生命的复杂来自基因

人与黑猩猩的染色体差异只有1.23％,但两者思维和行为却存在巨大差异     

Development of genic SSR markers from transcriptome sequencing of pear buds

研究目的：基于转录组数据开发具有扩增率高和跨物种转移性的基因组编码区内的SSR（genic-SSR）标记,为梨属植物的分子系统发育关系和遗传多样性相关研究提供新的方法。创新要点：首次利用梨属植物的转录组测序（RNA-seq）数据结合M-13荧光尾巴高效率地开发了104个genic-SSR标记,并成功将其应用于梨属植物的系统发育关系研究中。研究方法：应用生物信息学软件从转录组测序数据中搜索SSR位点和设计相应引物,结合高效的M-13荧光尾巴的方法筛选多态性高的SSR标记。重要结论：转录组数据能够为梨属植物分子系统发育关系和遗传多样性研究提供新的SSR标记来源。     

调控HIV-1转录和潜伏激活的机制及相关因子(英文)

(1)反式激活蛋白(Tat)是病毒复制的重要因子,正性转录延伸因子b(P-TEFb)是Tat反式激活HIV-1转录所必需的特异性宿主细胞因子,其活性与HIV-1的转录密切相关。(2)在细胞内,无活性7SK snRNP复合体是功能性有活性P-TEFb的贮存和来源。在特定条件下,7SK snRNP复合体发生解离并释放出P-TEFb,从而刺激转录延伸。可以说,P-TEFb的活性受到严格的调控,维持着一种动态的平衡。(3)同时,P-TEFb还存在于一个具有超高转录活性的超级延伸复合体(SEC)中。Tat能将含有两个延伸因子P-TEFb和ELL2的SEC复合体募集至HIV-1长末端结构域(LTR),然后众多因子协同作用有效地增强HIV-1的转录作用。(4)溴区包含蛋白4(Brd4)像Tat一样,将P-TEFb募集至众多细胞基因的启动子区域,促进转录。Brd4也可激活基础水平的HIV-1转录,却对依赖Tat的HIV-1转录具有抑制作用,因为Brd4和Tat竞争性地与P-TEFb结合。(5)鉴于Brd4对Tat依赖性HIV-1转录的抑制作用,寻找能够抑制Brd4的小分子药物,激活HIV-1潜伏,结合高效抗逆转录病毒治疗(HAART),使得彻底根除HIV-1变成可能。Brd4的抑制剂JQ1就是这样的一种小分子,并且已被证明可以在多种细胞模型中激活HIV-1潜伏。     

转录组测序在高等植物中的研究进展

随着高通量测序技术的发展,在高等植物中应用转录组测序的研究越来越多。转录组测序针对物种转录本直接进行测序,能够有效的获得基因编码序列,主要研究物种在不同时期,不同环境条件,不同处理方式等各个不同条件下的基因表达差异及调控模式差异。本文主要介绍了转录组测序的测序平台,实验流程,生物信息分析内容以及目前在高等植物中的广泛应用,讨论了转录组测序在高等植物中研究的问题和新的研究内容。     

体育锻炼：介导骨骼肌昼夜节律分子钟的时间线索

对体育锻炼介导骨骼肌分子钟的相关文献进行综述,分析骨骼肌分子钟与体育锻炼的关系。发现：体育锻炼可调节骨骼肌的分子钟,并影响昼夜节律的振幅和相位,骨骼肌的运动能力也受到昼夜节律基因振荡中断的影响,运动对骨骼肌时钟基因的表达亦具有特定的昼夜时间效应;体育锻炼介导骨骼肌昼夜节律分子钟的授时途径主要表现在中央时钟的间接介导、骨骼肌收缩直接驱动、细胞反应因子的诱导、应激激素释放的调节等方面;体育锻炼介导骨骼肌昼夜节律分子钟能有效改善骨骼肌萎缩、睡眠障碍、代谢性疾病和心血管疾病。认为：体育锻炼可在骨骼肌的昼夜节律系统中重新设置时钟,而个性化的定时锻炼亦可作为昼夜节律紊乱相关病理的有效处方,同时将运动和营养干预与分子钟同步也会最大限度地发挥体育锻炼对全身健康的促进作用。     

武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展

中科院武汉植物园王艇研究组与其合作者通过突变体的筛选,发现CDKC;2虽为正向转录延伸因子P-TEFb复合体的激酶亚基,却对拟南芥开花时间重要调控基因FLC的转录表现为抑制作用。前期研究在FLC位点发现了一组名为COOLAIR的反义转录本。受此启发,该研究阐明CDKC;2直接促进COOLAIR的转录。进一步解析表明,不含COOLAIR启动子的FLC转录不受CDKC;     

甜橙ERF B3亚组转录因子的鉴定和表达分析

ERF转录因子是AP2/ERF转录因子大家族的一个主要亚家族,ERF转录因子进一步分为包含B3(IX)在内的6～7个亚组.研究表明ERF B3亚组转录因子在植物抗病反应中发挥重要作用.文章在甜橙基因组数据库中筛选了21个CsERF B3亚组转录因子。通过分析感染黄龙病的柑橘转录组数据发现,有9个ERF B3亚组转录因子在道县野橘、宜昌橙和/或甜橙中有差异表达。在外源激素诱导的表达分析中发现6个甜橙ERF B3亚组转录因子有差异表达.进一步研究发现甜橙ERF B3亚组转录因子为核定位蛋白,且具有转录激活活性.这为研究甜橙ERF B3亚组转录因子在植物抗病反应中的功能分析提供理论基础.     

遗传信息的转录教学设计及其思考

遗传信息的转录是基因指导蛋白质的合成这一节教学内容第一课时的主题,而基因指导蛋白质的合成是人教版高中《生物》必修2遗传与进化模块中第4章基因的表达之开篇。之前的第2、3章,分别聚焦了基因在哪里     

一次性力竭运动后心肌核转录因子Kappa B的变化及其在运动性心肌微损伤发生中的作用

目的：研究一次性力竭运动后大鼠心肌NF-κB在基因与蛋白水平的分布及变化规律。方法：100只健康成年雄性SD大鼠,随机分为一次性力竭游泳运动组及安静对照组。应用RT-PCR和免疫荧光组化技术,从mRNA及蛋白水平研究大鼠心肌NF-κBp65的在力竭运动后不同时相的分布及表达变化。结果：对照组NF-κB主要分布于细胞质、细胞膜及血管内膜,偶见于细胞核内,力竭运动后NF-κB主要分布于细胞核、细胞膜和血管内膜。一次性力竭后6 h左心室NF-κB p65蛋白含量显著高于对照组、12 h组、24 h组（P〈0.05）;运动后即刻室间隔NF-κB p65蛋白含量显著高于对照组（P〈0.05）,非常显著高于12 h组、24 h（P〈0.01）,运动后6 h非常显著高于12 h组（P〈0.01）;运动后即刻右心室NF-κBp65蛋白含量即显著高于安静对照组、24 h组（P〈0.05）,运动后6 h组显著高于安静对照组（P〈0.05）。一次性力竭运动后即刻心肌总的NF-κBp65蛋白含量显著高于对照组（P〈0.05）,6 h组非常显著地高于对照组水平（P〈0.01）,运动后12 h组显著低于即刻组和6 h组。一次性力竭即刻NF-κBp65mRNA含量显著高于一次性力竭24 h组（P〈0.05）;6 h显著高于对照组、24 h组（P〈0.05）;12 h显著高于24 h组（P〈0.05）。结论：一次力竭运动后不同时相心肌NF-κBmRNA和蛋白表达增加,可介导一系列炎症反应对细胞造成损伤,构成运动性心肌微损伤中发生机制之一。一次力竭运动后心脏各部位改变存有一定差异,其中室间隔及右心室NF-κB蛋白含量升高速度快,以室间隔NF-κB蛋白峰值水平最高,且右心室NF-κB蛋白改变恢复最慢。     

例析DNA的复制、转录和翻译图形分析题

DNA的复制、转录和翻译是生物遗传和变异的基础,而遗传和变异是高中生物的核心知识,所以关于DNA的复制、转录和翻译的考查也频见于各类试题中,其中以模式图为载体综合考查学生基础知识及其迁移能力、获取信息能力、理解能力等,是一种理想的题型,本文就此举例简析.