中国虫草Cordycepssinensis的研究Ⅰ．名称和寄主的订正

结合对中国轮枝孢新种Ｖｅｒｔｉｃｉｌｉｕｍｓｉｎｅｎｓｉｓｓｐｎｏｖ的研究，分析评述了中国虫草Ｃｏｒｄｙｃｅｐｓｓｉｎｅｎｓｉｓ在名称、寄主、菌种和生境等诸方面的问题和研究结果，探讨了中国虫草的生物多样性问题．本文订正“中国虫草”为Ｃｓｉｎｅｎｓｉｓ的正式汉语学名，并在有效发表的４属３８种寄主昆虫中，初步确证其中的２属３１种为迄今涉及中国虫草的寄主昆虫     

沙蜥属13种蜥蜴基于16S rRNA序列的系统发生关系

通过比较13种鬣蜥科沙蜥属蜥蜴的16S rRNA部分序列，并以同科的长鬣蜥属长鬣蜥为外群构建NJ树、ML树和MP树，以探讨该属13种蜥蜴的系统发生关系．PAUP分析结果显示这13种沙蜥分成两个类群，呈并系关系，并且NJ树的结果与ML树和MP树划分结果不同．而MEGA结果支持基于形态学、生态环境和核型分析对该13种的沙蜥的划分，同时NJ树中的13种沙蜥属单系群、     

基于16S rRNA高通量测序技术的生态学实验教学

利用微生物16 S基因特定区域的通用引物对16 S rRNA进行扩增,采用高通量二代测序技术,结合QIIME数据处理软件进行序列的筛选、比对和微生物鉴定,从而获得土壤中大量微生物物种OTU(Operational Taxonomic Unit)的分布信息.结果表明,该实验激发了学生的实验操作兴趣,拓展了本科生态学实验教...     

管蚜蝇族7种食蚜蝇Cty b基因序列差异及系统进化关系

采用PCR和测序方法,首次获得管蚜蝇族(Eristalini)7种食蚜蝇线粒体基因组的Ctyb基因部分序列(419bp).经对位排列,序列间未见有插入和缺失,共检测到119个可变核苷酸位点,变异率为28 40%,其中简约位点74个.属内序列差异值在5 01%～9 55%之间,属间序列差异值在10 02%～16 23%之间.以直翅目的中华稻蝗为外群,用多种方法构建进化关系树,结果类似.从4个属间关系来看,管蚜蝇属和斑眼蚜蝇属首先聚合为姊妹群,BCL值为61%,其次与条胸蚜蝇属聚合,BCL值为89%,宽盾蚜蝇属最后聚合.管蚜蝇族的4个属的聚类系统发生树为单系.     

野桑蚕酚氧化酶原的部分性质及其基因进化分析

根据已克隆的野桑蚕酚氧化酶原基因的cDNA序列,利用生物信息学工具对该基因编码蛋白质的部分性质进行了分析.结果表明:野桑蚕酚氧化酶原基因PPO1和PPO2编码蛋白质的分子量和等电点分别为78.703 kDa,80.075 kDa和6.28,5.62;氨基酸序列的C-末端均没有疏水跨膜区域,其基因编码蛋白质的三级结构分别具有12个α螺旋、16个β折叠和14个α螺旋、18个β折叠.对18个物种的基因进化进一步分析表明:野桑蚕与家蚕的亲缘关系最近,与其他物种的亲缘关系相对较远.     

基于16S rRNA基因测序技术揭示骨质疏松症患者肠道菌群的改变：一项系统评价和荟萃分析（英文）

骨质疏松症（osteoporosis,OP）已成为严重威胁全球中老年人骨健康的重大公共卫生问题。肠道菌群（gut microbiota,GM）的改变与维持骨量和骨质量有关。然而,相关研究结果仍存在很大争议,目前尚没有研究对肠道菌群和骨质疏松间关系进行过系统评价和荟萃分析。本研究通过对骨质疏松症患者和健康人群之间肠道菌群差异的既往16S rRNA基因测序结果进行系统评价和荟萃分析,以期为未来个体化预防和治疗骨质疏松症提供新的临床参考。这项观察性的荟萃分析显示,肠道菌群的改变与骨质疏松症之间存在关联,并且一些优势菌群的变化可能存在地域差异。     

基于免疫协同进化的Multi-Agent系统建模

提出了一个具有高效问题求解能力的Multi-Agent系统模型.模型中每个Agent通过搜索得到抗体代表,然后进行抗原提呈,抗体与抗原利用历史记录进行优化匹配,解的匹配程度越高对应问题解决的质量越高;经过迭代向最优匹配状态进化,免疫协同进化算法产生新的抗体,系统的抗体集合与基因库得到不断优化和更新.仿真实验结果证明该模型具有较好的适应度和较短的寻找最优解的时间.     

基于Cyt b基因的雀形目15种鸟类系统发生关系初探

以线粒体DNA的Cyt b基因全序列作为分子标记,对雀形目(Passeriformes)6科15种鸟类的分类地位及系统发生关系进行了分析.结果显示:全序列中含有变异位点454个,简约信息位点337个.采用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法分别构建了系统发生树及其合一树,结果表明:黄鹂科(Oriolidae)首先分化出来,接着依次分化出卷尾科(Docruridae)、鸦科(Corvidae)、伯劳科(Laniidae)、河乌科(Cinclidae)和椋鸟科(Sturnidae)鸟类;这6科鸟类构成一个单系群,在这一单系群里椋鸟科是最晚分化出的类群.     

基于生命系统观分析进化与适应观的培养

深入剖析人教版高中生物学新教材中“生物的进化”一章所蕴含的进化与适应观及其与核心素养其他各要素间的相互关系,为一线教师制定本章教学策略提供设计思路,防止实际教学过程中产生核心素养各要素之间的割裂现象。     

南方鲇和鲇线粒体DNA 16SrRNA基因片段的RFLP对比分析

作者利用PCR技术进行了南方鲇（Silurus meridionalis）和鲇（Silurus asotus）五个地理种群线粒体DNA（mitochondrial DNA,mtDNA）限制性片段长度多态性（RFLP）研究。这五个地理种群是长江上游支流（四川境内的雅砻江、岷江、宜宾、贵州遵义的乌江）和长江中游支流沅江上游的渎阳河。选用10种限制性内切酶水解,只有HaeⅢ产生了限制性片段长度多态性。结果发现：南方鲇在野生种群和养殖品种间有分子遗传标记;鲇在长江上游支流各野生种群和长江中游支流溴阳河种群间有分子遗传标记;但在该基因片段上没有鉴别南方鲇和鲇的分子遗传标记。     

基于CoI序列对鹀亚科分子系统发育关系研究

以线粒体DNA的CoI基因全序列作为分子标记,对鹀亚科19种鸟类系统发生关系进行了分析．结果显示：全序列中含有保守位点810个,可变位点403个,简约信息位点269个．采用邻接法、最大简约法分别构建系统发生树,结果表明：铁爪鹀（Calcarius lapponicus）在鹀亚科中首先分化出来;蓝鹀（Latoucheornis siemsseni）和黄喉鹀（Emberiza elegans）亲缘关系较近,认为蓝鸦是鹀属（Emberiza）类群的一个种,不支持将它单列为一个属;小鹀（Emberiza pallasi）与红颈苇鹀（Emberiza yessoensis）之间具有较近的亲缘关系,形成姐妹关系．     

Changes in the gut microbiota of osteoporosis patients based on 16S rRNA gene sequencing: a systematic review and meta-analysis

Background

Osteoporosis (OP) has become a major public health issue, threatening the bone health of middle-aged and elderly people from all around the world. Changes in the gut microbiota (GM) are correlated with the maintenance of bone mass and bone quality. However, research results in this field remain highly controversial, and no systematic review or meta-analysis of the relationship between GM and OP has been conducted. This paper addresses this shortcoming, focusing on the difference in the GM abundance between OP patients and healthy controls based on previous 16S ribosomal RNA (rRNA) gene sequencing results, in order to provide new clinical reference information for future customized prevention and treatment options of OP.

Methods

According to the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA), we comprehensively searched the databases of PubMed, Web of Science, Embase, Cochrane Library, and China National Knowledge Infrastructure (CNKI). In addition, we applied the R programming language version 4.0.3 and Stata 15.1 software for data analysis. We also implemented the Newcastle-Ottawa Scale (NOS), funnel plot analysis, sensitivity analysis, Egger’s test, and Begg’s test to assess the risk of bias.

Results

This research ultimately considered 12 studies, which included the fecal GM data of 2033 people (604 with OP and 1429 healthy controls). In the included research papers, it was observed that the relative abundance of Lactobacillus and Ruminococcus increased in the OP group, while the relative abundance for Bacteroides of Bacteroidetes increased (except for Ireland). Meanwhile, Firmicutes, Blautia, Alistipes, Megamonas, and Anaerostipes showed reduced relative abundance in Chinese studies. In the linear discriminant analysis Effect Size (LEfSe) analysis, certain bacteria showed statistically significant results consistently across different studies.

Conclusions

This observational meta-analysis revealed that changes in the GM were correlated with OP, and variations in some advantageous GM might involve regional differences.

     

16S rRNA序列分析在皖南花猪病原菌分离鉴定中的应用研究

为了解地方品种皖南花猪细菌感染情况,运用16S rRNA基因序列分析方法鉴定从皖南花猪地方品种猪分离的8种细菌.通过提取细菌DNA,采用通用引物PCR扩增16S rRNA基因片段并测序.将测序结果用BLAST在线软件在Nucleotide数据库中进行序列同源性比对,根据序列同源性鉴定病原细菌.结果表明:7种细菌鉴定到"种",1种细菌鉴定到"属". 16S rRNA基因序列分析对于皖南花猪病原菌鉴定是一种有效的方法 .     

基于ADSP-TS201S的16QAM调制及其在VisualDSP++环境下的实现

正交振幅调制因其较高的频带利用率和相对较低的误码率而被定为很多数字通信系统的数字传输标准.该文讨论了16QAM调制原理,在VisualDSP++环境下用TigerSHARC TS201S处理器产生16QAM信号,且在ADSP-TS201S EZ-KIT评估板上进行功能验证.     

病虫灾成灾面积的ARMA模型的分析及应用

分析基于气象等因素对病虫灾成灾面积的影响,建立病虫灾成灾面积的时间序列模型.利用湖北省病虫灾成灾面积数据对模型进行平稳化处理,得到确定的ARMA模型,并用其对病虫灾成灾面积进行预测,为病虫害的预测预报提供了理论依据.     

银鹊树的树种特性研究

在阐述银鹊树的生物学特性与生态学特性的基础上,重点分析了它的观赏价值,并对其繁殖方法进行了初步试验与探讨,为开发与利用银鹊树资源提供参考。     

泽泻18S-26S rRNA及其ITS片断的克隆及序列分析

对采集自福建、江西、四川3个地区4个泽泻样品的18S-26SrRNA及其rTS片断进行克隆及序列分析,结果表明福建高叶泽泻、福建矮叶泽泻和江泽泻的18S-26SrRNA及ITS片断的序列完全一致,与川泽泻则有2个碱基的区别.