隐马尔可夫模型在多序列比对中的应用

目前已获得了大量的生物序列和结构数据 ,传统研究生物序列的方法已面临挑战 ,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来研究。隐马尔可夫模型 (HMM )是一个能够通过可观察的数据很好地捕捉真实空间统计性质的随机模型 ,该模型用于生物序列分析是生物信息学 (Bioinformat ics)研究的新领域。序列的多重比对是生物序列分析研究中的一个重要方法。文章首先介绍了HMM的基本结构 ,然后着重讨论了HMM在DNA序列之间的多重比对中的应用。     

隐马尔可夫模型(HMM)及其应用

隐马尔可夫模型(HMM)是序列数据处理和统计学习的一种重要概率模型,具有建模简单、数据计算量小、运行速度快、识别率高等特点,近几年来已经被成功应用到许多工程任务中.文章介绍了隐马尔可夫模型,并对HMM及其改进的HMM在语音处理技术、人脸识别和人脸表情识别中的应用进行了叙述.     

基于HMM／MLP混合网络模型的语音识别方法

提出了一种新的用于语音识别的HMM MLP混合网络 ,它利用MLP的鉴别训练能力 ,以克服基本HMM的ML训练方法中不合理的模型正确性假设前提 ,提高HMM的鉴别能力和识别性能 .实验结果证明HMM MLP混合网络的鉴别能力和识别性能明显高于普通HMM .     

序列模式挖掘算法的分析

序列模式挖掘是数据挖掘研究的一个重要课题,用于从序列数据库中发现相对时间或者其他顺序所出现的高频率子序列.首先给出序列模式挖掘的相关定义,然后介绍了四种序列模式挖掘算法,并对其特点进行分析总结,最后指出未来的研究方向.     

西方蜜蜂一个新表皮蛋白基因的克隆和结构分析

利用西方蜜蜂雄蜂头部5’LongSAGE文库中的一组标签序列,在蜜蜂基因组序列第9号连锁群上定位一个新的西方蜜蜂表皮蛋白基因转录起始位点,并克隆了该基因的eDNA序列,继而利用此cDNA序列分析了该基因的内含子和外显子结构．分析结果显示：该基因的DNA序列长1253bp,含有4个外显子和3个内含子,其cDNA长598bp,编码一个169AA的富含Val和Pro残基（23．67％,20．12％）多肽序列．BLAST分析发现,该蛋白与已知的4个昆虫表皮蛋白序列的相似性为47．54％,且其C末端有一个共有基序,说明这5个蛋白可能属于同一个表皮蛋白家族．该研究结果提供了一个新的蜜蜂表皮蛋白基因,且该基因在雄蜂头部表达水平较高．     

生物信息学中的马尔可夫模型

随着人类基因组研究的不断发展,在世界各个（Genbank,SwissPort等）数据库中积累了大量蛋白质、核酸序列数据,如何分析和处理这些数据以获得更多的信息成为科学家们关心的核心问题,并由此产生了生物信息学。文章介绍了在生物信息学研究中常见的几种用于数据库搜索、序列比较、建立蛋白质模型、发现新基因等研究的马尔可夫模型。     

ANGPTL1基因的研究进展

ANGPTL1基因(类血管生长因子基因1)是最近发现的ANGPTLs基因家族的一个成员,它对血管发生、内皮细胞的保护及胚胎器官发生等方面有重要作用。综述了ANGPTL1基因的基本结构、主要功能和基因表达调控等方面的研究进展。     

三种方法的NP识别比较实验研究

利用错误驱动法、支持向量机法和隐马尔可模型三种方法对汉语文本进行名词短语识别,对实验进行比较分析,结果表明SVM与HMM的识别效果总体上要好于错误驱动法,HMM法在封闭测试中优势明显.研究表明错误驱动法应用于解决从语料库中学习转换规则的传统问题;SVM方法适用于解决两类别的分类问题;而HMM方法侧重应用在与线性序列相关的现象上.     

生物工程通用计算机软件包(BTSP)的构建

本文介绍在IBM XT/AT及其兼容的个人计算机上实现的一个生物工程软件包(BTSP),它可用于生物工程研究及其应用中的核酸序列、蛋白质序列数据检索以及各种基因结构与功能的分析。“BTSP”采用模块结构,便于应用及进一步的修改、扩充。     

长足大竹象超长链脂肪酸延长酶家族的全基因组鉴定及其分子进化

超长链脂肪酸延伸酶（Elongation of very long chain fatty acids protein;ELO)是决定长足大竹象(Cyrtotrachelus buqueti)脂肪酸生物合成的关键酶。利用生物信息学方法对长足大竹象ELO基因家族的基因结构特征及其编码蛋白序列进行详细的分析以期探究长足大竹象ELO基因家族调控其脂肪酸生物合成的分子机制。结果表明,从长足大竹象基因组序列中共鉴定出15个ELO基因家族成员,分别位于四条染色体上。其等电点9.22～9.68、呈碱性。该家族蛋白具有稳定性、疏水性、具有跨膜现象、且有多个磷酸化位点、二级结构以α-螺旋为主。Cbu ELO蛋白家族共鉴定出10个保守基序。通过构建Cbu ELO蛋白家族进化树分析,长足大竹象与赤拟谷盗的ELO蛋白家族亲缘关系最近。该研究结果为深入探索长足大竹象ELO基因的功能提供了参考依据。     

语音识别技术及应用

语音识别技术近年来得到了飞速的发展并且在越来越多的领域得到了广泛的应用。隐马尔可夫模型(HMM)语音识别技术是一种基于训练数据提供的概率自动构造识别系统的技术,主要用于大量词汇的语音识别,而且具有良好的识别性能和抗噪性能。因此,一般的语音识别系统都采用基于HMM的识别方法作为其基本算法。本文列举了语音识别在教学中的应用示例来分析其基本算法。     

一种有效的形成性评价方法——美国的成长记录袋制度述评

传统的评价,一直被认为是对教师教学情况和学生学习情况的检验和考察,是教学后教师和考试人员的工作。美国的成长记录袋制度向我们提供了一种新的评价视野和评价方法,告诉我们形成性评价是教学过程的一个组成部分,是对教师教学和学生学习情况的一种反馈;有效实施成长记录袋制度有利于教学的改进,使学生参与到评价中来,有利于学生的自我调整和进步。     

网球上旋发球技术及易犯错误研究

在网球各项基本技术中,上旋球是运用最多的一种击球方式,它的优点在于既具有稳定性有具有进攻性,掌握上旋球技术对于网球选手是至关重要的,本文针对网球上旋球技术教学的重要环节进行了分析与探讨。     

图书馆电子期刊信息服务探讨

作为一种新型的、极具潜力的信息源,电子期刊不仅改变了出版物的载体形式,拓宽了图书馆信息服务的领域,更重要的是改变了图书馆传统的服务观念和服务策略。笔者认为,认识电子期刊的特点、局限性及其对图书馆期刊工作的影响,了解电子期刊信息服务的常用形式,才能制订电子期刊信息服务的基本策略。     

基于隐马尔科夫模型的词性标注

词性标注是中文信息处理领域中的一个重要研究课题。本文首先介绍了隐马尔科夫模型的表示形式和需要解决的问题,然后论述了HMM模型参数估计的方法,并对运用Viterbi算法进行词性标注的基本原理进行了深入的研究。     

超过滤技术及其应用

超过滤是膜分离技术中应用性较好的一种 ,介绍了超过滤技术的特点和在多个领域内的应用现状 ,这些表明 ,超过滤技术由于其低能耗、高效率和常温操作的特点具有良好的应用前景 .     

回转式电晕放电架的结构设计

电晕处理机是一种应用非常广泛的塑料薄膜表面处理设备,放电架是其主要组成部分。针对放电架结构的特点,介绍了一种放电架总体结构的设计方法,并对其主要组成部件的结构设计进行了详细的论述。这种放电架采用回转式结构,利用气缸推动回转组件运转,提高了放膜的方便性和安全性。     

TYPES OF EXAMINATIONS IN HISTORY STUDIES

In psychometric studies disagreement among experts is frequently treated as error void of informational value. The present study deviates from this approach and utilizes disagreement among experts in item classification as a source for examining the structural characteristics of the classification scheme. Guttman's smallest space analysis applied to an agreement-disagreement matrix suggests that the item-classification scheme reflects two different approaches to testing outcomes of studying history: that of the cognitive psychology and that of the philosophy of history.