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从满江红Azolla Lam.萍-藻共生体中提取DNA进行的RAPD系统分析通常忽视了满江红样品的异质性。本研究通过获得无藻的满江红,比较有藻萍、无藻萍和离体藻之间的RAPD指纹图谱。发现从有藻萍中提取DNA的扩增反应来源于萍藻双方DNA的共同影响。依引物和植物样本的不同,共生双方对扩增产物的贡献结果不同,说明了用无藻萍进行RAPD检测的重要性。对满江红三膘组5个种的11个无藻萍样本进行了RAPD分析,由9个引物产生的127个DNA多态片段用于计算样本间的Jaccard相似系数和UPGMA树状聚类图。结果 相似文献
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DNA分子标记技术在水生动物遗传多样性研究中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
简要阐述了几种常见DNA分子标记技术,如限制性片断长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphie DNA,RAPD)、扩增片断长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)、简单重复序列或微卫星标记(simpie sequencerepeat,SSR)、内部简单重复序列(inter-simple sequence repeat,ISSR)和单核苷酸多态性(single nucleotidepelymorphisms,SNP)等的基本原理、技术上的优缺点及其在水生动物遗传多样性研究中的应用,包括遗传多样性的鉴定、品种亲缘关系与分类的研究和种质资源的鉴定等.最后,对DNA分子标记技术在水生动物遗传多样性应用中的存在问题进行了简单的讨论. 相似文献
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目的:建立广西产地钱(Marchantia polymorpha L.)拳卷地钱(Marchantia convoluta gao et chang.)和粗裂地钱(Marchantia paleacea Bertol.)的分子鉴别方法。方法:利用RAPD(random amplified polymorphic DNA)技术。结果:采用改良的CTAB法提取地钱、拳卷地钱、粗裂地钱3种植物的总DNA均适用于22引物对供试材料DNA进行随机扩增,共扩增出145条谱带,多态性条带128条,占扩增总条带的88.3%,平均多态性百分率为89.8%;三种地钱遗传距离为0.3713-0.4107、Nei′s遗传一致度为0.5893-0.6287。结论:RAPD技术对广西产地钱、拳卷地钱、粗裂地钱进行分子鉴定是有效的。RAPD分析。 相似文献
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文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析,用Bioedit软件与Gen Bank数据库中相关植物的序列进行序列比对,并用MEGA6.0软件做系统进化树(NJ),运用Codon W软件计算密码子的RSCU值。通过PCR扩增获得了10种藏药材的长度为750bp的目的片段,通过序列比对发现cox3基因在不同植物中变异位点较少,序列比较保守;基于cox3部分基因序列构建的NJ树反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的补充;密码子偏好性分析发现,cox3基因偏好使用以AU结尾的密码子。樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析从序列比对分析、构建系统进化树、密码子偏好性分析水平上分析了cox3基因部分序列在樱草杜鹃等10种藏药材的差异,为植物cox3基因的功能、表达研究奠定了基础。 相似文献
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利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了14种仲彬草属Kengyilia植物的种间关系。对34个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选,20个(58.8%)能产生多态性。14个引物产生的112个DNA片断,用于计算种间Jaccard遗传相似性系数分析,在NTSYS程序中利用UPGMA构建系统发育树状图。分析结果表明:(1)14个Kengyilia物种存在较大的遗传多样性;(2)青藏高原的物种与新疆的物种 的RAPD变异极大;(3)形态相似、地理分布一致的物种有一定的亲缘关系,聚类在一起;(4)RAPD结果与形态学和细胞学等分析结果一致。RAPD分析方法将为Kengyilia系统分类提供DNA水平上丰富的资料。 相似文献
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原位杂交技术是以基因组DNA或特异DNA为探针进行的染色体检测技术,自其成功应用以来,已在植物多倍体研究中发挥了重要作用。此技术可对多倍体基因组间亲源关系、基因组组成进行分析;对外源染色体进行检测。随着原位杂交技术的不断发展完善.其在植物多倍体研究中发挥的作用会更加重要。 相似文献
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浙江省12个主栽茭白品种亲缘关系的RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
采用RAPD技术构建了12个浙江主栽茭白品种的RAPD指纹图谱。利用河姆渡双季茭作为模板从50个随机引物中筛选出稳定且多态性高的7个引物用于茭白DNA的PCR扩增,共产生45条DNA片段,平均每个引物的扩增带为6.4条,其中15条扩增带具有遗传多样性。约占总DNA片段的33.3%。利用相似性聚类分析对PCR扩增产物进行二态性数据分析,结果表明,在相似系数2.1处可以将12个茭白品种分为5个聚类群,其中9个浙江本地品种间的遗传距离较近。初步结果也表明,单季茭与双季茭间的遗传差异比同一类型中茭白品种间的差异显著。 相似文献
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利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对14个枣Ziziphus jujuba 品种和1个野生种——泰山酸枣Z.spinosus的遗传变异进行了研究。从120个10-碱基随机引物中筛选出37个多态性引物用于正式扩增,共扩增出429条DNA带,其中多态性带214条,占49.88%。根据DNA扩增结果计算了品种及类型间遗传距离,并用UPGMA构建了聚类树状图。分析结果表明:龙爪枣 Z.jujuba var.tortuosa、葫芦枣 Z. jujuba var.lageniformis、无核枣 Z.jujuba var.anucleatus 等几个变种内的遗传距离大于变种间遗传距离,认为枣的变种划分是不自然的,宜并入其原变种;枣种下不宜设变种,对枣种下的众多品种,应根据品种间的遗传关系,直接划分品种群。 相似文献
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DNA纳米技术是设计和构建具有一定用途的人工核酸纳米结构。DNA纳米技术中的一个重要挑战就是如何有效设计和构建具有明确功能的纳米尺度的结构和器件。计算机辅助工具是预测、设计、建模以及描绘DNA结构的最强有力的工具。计算机辅助设计DNA结构以及识别有效的自组装路径让DNA作为一种独特的材料在构建纳米结构领域中显露锋芒。文章总结了DNA纳米结构设计的原理,介绍了一些用于DNA结构设计的算法以及一些用户友好软件。同时,对DNA纳米技术中构建DNA逻辑门以及DNA计算方面的最新研究进展做了介绍。 相似文献
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引文分析指标用于个体学术评价的可靠性程度较低。以全世界被引用次数最多的学者、美国生物化学家洛瑞没有获得诺贝尔奖的"悖论"为案例,使用引文规范理论的分析表明:引文分析指标用于个体学术评价,总被引用次数与学术贡献不能等同;不同类型引文对施引文献知识创新的作用程度是有区别的;对形式性引文、程序性引文和实质性引文进行区分,能够提高引文分析指标用于个体学术评价的可靠性。 相似文献
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本研究采用分光光度法及琼脂糖凝胶电泳比较从黑熊组织、血液以及毛发中提取的黑熊基因组DNA,发现提取的DNA浓度及纯度均可满足后续试验的需要。其中毛发DNA提取方法具有高灵敏度、操作简单、非损伤等特点,有助于开展珍稀濒危物种和性情凶猛动物的遗传特性研究。本文还根据文献中黑熊的11个微卫星位点设计并合成引物,进行了不同引物PCR最佳反应条件的筛选。对黑熊DNA基因组PCR扩增结果发现其中10对引物能扩增出较明显的扩增带,为后续的黑熊亲子鉴定及遗传特异性分析实验提供了有价值的资料,为其亲权概率的准确性提供了良好的参考依据。 相似文献
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目的:在亲子鉴定案件中检出D6S1043基因座三带型。方法:提取个体不同组织DNA样本,经复合荧光PCR扩增和毛细管电泳分析2716个案例(共6246名个体)的STR分型。结果:在1个父子单亲鉴定案例中,2名个体的D6S1043基因座上出现三带型等位基因。用Power Plex?21荧光标记复合扩增试剂盒对包含D6S1043在内的21个STR基因座进行检测,父亲D6S1043基因座分型为17/18/21,儿子分型为10/17/18,电泳峰高和峰面积之比均为1∶1∶1,用SinofilerTM试剂盒复核检测结果相同。结论:在本文发现的案例中,父亲的等位基因17和18均遗传给了儿子,导致儿子表现为三带型等位基因。D6S1043三带型非常罕见,在分析时应采用不同方法或者试剂盒进行验证,保证鉴定结果的可靠性。 相似文献