活性污泥总DNA的提取和纯化

在很多生物处理的工艺中,人们对处理过程的生物降解机理并不是很清楚,对处理过程的微生物的区系结构及主要的功能菌也知之甚少.微生物分子生态学可以帮助了解污泥中微生物区系的结构与功能动态变化情况,并鉴定主要的功能菌.本文对几种常用的活性污泥总DNA的提取和纯化方法作了介绍并进行了总结和比较,根据这些方法原理对影响提取效果的因素做了分析,提出了相应的改进措施,以期建立满足微生物分子生态学研究的所需的DNA.     

玻璃珠法提取堆肥微生物总DNA及其DGGE分析

采用玻璃珠法从高温堆肥样品中进行了微生物总DNA的提取,以细菌16S rRNA基因 V3区通用引物进行了PCR扩增,随后用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对其微生物多样性进行评估.结果表明,玻璃珠法能够快速、有效地获得高质量的堆肥微生物总DNA,所得的DNA分子片段在15kb以上,使用细菌16S rRNA 基因通用引物(27F和1492R)对总DNA进行PCR扩增,获得了近全长的16S rDNA序列(约1.5kb);DGGE分析结果表明,用该方法提取到的DNA种类较为丰富,多样性较好,能够进一步应用于群落结构分析.因此,玻璃珠法提取的DNA可以用于堆肥微生物的分子生态学研究及微生物群落结构分析.     

微生物分子生态学中的DNA研究方法

主要分析与综述了在微生物分子生态学中的DNA研究方法．     

盐土中微生物总DNA的提取方法的探究

文章初步探讨了用不同DNA提取方法,对盐土中微生物总DNA的提取效果.实验结果表明,由于盐土中微生物数量较少,溶菌酶-SDS-冻融裂解法、溶菌酶-SDS-蛋白酶K-冻融裂解法均无法提取到盐土中微生物的总DNA;变性剂-SDS-高盐法和试剂盒提取法能获得DNA,但效果不佳;只有用变性剂-SDS-高盐修改法能快速、有效地提取盐土中微生物的基因组DNA.     

常温与高温嗜油微生物的异同比较分析

石油污染的环境中存在可以降解石油烃的微生物.比较了高温微生物(包括嗜油菌)和常温微生物在菌体细胞的形态、结构、生理生化的性质、DNA(基因组)和蛋白质(蛋白质组)等方面的异同,并总结了一些高温微生物可能的适应机制,以期有助于进一步提高高温嗜油菌的应用潜力.     

生态学中环境DNA技术应用研究

环境DNA(e DNA)即指直接从环境样本中提取基因组DNA后进行测序分析的技术方法。本文分析了e DNA的主要应用技术,并从动物食性分析、生物多样性分析和生物量估测等方面阐述了e DNA在生态学中的应用,最后展望了e DNA的未来发展趋势。     

改进的CTAB提取植物DNA方法

根据DNA分子的物理化学特性及植物材料的特点,改进了传统利用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取植物叶片中DNA的操作方法,采用新鲜配制的CTAB溶液、液氮快速研磨植物材料、添加适量还原剂和适量吸取提取液中核酸层等措施,减少了提取过程中提取液的褐变和杂质对DNA产质量的影响.同时,列出了提取过程中各操作步骤的注意事项和关键点.该方法操作简便、快捷,提取出的DNA质量较好,能很好地用于DNA的分子遗传特性分析,可作为教学和研究工作中植物DNA的提取方法.     

基因理论视域下研究生教育质量控制方法探讨

运用基因理论对研究生教育质量进行了生态学解析,赋予了研究生教育质量碱基、研究生教育质量DNA分子和研究生教育质量基因的内涵与特征,构建了研究生教育质量DNA分子模型;并通过研究生教育质量基因的遗传和变异过程分析,提出了研究生教育质量基因控制的基本方法.     

从土壤样品中提取和纯化微生物DNA方法研究进展

自然界存在的微生物只有一少部分能够通过标准纯培养方法获得，而绝大多数是难培养和不能培养的微生物，近年出现了一些新的直接从环境基质中提取微生物DNA的方法，用来研究环境中微生物多样性。对目前用于提取和纯化环境样品中微生物DNA的研究进展进行了综述．     

未培养微生物的研究方法

现代分子生物学技术绕过纯培养障碍对未培养的微生物进行广泛研究,其中,全程rRNA分析法和指纹分析法是目前应用于未培养微生物多样性研究的主要分子生物学方法与技术.另外,PCR扩增法、构建宏基因组文库法等方法的建立,给人类认识未培养的微生物提供了一种探知微生物多样性结构和功能基因组的方法.     

利用随机扩增多态性DNA技术对金丝小枣9个品种的资源分析

金丝小枣是我国优良的枣类品种之一.对金丝小枣基因组DNA提取方法进行了研究,探索出了一种适合金丝小枣基因组DNA提取的方法,并利用提取的DNA对金丝小枣系列9个品种进行了RAPD技术分析鉴定,找到了特殊谱带,构建了金丝小枣系列的分子标记检索表,为准确鉴定金丝小枣种质资源提供了分子生物学依据.     

质粒DNA快速提取法在基础课实验中的应用

本文对质粒DNA及其结构、形态和功能进行了综述，介绍了快速提取质粒DNA的基本步骤，并对其提取过程中的注意事项进行了剖析，分析了该方法的优点。     

3种土壤微生物基因组DNA提取方法的比较

该实验通过SDS高盐法（常规法）、SDS高盐法（改良法）和Soil gDNA Kit法提取土壤微生物基因组DNA,用DNA Nanophotometer仪测定样本DNA的纯度和浓度,以确定最佳提取方法.结果表明,用SDS高盐法（常规法）、SDS高盐法（改良法）和Soil gDNA Kit法和土壤微生物基因组DNA的浓度分别为41.45 ng/μl、96.48 ng/μl和58.40 ng/μl,纯度（OD260/OD280）分别1.45、1.57和1.82.由结果可知,改良法提取DNA的浓度最高,而Soil gDNA Kit法的纯度最高,但其成本较高,因此,SDS高盐法（改良法）是节省成本且适合提取大批量土壤微生物基因组DNA的方法,今后在提取DNA过程中进一步优化,以提高其纯度.     

天鹅湖国家城市湿地公园微生物生态服务功能研究

本研究以天鹅湖国家城市湿地公园为研究对象,比较了白天鹅栖息地与非栖息地在微生物群落结构方面的异同,并针对天鹅主要栖息地的优势微生物类群进行生态服务功能研究,结果显示:湿地优势微生物与变形菌属、芽孢杆菌属、链霉菌属等有较高相似性,天鹅栖息地微生物多样性高于非栖息地,变形菌属和链霉菌属微生物生态服务功能值得关注。     

小麦基因组DNA提取方法比较研究

用4种方法对小麦基因组DNA进行提取,采用琼脂糖凝胶电泳法和核酸蛋白分析仪比较DNA的浓度和质量,结果显示,4种DNA提取方法在DNA浓度上有所差别,方法一所提取的DNA浓度最高,但消耗试剂最多;方法二所提取的DNA浓度最低,有蛋白质污染,但过程简单;方法三和方法四所提取的DNA浓度相当,方法三有蛋白质污染,过程简单,方法四纯度高,过程最复杂.采用同一对引物和反应体系对所提取的DNA进行PCR扩增,结果显示4种方法所提取的基因组DNA均能满足分子标记检测的需要.     

两种提取三色堇DNA方法的比较

以三色堇叶片为材料,分别采用SDS方法和植物基因组DNA提取试剂盒法对三色堇叶片DNA进行提取,采用琼脂糖凝胶电泳法检测DNA的质量浓度和质量.结果表明:采用SDS方法提取的DNA质量浓度高,但纯度低,耗时长;试剂盒法获得的DNA纯度高,且该方法操作方便,耗时短,但费用较高.PCR扩增结果显示两种方法所提取的DNA均能满足基因扩增和分子标记检测的需要.     

分子生态学研究概况

分子生态学是应用分子生物的原理和方法来研究生命系统与环境相互作用的,生态机理及分子机制的科学,它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科,本文对了分子生态学的各种定义进行归纳,并对其研究内容、研究方法、研究热点问题进行了介绍.     

核酸的化学结构

一九五三年,英国《自然》杂志上刊登了一个美国青年人华特生(Watson)和英国人克里克(Crick)合写的一篇短文:《核酸的分子结构》.他们从染色体中提取去氧核糖核酸(DNA),根据x射线衍射资料,借电子计算机之助,提出了去氧核糖核酸双链螺旋结构的立体模型(图1).这个模型震动了整个科学界.它对阐明核酸是生物体遗传和变异的物质基础提供了坚实的科学依据,推动了分子生物学特别是分子遗传学的迅速发展.它不但使人们对于生命起源、遗传变异、物种进化规律的认识大大深入了一步,而且为改良和创造动植物、微生物的新品种以及提高医疗水平开辟了新的前景.这就是说,对核酸的化学结构和功能的了解,在理论上和实践上都是有重大意义的.     

酸奶在储存过程中菌群结构变化研究

为了探究酸奶储存过程中微生物菌群结构的变化,为其长期贮存奠定理论基础.采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,以此作为PCR反应的模板,进行16S rDNA基因有效扩增,并将PCR扩增产物进行DGGE电泳.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,1、2号酸奶样品高相似性为93%,1-3号与4-7号的相似仅为6%,表明酸奶贮存过程中,菌群结构发生了变化.     

“限制性核酸内切酶”考点直击

限制性核酸内切酶主要是微生物体内的一类酶,能将外来的DNA切断.由于这种切割作用是在DNA分子内部进行的,故名限制性核酸内切酶,又称限制酶,是基因工程的"分子