Two decades of suspect evidence for adaptive molecular evolution—negative selection confounding positive-selection signals

There has been a large literature in the last two decades affirming adaptive DNA sequence evolution between species. The main lines of evidence are from (i) the McDonald-Kreitman (MK) test, which compares divergence and polymorphism data, and (ii) the phylogenetic analysis by maximum likelihood (PAML) test, which analyzes multispecies divergence data. Here, we apply these two tests concurrently to genomic data of Drosophila and Arabidopsis. To our surprise, the >100 genes identified by the two tests do not overlap beyond random expectation. Because the non-concordance could be due to low powers leading to high false negatives, we merge every 20–30 genes into a ‘supergene’. At the supergene level, the power of detection is large but the calls still do not overlap. We rule out methodological reasons for the non-concordance. In particular, extensive simulations fail to find scenarios whereby positive selection can only be detected by either MK or PAML, but not both. Since molecular evolution is governed by positive and negative selection concurrently, a fundamental assumption for estimating one of these (say, positive selection) is that the other is constant. However, in a broad survey of primates, birds, Drosophila and Arabidopsis, we found that negative selection rarely stays constant for long in evolution. As a consequence, the variation in negative selection is often misconstrued as a signal of positive selection. In conclusion, MK, PAML and any method that examines genomic sequence evolution has to explicitly address the variation in negative selection before estimating positive selection. In a companion study, we propose a possible path forward in two stages—first, by mapping out the changes in negative selection and then using this map to estimate positive selection. For now, the large literature on positive selection between species has to await reassessment.     

论教育语境中的正义

本文旨在探讨教育语境中的正义具有什么内涵,以及是否存在一种被证实的关于正义的教育概念。本文并不主张建立一种积极的教育正义概念,而是主张避免把教育当做服务于教育之外的正义规范的工具。因此,本文重点分析了教育中的不正义,并将其在教育系统的不同层面上进行了归类,从而形成了一种有关教育语境中的不正义的教育现象学,这也就是教育现实得以改善的起点。文章最后指出了克服这些不正义的途径。     

建构主义学习理论对我国高校荣辱观教育的启示

在建构主义者看来,学习是在教育者的指导下在特定的教育环境下,学习者通过活动与交往进行的知识建构活动,因此建构主义者特别关注学习者主体作用的发挥,强调要加强学生学习内容和他们周围实际的联系,引导他们在活动与交往中运用原有的知识经验探究学习,使他们在主动探究学习的过程中形成主动求知的技能、态度和习惯。建构主义学习理论将促使我国高等学校的教育工作者尽早转变教育教学观念,真正掌握荣辱观教育的真谛,树立社会主义科学的荣辱观。     

操纵翻译理论介绍及其对中国文学翻译的启示

操纵理论虽然产生于上世纪六、七十年代的西方,但有关其内容的介绍在我国却始于上世纪末。它的问世给文学翻译带来了研究问题的新思想和方法,对中国文学翻译研究活动无论是在理论上还是在实践上都有不小的启示。     

搜寻理论模型与网络搜寻行为探析

本文从信息经济学的角度,从消费者搜寻模型、市场价格离散、消费者预期、搜寻成本等四个方面,针对消费者在购买商品时所进行的搜寻行为进行理论总结,并对该理论在网络搜寻行为等问题上的应用进行初步地探讨。     

重审教育理论性质:纪念保罗·赫斯特教授

上个世纪,英国学者彼得斯带动了分析的教育哲学传统,不仅影响教育哲学,也带动了教育理论的发展。其中,赫斯特扮演着重要的角色。他与奥康纳对教育理论之辩,尤为人所称道。奥康纳致力于将教育理论带往科学理论。前期,赫斯特认为教育理论是实践理论,迥异于科学理论,教育理论应该以其他学门知识的型式、领域为基础,而建构出有助于指导教育实践的原理;后期,赫斯特则更为重视隐而未现的实践意义,修正前期过于重视理性知识的立场。重审赫斯特、奥康纳之辩以及赫斯特前后期立场,将有助于我们理解教育哲学重点在于证成教育政策及开拓新的思考方式,量化研究成果在于拓展新知,质性研究则在于对实践智慧的探究。赫斯特后期念兹在兹于缄默之知等实践知识,哲学论证、量化研究、质性分析都应将之列入重要探索领域,必能有助于教育理论的精进。     

企业员工数字能力的影响因素及其作用路径

突破目前关于个体数字能力影响因素研究中以单一因素为主,且缺乏对企业员工数字能力影响因素分析的局限,考虑多因素对结果变量的联合作用,利用定性和定量研究相结合的优势,揭示影响企业员工数字能力的因素及途径。选取53名访谈对象,首先运用扎根理论的编码方法提炼影响企业员工数字能力的关键因素,再基于组态视角,运用模糊集定性比较分析方法开展影响路径构型分析。结果表明：企业员工数字能力是多种因素共同影响的结果,主要包括个人、组织和技术3个层面,将这三方面因素作为条件变量得到自我驱动型、全面协同型、环境影响型和技术驱动型4种类型的影响路径,其中自我驱动型和全面协同型路径的影响作用要远远大于环境影响型和技术驱动型路径。因此,在提升员工数字能力方面,企业应立足于员工自我驱动或有效发挥个人、组织和技术因素的协调整合作用,同时要结合自身实际对员工队伍、组织和技术因素现状进行客观分析,采取有针对性的措施。     

科学发展观对邓小平发展理论的继承和发展

邓小平发展理论是邓小平理论的重要组成部分,是指导我国经济社会发展的科学理论,也是科学发展观的理论基石。科学发展观的提出,更加明确了我们全面建设小康社会的方向和道路,是我国坚持和平发展,提高党的执政能力的重要保证和迫切需要。是对邓小平发展理论的继承和发展。     

对目录学核心问题的研究综述

文章对目录学核心问题讨论做了一次专门的学习与研究。     

知识交流视角中的图书馆2.0

从知识交流的视角观察图书馆2.0,概述了上世纪末知识交流论出现的背景及其主要观点,并从交流的角度论述了图书馆2.0给图书馆带来的深刻变化。参考文献3。