全外显子组测序发现一个中国Nance-Horan综合征家系NItS基因的新突变

研究目的：通过对一个中国Nance-Horan综合征家系的临床表型及基因突变分析,揭示本家系的致病遗传机制。研究方法：对该Nance—Horan综合征家系的一个男性患者进行全外显子组测序,结合此家系临床表型及遗传方式分析,选定x染色体上NHS基凶上的一个无义突变c．322G〉T（E108x）为可疑致病突变。通过聚合酶链式反应（PCR）和Sanger测序,对该家系内其他成员进行NHS基因突变分析,同时对50名健康对照者的NHS基因的突变检测结果进行对比。另外,将该突变的位点第108位氨基酸残基进行多物种NHS蛋白内序列比对。最后,对该家系成员眼部及全身的临床特点进行全面检查和分析。重要结论：全外显子组测序结合Sanger测序发现NHS基因第一个外显子上的c．322G〉T（E108X）突变为引起该家系临床病变的突变位点;多物种NHS蛋白内序列比对发现该突变位点第108位氨基酸残基位于高度保守区;临床表型分析发现该家系内存在表型异质性。此家系为国内首次报道的无义突变引起的Nance-Horan综合征家系。     

采用常压室温等离子体诱变技术获得一株高产雄甾-4-烯-3,17-二酮的突变菌株 Mycobacterium neoaurum ZADF-4

目的：获得一株高产雄甾-4-烯-3,17-二酮（ AD ）的Mycobacterium neoaurum突变株。
　　创新点：获得了一株3-甾酮-Δ1-脱氢酶（KSDD）酶活缺陷型的高产 AD的诱变菌株 Mycobacterium neo-aurum ZADF-4,并采用菌落显色法筛选 KSDD酶活缺陷型M. neoaurum突变株。
　　方法：（1）诱变方法：采用常压室温等离子体（ARTP）诱变技术来处理出发菌株 M. neoaurum ZAD。ARTP 诱变条件如下：功率40 W ,气流量12.5 L/min,辐射距离1 cm,样品体积10μl,辐射时间为60、90、120、150和180 s;致死率统计优化后,最适辐射时间为150 s,致死率为90%~96%。（2）筛选方法：将ARTP诱变处理后的菌株点种在硝酸纤维滤膜上,30°C培养2 d,然后将长有菌落的滤膜小心取出并漂浮在4 mg/ml二氯靛酚（DCPIP）溶液（0.1 mmol/L磷酸缓冲液pH 7.0）,30°C培养1 d直到全部菌落染成蓝色。然后将该滤膜取出,漂浮在250 mmol/L AD溶液（2%甲醇和50 mmol/L Tris pH 7.0缓冲液）,室温放置15 min左右,观察菌落颜色变化。KSDD在底物 AD 存在时会脱氢产生雄甾-1,4-二烯-3,17-二酮（ADD）和H+,H+可以使被DCPIP染成蓝色的菌株褪色。因此,酶活缺陷型的菌株会仍保持蓝色,而酶活高的菌株会褪色为黄色（图3）。（3）对获得的潜在的高产AD菌株进行进一步的酶活检测以及产量验证,以期获得最优的突变株。
　　结论：获得了4株具有潜在的高产AD能力的菌株,其中,最优的突变株ZADF-4的KSDD酶活相较于出发菌株ZAD下降了81.2%（图4）,活性胶也证明其KSDD酶活相较于出发菌株下降明显（图5）。薄层色谱法（TLC）和高效液相色谱法（HPLC）实验证明突变株 ZADF-4中,AD的产量有了明显的提高（图6和图7）,提高到了(6.28±0.11) g/L, AD/ADD提高到8：1,AD的摩尔产率达到60.3%（表1）。对出发菌株ZAD和突变株ZADF-4的ksdd基因进行克隆和序列比对,发现ZADF-4的ksdd序列在5'端缺失9个核苷酸（atgttctac）,导致3个氨基酸（MFY）的缺失;还发生了两个点突变,其中一个是无义突变（g.15a>6t）,另一个是有义突变（g.413c>404t）,并引起了相应位置上的氨基酸变化（p.138S>135L）。上述的基因突变及其引起的氨基酸序列的变化可能是引起M. neoaurum ZADF-4中KSDD酶活降低及AD产量提高的主要原因。     

基于突变级数法的南方红壤侵蚀小流域的生态恢复评价——以朱溪小流域为例

近年来,国内外生态恢复研究多数并未考虑生态系统恢复所具有的突变性.本研究针对生态恢复演变过程的突变特征建立了生态恢复评价指标体系,在ENVI4.2、Arc GIS9.2、MATLAB7.0等3S技术平台上,采用突变级数法对长汀县朱溪小流域生态恢复进行了定量评估和动态趋势分析.研究结果表明：（1）长汀朱溪小流域生态恢复总体较好,80%的流失区都可恢复到Ⅲ级以上（含Ⅲ级）,采取的有效治理措施主要为封禁;（2）对长汀朱溪小流域生态恢复因素主要有植被盖度、水土流失指数、土壤肥力和地表温度,其各个影响因素重要性大小排序为：植被盖度〉水土流失指数〉土壤肥力指数〉地表温度;（3）突变级数法和生态恢复的交叉融合具有重要应用价值和实践意义.研究认为,采用了突变级数法进行综合评价不仅避免了人为制定权重的主观性,也反映了南方红壤侵蚀小流域生态恢复演变过程的突变特征,更为科学地揭示了生态系统恢复变化过程的本质规律.     

一种新的集成回溯搜索算法研究（英文）

针对回溯搜索算法（BSA）进化模式过于单一、易进入停滞阶段使得优化精度不够高的问题,提出一种新的多种变异学习策略集成的回溯搜索算法（EBSA）。EBSA在原有变突变学习策略的基础上,通过利用全局与局部信息引入了4种新的突变学习策略,在迭代进化过程中通过个体适应度值变化的轮盘选择法来确定各突变学习策略的选择概率。为评估算法的性能,将EBSA与BSA及其变体在CEC2014测试集上进行分析比较,仿真测试结果表明EBSA具有更好的优化性能。     

细绳绷直瞬间的能量损失

对理想刚性细绳而言,当其一端受约束,在绳子绷直的瞬间,绳子方向弹力发生瞬间突变（弹力是由微小形变而产生,而微小形变所需时间极短,可忽略不计）．弹力突变导致瞬间由于弹力的冲量作用使沿绳子方向物体的分速度突变为0,只剩下垂直于绳子方向的分速度,于是瞬间导致能量损失（向内能转化）,解题时如对上述环节不清晰易造成错解,现举例说明．     

自感现象中是什么不能突变

自感现象是由于导体（线圈）中的电流变化而产生的一种电磁感应现象,自感电动势总足阻碍原电流的变化,因而使导体（线圈）中电流的大小和方向不能发生突变,即电流表现出“惯性”．所以,只要抓住流过导体中的电流不能发生突变这一特征,就能解决有关自感现象的问题．     

综合法绘制梁的内力图

《建筑力学》是建筑类专业最为重要的基础课程,正确绘制梁的内力图是这门课的基本要求,也是重点难点之一,在比较分析各种内力图绘制方法的基础上,这里给出一种较为便捷的内力图绘制方法──综合法。一、利用剪力方程、弯矩方程绘制内力图,此法虽步骤较繁且描点时易出错,但所得两个规则却相当重要：①集中力作用处,剪力图有突变,突变值等于集中力大小,弯矩图发生转折;②集中力偶作用处,剪力图无变化,弯矩图有突变,其突变绝对值等于该力偶的力偶矩。二、利用剪力Q（X）,弯矩M（X）与分布荷载集度q（X）之间微分关系绘制内力图…     

一个中国Lynch综合征家系携带的MLH1基因第19号外显子移码突变:一项家系研究（英文）

目的:寻找一个Lynch综合征患者所在家系携带的DNA错配修复基因突变,探讨各突变对肿瘤发生发展的影响。创新点:MLH1的第19号外显子c.2250_2251insAA移码突变既往被认为是意义未名突变,而我们的研究为明确该突变的致病意义提供了依据。另外,我们首次报道了MLH3基因第1号外显子c.1397C>A突变。该突变有可能使Lynch综合征患者的发病年龄提前。方法:运用免疫组织化学技术检测家系先证者肿瘤组织中错配修复基因蛋白的缺失情况,使用二代测序技术通过先证者血标本明确患者所携带的突变。同时运用Sanger法检测家系其他成员该突变的携带情况以明确突变对肿瘤发生发展的影响。结论:我们在患者体内发现MLH1基因第19号外显子移码突变(c.2250_2251insAA)以及MLH3基因第1号外显子c.1397C>A突变。在患者家系中,我们仅检测到有MLH1突变,因此该突变极有可能为致病突变。     

有关摩擦力的突变点

“突变”是物理现象中常见的，是一种相关制约的物理量间的跳跃和转折。摩擦力突变，常常导致物体受力和运动性质的突变，其突变点（时刻或位置）往往具有很深的隐蔽性，夹杂在一定难度的习题中，稍不留心，容易导致错解，因此，要解决这类较复杂的问题，首先必须找出摩擦力发生突变的点，分析突变情况。     

miRNA-222调控CDKN1b和CDKN1c表达促进乳腺癌细胞增殖和迁移的机制研究

通过检测乳腺癌样本和正常组织样本中miR-222表达量，转染miR-222模拟物（mimics）和抑制物（inhibitors），用CCK-8和Transwell检测miR-222对乳腺癌细胞增殖能力和迁移能力的影响．进一步预测miRNA-222的靶基因，构建其过表达载体和预测靶基因的荧光素酶报告载体．通过双荧光素酶检测系统鉴定靶基因，点突变实验验证与靶基因的结合位点．RT-PCR检测miRNA-222过表达或抑制后对靶基因表达的影响．分析CDKN1b和CDKN1c高、低表达水平与乳腺癌患者生存率的关系．结果表明与正常乳腺组织比较，肿瘤组织中miR-222表达显著上升（P<0.0001）,miR-222的表达与淋巴结转移呈正相关．miR-222过表达后能促进乳腺癌细胞的增殖和迁移，反之则会抑制乳腺癌细胞的增殖和迁移．双荧光素酶报告系统显示miRNA-222过表达能显著抑制CDKN1b和CDKN1c的荧光素酶活性，点突变实验证实miR-222通过“种子区”与CDKN1b、CDKN1c的靶位点结合，从而负向调控CDKN1b和CDKN1c的表达．过表达miRNA-222后CDKN1b和...     

抓住突变寻求突破

我们知道物理状态的变化总是从量的渐变到质的突变,即在物体的运动状态发生变化的过程中,往往达到某一个特定状态时,有关的物理量将发生突变,其突变点（时刻或位置）往往具有很深的隐蔽性,稍不留心容易出错．因此,对于物理习题中的突变问题在复习时应引起高度重视,应仔细分析物体的状态变化的过程与细节,在突变中寻求突破．下面就这类问题...     

静定梁内力图的直接画法

内力图是判断危险截面的依据之一，在《材料力学》课程中作内力图是一个重点，也是一个难点。教材中阐述了用截面法列内力方程，求出各段截面的内力值，再画内力图的方法。但该方法计算量较大，作图效率低。下面就内力图的直接画法谈点体会。笔者认为，该方法全面、简捷、准确。一、轴力图规律：（１）求出约束反力。（２）轴力图起始于X轴终止于X轴，自坐标原点开始，从左向右画。（３）轴力在外力作用截面处发生突变，突变的大小（绝对值）与外力相同，突变的方向：A、遇到正视图中箭头向左的外力时向上画，遇到向右的外力时向下画（即…     

计算机专业学生的请假条

昨日．我恨未能将你于课堂之上传授的网络知识克隆于心中，在放学后在未增加内存（饭）的情况下，急赴校园外某网吧寻找历史记录：怎料天色突变．风雨大作，因我硬件（身体）防毒能力较差，加之身上加载的外壳（衣服）少，不幸被GM（感冒）病毒抓住了漏洞。     

免疫组化和直接测序以及焦磷酸测序对IDH1突变的比较研究

采用免疫组化法、直接测序法、焦磷酸测序法分别对弥漫性脑胶质瘤患者异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)第132位精氨酸的突变进行检测。结果表明:3种方法对高频突变的检出一致性为90.62%,免疫组化只能检测出R132H突变类型,而两种测序方法都能检测出R132-其他类型的突变;焦磷酸测序检出灵敏度最高达3%,直接测序法最经济和简便,但灵敏度低,仅能检测突变率为20%以上的突变。建议先用免疫组化和直接测序初筛IDH1基因突变,对发现的低频突变用焦磷酸测序验证。     

关于半波损失

从菲涅尔公式出发,分析了光正入射和斜入射到两种介质的分界面时,反射光产生的半波损失（位相突变）问题。     

用户异常行为分析方法研究与应用

为了应对高级持续性威胁（APT）攻击造成的威胁,解决传统基于规则的分析方法对用户异常行为检测的误报与漏报问题,提高用户异常行为检测效果,通过采集用户行为日志生成用户操作行为矩阵,并通过模型定义方式对用户行为进行相似度分析。采用容忍度测算、突变测算、差值测算与峰值测算方法,分析与发现用户异常访问。基于用户画像的异常行为分析方法结合了用户操作行为特征及角色定义,利用用户行为日志历史信息勾勒出用户行为画像,使系统能准确、实时地判断用户行为异常,提高了对异常行为的实时检测与快速响应能力。     

基于霍克-布朗准则的深埋隧道塌方机制泛函突变分析

研究目的：分析深埋隧道的塌方机制并推导塌方体形状曲线的解析表达式。创新要点：基于霍克-布朗准则,采用泛函突变理论推导得到了深埋隧道塌方体形状曲线的解析表达式,并据此分析了围岩参数变化对塌方体形状的影响规律。研究方法：通过理论分析建立深埋圆形隧道的解析模型（图1）,采用泛函突变理论推导基于霍克-布朗准则的隧道塌方体形状曲线解析表达式,并研究围岩参数变化对塌方体形状的影响规律（图3和4,表2）。通过与自然拱理论和模型试验结果的对比（图5–7）验证本文解析解的正确性。重要结论：采用泛函突变理论推导了基于霍克-布朗准则的深埋隧道塌方体形状曲线解析表达式。该解析表达式简洁直观,不仅可以预测无支护条件下隧道的塌落体尺寸,还可以估算塌落围岩作用于衬砌上的荷载。     

南京科学家揭示生物遗传突变普遍机制

据2008年7月25日《科技日报》报道,2008年7月20日出版的《自然》刊登了南京大学教授田大成等的名为《真核生物中插入缺失（Indel）增加其周围序列的突变率》的论文,提出了“Indel”诱导自发突变机制假说,“破解了遗传变异突变是如何形成的”这一生命科学的基本问题。     

机器学习领域研究热点与前沿演进——基于CiteSpace的可视化分析

基于CiteSpace采用文献计量法,分析总结机器学习领域近十年研究热点与技术前沿演进。研究结果显示,该领域热点算法有Classification（分类算法）、Support Vector Machine（支持向量机）等,热点框架有sorFlow、Caffe、PaddlePaddle等;数据库、序列等突变词共同组成了近十年的研究新兴领域。     

家族性肥厚型心肌病相关cTnI基因突变检测芯片的应用

基于基因芯片技术对心肌钙蛋白(cTnI)基因上的突变进行了分析.针对外显子上的突变特征设计了特异性探针,制备了可以同时检测cTnI基因上第3,5,7,8外显子突变的低密度基因芯片.对每一个外显子,设计了2条5'端标记荧光的寡核苷酸链,一条模拟野生型序列,另一条模拟突变型序列,将二者混合起来模拟杂合子序列.经过实验条件的优化,制作的芯片可以灵敏、特异地检测cTnI基因外显子上的突变.结果表明,该芯片检测突变正配错配区别明显,荧光强度比值符合理论估计(正中碱基错配的信号强度是完全正配信号强度的50%左右).经进一步对芯片优化后,该芯片有望在家族性肥厚型心肌病的研究和诊断中得到应用.