Influence of the microbiota on epigenetics in colorectal cancer

Colorectal cancer is one of the most common malignancies and is the second leading cause of cancer death worldwide. Generally, there are three categories of colorectal cancer development mechanism—genetic, epigenetic and aberrant immunological signaling pathways—all of which may be initiated by an imbalanced gut microbiota. Epigenetic modifications enable host cells to change gene expression without modifying the gene sequence. The microbiota can interact with the host genome dynamically through the interface presented by epigenetic modifications. In particular, bacterially derived short-chain fatty acids have been identified as one clear link in the interaction of the microbiota with host epigenetic pathways. This review discusses recent findings relating to the cross talk between the microbiota and epigenetic modifications in colorectal cancer.     

生物大分子溶液结构的NMR测定法

随着高分辨核磁共振（ＮＭＲ）仪和多维ＮＭＲ技术的快速发展,近年来高场ＮＭＲ仪已成为测定生物大分子在溶液中的三维结构的最强有力的手段。目前已有１７００多个生物大分子的溶液结构用高分辨ＮＭＲ技术进行了测定。该文简要综述了这一高新技术的特点、测定流程,并分析了若干实例。     

以放射性标记的肽核酸对目标基因的识别与检测

用放射性核素¹¹¹In³⁺标记的肽核酸(PNA)为探针,分别检测与PNA序列互补的单链寡聚核苷酸、pUC19-C1质粒结合形成双螺旋的情况.结果表明,PNA不仅能够与游离单链的互补核酸形成稳定的双螺旋;还在有PNA开链剂存在的情况下,能够与靶位质粒特异性结合.以放射性标记的PNA可作为检测目标基因片断的有效分子探针.     

HPLC method for amino acids profile in biological fluids and inborn metabolic disorders of aminoacidopathies

Quantification of total and individual amino acids in biological fluids such as plasma, urine and cerebrospinal fluid has an important diagnostic implication in laboratory medicine. The present paper describes protocols for the assay of total amino acids by modified method based on dinitrophenyl and HPLC profile involving pre-column derivatization with o-pthalaldehyde (OPA) derivatization, respectively. The method, based on the alkylation of-SH groups prior to OPA derivatization of amino acids followed by reverse phase high performance liquid chromatography, provide a comprehensive profile of more than twenty amino acids (including-SH group containing) in a single run lasting about 45 minutes. The present study, apart from establishing the normal profile of amino acids in plasma of Indian sub population, also presents HPLC profile for some of the rare amino acidopathies.     

肽核酸单体结构的初步理论计算研究

肽核酸作为反义核酸类化合物,能与DNA和RNA以序列特异性方式结合,在基因研究等方面有独特的优越性和广泛的应用前景.本文设计了可用于核素标记的组-半胱-尿、半胱-尿-组、组-半胱-胞等肽核酸单体分子结构,进行了借助于G03程序的初步理论计算,得到了单体结构分子能量、可能配位点的电荷布局、偶极距、立体结构等参数;研究结果显示,所设计的这些单体分子具有可与金属核素配合的住点,且其结构具有相当的稳定性.     

户外拓展体力活动特征与支链氨基酸关系模型研究

目的:探讨户外拓展体力活动特征与支链氨基酸代谢关系模型。方法:以一次20人为时4天的户外拓展训练为对象,分为男子组和女子组,通过每天对于不同受试对象的脉搏指数,血压指数,疲劳指数,肺活量指数等影响支链氨基酸代谢过程和代谢程度的量进行监测,构建户外拓展体力活动的过程与支链氨基酸详细代谢关系模型。结果:随着天数增加,男子组脉搏指数明显高于女子组,且稳定性较女子组差,男子组与女子组的血压指数基本相当,男子组疲劳指数高于女子组,肺活量指数高于女子组。结论:通过采用该方法构建的户外拓展体力活动特征与支链氨基酸代谢关系模型,在不同时间内,支链氨基酸的代谢稳定,对于机体持续代谢氧气需求量的稳定性更高,肺活量指数影响支链氨基酸代谢对于男性而言更加明显。分析证明该模型能有效改善脉搏指数,血压指数,疲劳指数,肺活量指数对支链氨基酸代谢过程和代谢程度的影响,为定量分析氨基酸在人体内代谢功能提供数据基础,分析户外拓展体力活动特征与人体正常代谢和生命运作的关系提供理论模型。     

运动结合饮食干预对肥胖青少年血清脂肪酸组分和身体成分的影响及其相关性研究

目的：探索4周运动结合饮食干预对肥胖青少年的血清脂肪酸组分和身体成分的影响,同时分析脂肪酸基础值与身体成分相关指标变化量的相关性。方法：以2017年暑期参加皓千体育发展有限公司全封闭减肥训练营的25名肥胖青少年为研究对象（平均年龄：15.96±1.88y;平均BMI：32.66±4.51 kg/m²）,进行为期4周的联合运动结合饮食干预,干预前后测试并分析身体成分、身体形态和血清脂肪酸组分的变化及其相互关系。结果：4周后,受试者的体重、身体质量指数（BMI）、体脂量、脂肪质量指数（FMI）、四肢脂肪量、腰围、臀围和腰臀比均显著降低,瘦体重%显著增加（P<0.001）;血清饱和脂肪酸（SFA）中,总饱和脂肪酸（SFAs）、肉豆蔻酸（C14：0）、十五烷酸（C15：0）、棕榈酸硬（C16：0）、脂酸（C18：0）、花生酸（C20：0）、山萮酸（C22：0）、二十三烷酸（C23：0）和二十四烷酸（C24：0）含量均显著降低（P<0.05）;单不饱和脂肪酸（MUFA）中,总单不饱和脂肪酸（MUFAs）、棕榈油酸（C16：1 n-7）、油酸（C18：1 n-9）和鳕油酸（C20：1 n-9）含量显著降低（P<0.01）;多不饱和脂肪酸（PUFA）中,总多不饱和脂肪酸（PUFAs）、总n-6多不饱和脂肪酸（n-6 PUFA）、亚油酸（C18：2 n-6）、二十碳二烯酸（C20：2 n-6）、双高-γ-亚麻酸（C20：3 n-6,DGLA）、花生四烯酸（C20：4 n-6,ARA）和α-亚麻酸（C18：3 n-3）显著下降（P<0.05）;Pearson相关性分析及一元线性回归分析表明,干预前血清C14：0与C20：3 n-6的基础值与体脂%及瘦体重%的变化量正相关,C16：1 n-7的基础值与体脂量、上肢脂肪量、右下肢脂肪量的变化量正相关（P<0.05）。结论：4周运动和饮食干预能明显改善肥胖患者身体成分、身体形态及血清脂肪酸组分;血清C14：0、C16：1 n-7、C20：3 n-6的基础值与身体成分的变化量存在线性关系,可以为减肥夏令营的饮食优化及减肥效果的预测提供参考。     

国际三大核酸序列数据库的运行与管理模式及对中国的启示

针对中国核酸序列数据等人类遗传资源信息管理的重要课题，以GenBank、EBI-ENA、DDBJ作为研究对象，对其总体情况、运行管理机制、全生命周期科学数据管理模式等进行调研与分析，探讨其数据处理流程特点及跨机构数据共享实现过程，为推动中国核酸序列数据库建设及规范化管理与开放共享提供参考。从发展沿革、建设目标、数据库概况等多方面通过多指标对比分析，总结出中国与国际三大核酸序列数据库在平台组织架构、建设目标、数据共享政策、数据资源与服务和国际合作建设这几大方面的不同，由此提出中国应从宏微观两层面制定核酸数据管理政策，加强核酸数据共享平台的部门分工和人才队伍建设、精品数据库开发建设、问题导向的基因组数据综合集成、数据服务能力建设、国际合作，以及优化数据库性能同时重视核酸数据安全管理等政策建议。