0.022),具有缺失/缺失(DD)基因型的山羊个体产仔数高于其他山羊。因此,IGF2BP2基因的P4-Ins-13bp突变可作为一种潜在的与繁殖性状显著相关的分子标记,以优化母羊繁殖力,提高山羊产业的经济效益。     

水稻基因插入/缺失多态性分析及模拟遗传图谱构建

为构建水稻基因组模拟遗传图谱、开发基于基因的分子标记利用籼粳间序列多态性数据,在SQL数据库中查询获取基于基因的InDel标记.共获得12 649个水稻非转座子编码基因的22 818个InDel位点,InDel大小在6 bp到85 bp之间,非常适合于共显性PCR标记的开发,同时发现水稻染色体臂及大多数着丝区序列位置和遗传图距存在线性相关,以此构建了包含高密度基于基因的InDel标记的模拟遗传图谱,可为水稻的分子育种和遗传作图提供理论和应用参考.     

毕赤酵母直接基因敲除方法的研究

甲醇营养型巴斯德毕赤酵母已被广泛应用于外源蛋白的表达,但是作为一个外源蛋白表达系统,其还有待进一步完善。进一步提高外源蛋白的表达量以及形成折叠正确的目的蛋白,成为了改造毕赤酵母菌株的一个热点。基因缺失,是一个常用的改造和构建新的毕赤酵母重组菌株常用的方法。巴斯德毕赤酵母直接基因缺失方法主要分为两类:有标记的插入替换和无标记的Pop-In/Pop-Out。本文系统地介绍了这两种方法,分别比较了各自的优缺点,为它们在巴斯德毕赤酵母中进行基因敲除提供了一定参考意义。     

一种高效的柑橘绿霉菌基因敲除体系的构建(英文)

研究目的:提高柑橘绿霉菌基因敲除效率。创新要点:低效的基因敲除与丝状真菌非同源末端链接(NHEJ)的DNA双链断裂修复途径有关。为提高柑橘绿霉病菌基因敲除效率,本研究利用农杆菌介导的转化体系,获得NHEJ途径中关键因子Ku80的缺失突变体(ΔPdKu80)。研究方法:与野生型菌株相比,以ΔPdKu80作为出发菌株,提高柑橘绿霉病菌PdbrlA和PdmpkA的基因敲除效率(见表1)。重要结论:ΔPdKu80的营养生长、产孢和致病性与野生型菌株基本一致。ΔPdKu80作为出发菌株,能显著提高柑橘绿霉菌的敲除效率。     

032基因缺失猪痘病毒载体的构建及鉴定

目的:构建毒力减弱的猪痘病毒载体.方法:以猪痘病毒野生毒株NT1501株为亲本毒株,通过同源重组方法,构建缺失032毒力基因的猪痘病毒SPV△032.检测SPV△032在不同种属来源细胞系中的培养滴度,并通过动物试验来检测其毒力.结果:猪痘病毒SPV△032株与野生NT1501株在PK15和ST等猪源细胞中的培养滴度差异不显著,均可达到5.0×106 TCID50左右.猪痘病毒SPV△032株在Vero、MDBK等其他物种来源的细胞系中不能进行复制,连续传代2～3代以后,细胞培养物中检测不到猪痘病毒基因,与野生NT1501株培养结果一致.动物试验结果表明,用高浓度SPV△032接种实验猪,接种部位皮肤未出现任何症状,比野生NT1501株的毒力显著降低.接种SPV△032实验猪的细胞免疫和体液免疫反应水平均显著高于野生NT1501株(P＜0.05).接种SPV△032的实验猪不会通过粪便等途径向环境中排毒.结论:本研究构建了032基因缺失猪痘病毒SPV△032,该病毒的毒力与野生NT1501株相比显著下降,可以作为弱毒猪痘病毒载体,用于兽用疫苗研发.     

玉米的分离规律与自由组合规律实验

<正> 1 实验原理位于同源染色体上的一对杂合等位基因在配子形成时彼此分离,产生两种不同基因型的配子。当带有不同等位基因的雌雄配子随机结合,就会使得由这一对基因所决定的相对性状在下一代呈现3:1的分离比例。而分别位于非同源染色体上的非等位基因在配子形成时,     

92R137抗条锈病基因推导和SSR标记

利用抗病品种是防治小麦条锈病最好的途径.采用基因推导的方法,根据对13个具有不同毒性基因组合的条锈菌系的反应,在已知的19个抗条锈基因中,推导92R137含有Yr26,陕160不含任何已经的抗条锈基因.构建陕160×92R137的F2群体,进行抗病性鉴定和SSR标记.抗病、感病比例符合孟德尔一个基因3:1的分离比.在l9对SSR引物中,Xgwml8在抗病池扩增出双亲的标记带,而在感病池中不能扩增出抗病亲本的标记带,仅扩增出感病亲本的标记带,通过在F2单株的验证,确定抗亲的标记条带就是Yr26基因的分子标记.     

引入概率妙解题

例1 C⁰_n+1/2C¹_n+1+1/4C²_n+2+1/8C³_n+3+…+1/2ⁿCⁿ_2n=2ⁿ.分析·解构造概率模型:有两盒火柴,每盒n根,现从任一盒中取一根火柴,经过一段时间,发现一盒火柴已取完,求另一盒恰有k根火     

两种亚洲百合的核型分析

利用染色体常规压片法,对亚洲百合杂种系的两种百合进行了核型分析,结果表明:克得利亚(Cordelia)的染色体核型公式2n=2X=24=2m+4sm(4SAT)+10st(2SAT)+8t(2SAT),核型不对称系数(As.K%)为76.33%.黑美人(Negro)的染色体核型公式2n=2X=24=2m+4sm(2SAT)+8st(2SAT)+10t,核型不对称系数(As.K%)为79.60%.核型类型都属于3B型.     

五华三黄鸡线粒体DNA控制区全序列分析

采用PCR和直接测序的方法测定五华三黄鸡两个类群--丰华和太和类群的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)全序列,比较分析其序列特征并构建系统进化树.结果表明:五华三黄鸡2个类群线粒体DNA控制区全序列长度分别为1232 bp、1231 bp.与原鸡相比,五华三黄鸡的丰华类群和太和类群都发现14个变异位点,其中丰华类群的变异均是基因转换,而太和类群有13个转换和1个缺失,没有观测到颠换;A+T碱基含量分别占60.4%和60.3%,G+C碱基含量都约占39.6%.五华三黄鸡与其它19种禽类的D-loop基因序列同源性的分子进化树聚类结果表明五华三黄鸡类群与中国红原鸡亲缘关系最近.