发现常温下固体表面的水层可以不亲水

上海应用物理所方海平研究员与其博士生王春雷等,通过理论分析水的特性,发现常温下的液态水在一个特定的表面上可以不亲水,即这层常温的水层是疏水的。他们运用分子动力学模拟发现水滴在一层单分子水层上的稳定存在。该项研究的表面具有非常特殊的性质——既排斥亲水基团（由于第一层水分子的疏水特性）又不吸附疏水基团（由于固体表面的亲水特性）的特性．     

维格纳表象中的量子波包动力学

在文中,发展了纠缠轨线动力学的一般形式。轨线的运动形式适用于一般的势能系统。使用这种改进的轨线动力学方法计算了一个模型势（三次多项势）的反应几率,所得出的结果与精确的量子计算结果符合的非常好。     

新型射频功率源脉冲高压电源研制成功

由于颗粒物质行为特征复杂、丰富、奇异,许许多多问题仍未解决,但义与日常生活和工农业生产联系密切,因此对颗粒物质的研究在近10多年来得到各国科研机构的重视,成为当前十分活跃的研究领域之一。合肥物质科学研究院同体物理所研究员刘长松、朱震刚等采用传统的力学谱（内耗）技术和分子动力学方法,对颗粒物质中能量释放与衰减性质方面的研究,取得了系列进展：（1）发现了冲击波能量释放的幂率规律及渡跃现象,     

MPI+OpenMP混合并行编程模型在分子动力学中的应用

针对分子动力学串行计算速度不足问题,设计一种基于MPI+OpenMP的并行编程模型,实现LAMMPS并行计算。从而满足在节点间采用MPI进行消息传递并行,在节点内采用OpenMP共享内存模式多线程并行;最后根据分子动力学自身计算特点,对近邻表的构建以及力的计算进行优化,同时将并行结果和串行结果以及纯OpenMP运行时间和混合模型运行时间作对比。实验结果表明,采用MPI+OpenMP混合并行编程模型不仅能够加快计算速度,而且具有很好的扩展性。     

单基和双基发射药力学性能的MD模拟研究

本文用分子动力学(MD)方法,模拟研究了由含氮量分别为11%、12%、13%、14%的硝化纤维素(NC)构成的单基药模型及其与硝化甘油(NG)构成的双基发射药模型的力学性能,得到其各力学参数:弹性系数、拉伸模量、体积模量、剪切模量和泊松比.结果表明,增加含氮量可使单基药NC塑性增强、刚性减弱.相比于单基药NC,双基药NC/NG的刚性较弱、塑性较强,具有较好的力学性能.     

〈111〉轴铜纳米线能量分布特征的原子模拟研究

采用分子动力学方法对〈111〉轴铜纳米线的升温和熔化过程进行了计算机模拟研究,结果表明：不同体系的原子能量分布基本一致,即波峰数相同、波峰重合,且最大概率都集中在-3．45至-3．5eV的低能区附近;常温时,不同体系的原子平均能量与其原子数的立方根倒数成线性关系．     

材料工作室软件在《计算材料学基础》本科教学中的应用初探

随着计算水平的迅猛发展,计算机模拟研究已经与实验研究和理论研究并列,成为一种基本的材料科学研究手段。材料工作室软件由于具有良好的可视界面得到众多材料科学工作者的青睐。本文对材料工作室软件在《计算材料学基础》本科教学中做探讨,重点在第一性原理计算和分子动力学两个方面。为材料工作室软件在《计算材料学基础》本科教学中的应用提供参考。     

小碳团族链状结构的紧束缚理论方法

本文作者利用紧束缚分子动力学模拟退火方法研究了小碳团族(Cn(n＝2—5))的链状结构性质和能量，通过与前人工作结果(C2—C5)的比较，发现本理论方法的结果相当精确地再现了Abinitio方法计算的结论。因此，证明了紧束缚方法对于碳团族研究的可行性。     

DSS1对蛋白质PCID2构象隐定性影响的分子动力学研究

PCID2和DSS1是TREX2复合体中的成分,DSS1作为子复合体之间的粘合剂在复合体中主要与PCID2结合．研究发现,DSS1在复合体中起稳定PCID2的作用．利用分子动力学模拟研究无序蛋白DSS1与PCID2的相互作用,结果表明：未结合DSS1的单体PCID2蛋白构象不稳定,与DSS1结合后的PCID2蛋白构象明显变得更稳定,特别是与DSS1结合处的构象,与实验得出的结论一致．研究DSS1对PCID2的作用,不仅可以为了解PCI蛋白提供分子基础,也为深入了解TREX复合体在核酸输出中的功能提供帮助．     

DSS1对蛋白质PCID2构象稳定性影响的分子动力学研究

PCID2和DSS1是TREX2复合体中的成分,DSS1作为子复合体之间的粘合剂在复合体中主要与PCID2结合.研究发现,DSS1在复合体中起稳定PCID2的作用.利用分子动力学模拟研究无序蛋白DSS1与PCID2的相互作用,结果表明:未结合DSS1的单体PCID2蛋白构象不稳定,与DSS1结合后的PCID2蛋白构象明显变得更稳定,特别是与DSS1结合处的构象,与实验得出的结论一致.研究DSS1对PCID2的作用,不仅可以为了解PCI蛋白提供分子基础,也为深入了解TREX复合体在核酸输出中的功能提供帮助.