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探究罂粟全基因组的简单重复序列(SSR)数量及位点分布特征,利用MISA软件搜索罂粟基因组上的SSR位点,结果表明罂粟全基因组共鉴定出833 005个SSR位点,进一步分析共确定3 288种重复基元类型。其中单碱基SSR重复基元最丰富,占比为40.25%。罂粟基因组SSR基元类型富含A和T。在复合型SSR位点中,主要的重复基元类型为A/T、AAG/CTT、AAAT/ATTT,其中A/T占据总复合类型的38.91%。进一步的分析表明重复类型的数量与染色体的长度存在一定的线性关系。研究结果可为后续罂粟全基因组SSR分子标记开发提供理论依据。 相似文献
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