ISSR分子标记及其在水产生物遗传学中的应用

ISSR是一种基于微卫星序列发展起来的新的分子标记,具有简便、稳定、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传,大部分ISSR标记为显性标记。综合有关文献就ISSR的原理、操作及其在水产生物品种鉴定、亲缘关系分析、遗传多样性检测、遗传图谱构建和分子标记辅助育种等方面的应用和进展进行了简要的阐述。     

不同地区浒苔（Enteromorpha prolifera）群体遗传多样性的ISSR分析

通过ISSR分子标记技术对6个不同地区浒苔(Enteromorpha prolifera)群体(浙江鳌江、浙江宁波、广东南澳、江苏南通、福建福鼎、浙江南麂岛)进行了遗传多样性分析.结果显示,从100条ISSR引物中筛选出5条引物,共得到36个清晰的扩增位点,其中多态性位点10个;6个地区浒苔的多态位点比率为27.78%,平均杂合度为0.1256,Shannon's信息指数为0.1795;群体间的遗传距离在0.0870-0.2062之间,平均遗传距离为0.1654.研究表明,6个地区浒苔的遗传多样性处于较低水平,遗传变异相对贫乏;它们之间的亲缘关系与其地理距离的远近没有直接的关系,并揭示6个地区的浒苔是属于同一物种.     

Molecular authentication of geo-authentic Scrophularia ningpoensis

Scrophularia ningpoensis has long been used in the Chinese Materia Medica for inflammation. Like other herbal medicines, S. ningpoensis collected from different localities may considerably differ in their therapeutic efficacy, and the one grown in Zhejiang Province is recognized as geo-authentic. However, it is difficult to confirm the geographical authenticity by similar morphological characteristics. In the present study, inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were conducted to detect S. ningpoensis from different origins. A 1 259-bp fragment amplified by primer UBC874 was found only in geo-authentic ones. By cloning and sequencing that specific band, sequence characterized amplified region (SCAR) markers were designed to distinguish geo-authentic S. ningpoensis from others. This is a rapid and easy method that can be used to identify the geographical authenticity of S. ningpoensis.     

都支杜鹃ISSR扩增条件的优化

对珍稀濒危物种都支杜鹃的ISSR扩增体系中的Mg2+浓度、dNTP浓度、Taq酶含量和底物含量进行优化,并在优化后的基础上筛选出8条效果较好的引物,在梯度PCR仪中设置温度梯度,找到这些引物的最佳退火温度。优化结果表明,至少在一定的范围内底物浓度和Taq酶含量对PCR反应结果影响不大,相对而言,dNTP浓度和Mg2+浓度对反应结果的影响更加显著。优化后的15 ul PCR反应体系中包括20 ng模板DNA、0.3μM引物、1.5 ul Buffer(Mg2+free),0.5 U Taq酶、1.5 mM MgCl2和0.1 mM dNTP。     

海菜花ISSR-PCRISSRPCR反应体系的优化

以渐危植物海菜花基因组DNA为研究对象,筛选引物UBC-818【序列为（CA）8G】研究并确定了该引物适宜的退火温度,对影响ISSR扩增效果的主要参数进行筛选和优化,确定了海菜花的ISSR分析的最佳反应体系：15μL反应体系中含25ng模板DNA,0．2mmol·L^-1引物,0．2μmol·L^-1dNTPs,2．0mmol·L^-1Mg^2＋,0．5UTaq酶,1．5μL10×PCRBufferMg2＋（-）[100mmol·L^-1Tris—HCl（pH8．3）,500mmol·L^-1KCl]．     

海菜花ISSR-PCR反应体系的优化

以渐危植物海菜花基因组DNA为研究对象,筛选引物UBC-818[序列为(CA)8G]研究并确定了该引物适宜的退火温度,对影响ISSR扩增效果的主要参数进行筛选和优化,确定了海菜花的ISSR分析的最佳反应体系:15 μL反应体系中含25 ng模板DNA,0.2 mmol·L-1引物,0.2 μmol·L-1 dNTPs,2.0mmol·L-1 Mg2+ ,0.5 UTaq酶,1.5 μL 10×PCR Buffer Mg2+(-)[100 mmol·L-1 Tris-HCI(pH 8.3),500 mmol.L-1KCI].     

水稻早世代稳定株系特有分子标记研究

SSR和ISSR分子标记已广泛应用于研究遗传行为和基因定位。在对水稻早世代稳定遗传特性的研究中,选用分布于水稻12条染色体上的168对多态性较好的SSR引物,对28个稳定株系的F_1、F_2、F_3及同组合的分离株系进行了SSR标记分析；选用26个多态性较好的ISSR引物对5个组合中出现的8个稳定株系及同组合的分离株系进行了ISSR分子标记。结果显示：稳定株系的标记带型出现三种类型：(1)母本带出现,父本带消失；(2)父本带出现,母本带消失；(3)出现非父母标记带型。分离株系表现为杂合标记带。推测水稻早世代稳定是在遗传因子作用下,在杂交受精或合子早期发育中发生了双亲染色体重排,形成纯合的F_1单株。     

安徽野生香菇ISSR和PAPD分析的比较

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)和简单序列重复区间扩增多态性(Inter-simple sequence repeat,ISSR)技术,利用12条RAPD引物和10条ISSR引物对10个安徽香菇菌株进行了DNA标记比较分析.结果表明,ISSR-PCR较RAPD-PCR稳定,更具可操作性;供试菌株存在比较显著的遗传变异,具有较丰富的遗传多样性.     

Species-specific SCAR markers for authentication of Sinocalycanthus chinensis

INTRODUCTION Calycanthaceae consists of three genera: Caly-canthus, Chimonanthus and Sinocalycanthus. Chi-monanthus and Sinocalycanthus are restricted toChina, and Calycanthus is distributed in NorthAmerica (Zhang and Liu, 1998). Sinocalycanthuschinensis Cheng et S.Y. Chang, the only representa-tive in the genus Sinocalycanthus, is a deciduousshrub endemic to China. Both biological and an-thropological causes have led to the recent decline ofthe species, which is now known from onl…     

ISSR分子标记及其在茶树遗传育种上的应用研究进展

ISSR分子标记是近几年发展起来的一种基于PCR的技术,本文阐述了ISSR的原理和流程,详细论述了ISSR标记目前在茶树遗传多样性、茶树品种鉴定、遗传图谱构建等方面的研究进展及应用前景。