浙贝母DNA条形码技术研究

DNA条形码技术是一种新型的生物身份识别系统,能够利用鉴别物种内的一段标准的、具有足够变异性、并相对较短且易扩增的DNA片段对生物物种实现快速的自动鉴定。本研究首先采用试剂盒提取法从17个贝母种79个样品中提取了基因组DNA,并进行了纯度与浓度鉴定;然后采用ITS1、ITS2序列引物进行PCR扩增和产物测序,最后进行序列比对,以明确DNA条形码序列ITS1和ITS2在浙贝母种质资源中的鉴定效果。结果发现,浙贝母地方种间的ITS序列差异不大,ITS序列对浙贝母种内分辨率过于低下。由此表明DNA条形码ITS1、ITS2序列并不太适合用作浙贝母的DNA条形码技术。     

以分子生物学技术和现代遗传学原理为基础探取“生命”信息--生命条形码南方中心

生命条形码技术是近二十年来兴起的一门以分子生物学技术和现代遗传学原理为基础进行物种准确辨识的技术,相当于生物学界的“分子诊断技术”。其原理是自然界中的每个物种自身具有的一小段DNA序列,该序列与其他物种都有显著的不同,但物种内部的差异极小,因此该序列被形象地称之为“DNA条形码”。以DNA条形码进行物种鉴别的技术就是生命条形码技术。     

DNA条形码技术促进我国水产领域信息化进程 ——重要水产动物DNA条形码及其在食品安全领域的应用

DNA条形码是利用简短的标准化基因片段对物种进行快速鉴定的技术,并为快速的物种鉴定提供了分子水平的精细分类学标准.DNA条形码技术不但可以在食品安全监管中发挥重要作用,还为突破现有检测技术与社会发展需求之间的矛盾提供了可行性.     

科研进展

<正>昆明动物所在生物多样性监测方法研究上取得突破中科院昆明动物所Douglas Yu研究组利用马氏网和诱捕灯等收集了大量昆虫样本,然后将这些混合的昆虫样本直接提取DNA,Douglas Yu将这种混合的DNA样本称之为"昆虫汤",借助于不断革新的测序平台和技术,"昆虫汤"内物种序列信息的获得也将越来越快和便宜。该研究将高通量条形码技术与传统的生物多样性监测法进行了对比。用于比较的两类数据都分别采集于中国云南、马来西亚和英国。利用传统方法搜集的数据包括55 000     

基于DNA条形码探究盗条蜂Anthophora plagiata(Illiger,1806)的物种界定

盗条蜂(Anthophora plagiata)毛色变异极大,时常被形态学鉴定为不同的物种。为了探究盗条蜂毛色的变异,笔者对第二次青藏高原综合科学考察中采集到的不同毛色盗条蜂样本进行DNA条形码测序并结合形态学特征进行了分析。结果显示:所研究西藏和青海具不同毛色的标本均为一个物种,表明盗条蜂毛色的变化属于种内变异。     

基于时间序列的DNA特征分析

生物与生态构成的统一整体称为生态系统,在这个系统中,生物与环境相互影响、相互制约,并形成了相对稳定的生态平衡状态。对不同物种的生物信息进行研究具有重大意义。生物信息学的主要研究对象由DNA、RNA和蛋白质分子构成,这些大分子中含括了物种进化和遗传的所有信息。其中DNA里的线粒体是生物系统研究中应用最为广泛的遗传物质之一,具有进化速率快,在遗传过程不发生基因重组、倒位、易变等突变,严格遵守母系遗传方式的特点。本文中对于30个哺乳动物的线粒体DNA进行研究,利用短记忆ARIMA模型做出详细阐述,概述了线粒体DNA携带mtDNA的一般属性。我们首先对于30个物种随机抽取5个物种的线粒体DNA(位置4,70个碱基)的碱基序列,对其进行时序化;然后利用ARIMA模型进行模型识别、参数估计、模型诊断(检验及优化)、进行预测(碱基位置71-75)。结果表明:在短记忆模型ARIMA(p,q)模型高度显著拟合下,其作为合适的时间序列模型能帮助我们挖掘DNA序列中的未知特性。     

给生物贴上标签——DNA条形码

在不远的将来,我们是否可以仅仅凭借解读一小段基因密码就能确定地球上一个物种的身份呢?这可不是惊世骇俗,物种身份关系到生物进化和生物分布这些基本的问题,科学家一直都在探索,但一直都没有给出详细的答案,而DNA条形码给了我们希望……     

蒙药材DNA条形码研究现状及存在问题

药材DNA条形码研究是当前研究的热点之一,蒙药作为民族医药之一,已开展了相关研究,文章介绍了蒙药材DNA条形码研究现状,并就蒙药条形码研究中存在的问题作了阐述.     

利用RAPD分子标记评价仲彬草属的种间关系

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了14种仲彬草属Kengyilia植物的种间关系。对34个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选,20个(58．8％)能产生多态性。14个引物产生的112个DNA片断,用于计算种间Jaccard遗传相似性系数分析,在NTSYS程序中利用UPGMA构建系统发育树状图。分析结果表明：(1)14个Kengyilia物种存在较大的遗传多样性;(2)青藏高原的物种与新疆的物种 的RAPD变异极大;(3)形态相似、地理分布一致的物种有一定的亲缘关系,聚类在一起;(4)RAPD结果与形态学和细胞学等分析结果一致。RAPD分析方法将为Kengyilia系统分类提供DNA水平上丰富的资料。     

紫堇属植物的研究现状

紫堇属植物隶属于罂粟科,该类植物在形态上极为相似,鉴定困难,需借助DNA条形码技术进行鉴定,目前该技术在紫堇属植物鉴定中应用还不广泛,需要进一步深入探究;部分紫堇属植物可应用到中药中入药,学者们对其化学成分与药效的研究相对较为深入,就目前的研究成果显示,已从该属植物中分离得到60多种甾醇类、生物碱等多种类型化合物,部分提取物还有一定的抗菌、消除氧活性自由基、毒杀细粒棘球绦虫原头蚴等药理活性。     

科学家呼吁尽早启动真菌条形码计划

“未来,对人类已知的真菌都像超市里的商品一样贴上条形码,即使一个非专业的人士也能准确地鉴定真菌。”在近期举行的2008中国真菌DNA条形码研讨会上,中科院微生物研究所研究员白逢彦博士向人们描绘了真菌研究的美好前景。与会专家指出,实施国际生命条形码计划对我国科技、医疗、检疫等具有重大意义,我国应尽早地实质性参与并实施该计划。     

农业生物多样性测度指标的建立与应用——以贵州省从江县为例

农业生物多样性是人类当前和未来产业发展、资源开发、战略性种质资源保存与利用、生物安全等的重要物质基础。然而,随着人口的增长,高产品种的推广,化肥、农药的过度施用以及政策变革和经济建设等原因,农业生物多样性不断遭到破坏或丧失,对其保护已成为全球可持续农业研究中的焦点。农业生物多样性的评价是有效保护农业生物多样性,合理利用其资源,促进区域可持续发展的关键。本文以Shannon-Wiener多样性指数、等级多样性测度为基础,对农业等级多样性测度指标进行了研究;引入信息增益的概念,对农业生物多样性信息增益的测度指标进行了研究,并用农业等级多样性、信息增益及其他多样性指标分析评价了贵州省从江县的农业生物多样性。结果表明从江县旱地植物共有36科86种及变种。按用途分,主要有食用植物29种,占总物种数的33.7%;药用植物20种,占23.3%;饲料植物5种,占5.8%;其它5种,占5.8%。多样性指数分析的结果为:旱地物种Simpson优势度指数为0.20,Margalef丰富度指数为4.35、Shannon-Wiener指数为2.27,Pielou均匀度指数为0.71。农业多样性分析结果为:旱地农业物种丰富度为0.13;农业物种多样性指数分别3.225和1.708。农业等级多样性指数与利用物种数的变化趋势基本一致,并与农业物种丰富度指数的变化趋势基本相符,但与信息增益的测度指标有所差异。     

农业生物多样性测度指标的建立与应用

农业生物多样性是人类当前和未来产业发展、资源开发、战略性种质资源保存与利用、生物安全等的重要物质基础。然而,随着人口的增长,高产品种的推广,化肥、农药的过度施用以及政策变革和经济建设等原因,农业生物多样性不断遭到破坏或丧失,对其保护已成为全球可持续农业研究中的焦点。农业生物多样性的评价是有效保护农业生物多样性,合理利用其资源,促进区域可持续发展的关键。本文以Shannon-Wiener多样性指数、等级多样性测度为基础,对农业等级多样性测度指标进行了研究;引入信息增益的概念,对农业生物多样性信息增益的测度指标进行了研究,并用农业等级多样性、信息增益及其他多样性指标分析评价了贵州省从江县的农业生物多样性。结果表明从江县旱地植物共有36科86种及变种。按用途分,主要有食用植物29种,占总物种数的33.7%;药用植物20种,占23.3%;饲料植物5种,占5.8%;其它5种,占5.8%。多样性指数分析的结果为：旱地物种Simpson优势度指数为0.20,Margalef丰富度指数为4.35、Shannon-Wiener指数为2.27,Pielou均匀度指数为0.71。农业多样性分析结果为：旱地农业物种丰富度为0.13;农业物种多样性指数分别3.225和1.708。农业等级多样性指数与利用物种数的变化趋势基本一致,并与农业物种丰富度指数的变化趋势基本相符,但与信息增益的测度指标有所差异。     

COI基因在我国昆虫分类中的应用

本文介绍了近年来在昆虫分类学领域研究热点之一的DNA条形码技术,综述了我国基于COI基因进行的昆虫分类学研究,并对COI基因对我国昆虫分类学的未来应用进行了展望。     

资讯

<正>人类消费行为威胁物种多样性此前的研究发现,人类消费行为及其背后的商品供应链与全球生物多样性遭受威胁密切相关。在此基础上,研究人员利用大数据分析,最新绘制出一组全球物种受威胁地图。研究人员重点关注国际自然保护联盟和国际鸟类联盟列举的6803种易危、濒危、严重濒危的陆地和海洋物种,计算出由于具体哪个国家或地区的消费以及哪些消费类别而对其他国家或地区的哪些物种造成何     

COⅠ基因在我国昆虫分类中的应用

本文介绍了近年来在昆虫分类学领域研究热点之一的DNA条形码技术,综述了我国基于COⅠ基因进行的昆虫分类学研究,并对COⅠ基因对我国昆虫分类学的未来应用进行了展望。     

校园废旧图书智能回收设备

现如今,人们对图书的需求量日益增长,但是对书籍利用率普遍不高,以我国学生为例,书籍利用率仅为六成左右,大约五成的书籍是可以循环利用的。因为国内没有统一的回收方式或再利用的方案办法,大多数情况下书本得不到再次利用,蕴含知识的书籍成为生活垃圾。在美国、德国、日本等诸多发达国家都有学校在进行教材的循环使用,我们国家包括上海在内的许多城市,也在学校开始试点推广教材的循环使用。很多学者也进行了一些图书分类和识别技术的研究,其中张帆等提出了一种图书回收装置,它由图书输送机构、图书检测装置和夹书机构组成。但大部分学者将注意力集中于图书馆的管理系统中,并没有对二手图书的回收进行相应的研究。由于目前在售的大部分图书都贴有条形码,条形码能够在计算机中反馈出图书的分类信息,因此借助于条形码技术设计一套废旧图书的智能回收装置具有一定实践性。     

基于分子计算的逻辑模型构建

DNA计算是计算机科学与分子生物学交叉产生的新兴领域,为计算领域、密码领域及纳米材料领域等提供了一种全新的途径。本文通过对DNA分子结构特征的分析,获得了建立逻辑门模型的DNA分子编码;结合生物学理论,通过利用DNA分子杂交技术和DNA分子酶切技术构建出两个基于分子计算的逻辑电路模型,实现了与门和或门的创建。为解决NP等复杂问题提供了新方法。     

一个新的时代正在到来

<正>"凡物各自有根本,种禾终不生豆苗",生物的各种性状皆与基因密切相关。然而,不同物种的亲代与子代之间、子代的个体之间,却又绝对不会完全相同。一个高等生物的个体中,不同类型的细胞中含有相同的DNA遗传信息,但是它们却具有不同的生物学功能。生物学中一个悬而未决但同时也是最根本的问题是:拥有相似或相同DNA的物种和细胞是怎样决定     

后天经历开启基因

基因和经历 美国韦恩州立大学生物学家莫里斯·古德曼（美国科学院院士）等人在《美国科学院院刊》上发表了一篇论文，提出应当把黑猩猩（包括普通黑猩猩和倭黑猩猩）划归人属（生物的分类依次为域、界、门、纲、目、科、属、种），其理由是，他们选取人、黑猩猩、大猩猩、猩猩、旧大陆猴和鼠为研究对象，发现这六个物种在97个功能基因的DNA序列上。