RNA G-四联体结构区的同义密码子进化选择

为探索同义密码子对RNA G-四联体(rG4)形成的适应效应,利用G4 Hunter算法搜寻5类真核生物mRNA蛋白编码区的rG4结构.通过对比天然序列和随机序列,评估rG4结构对同义密码子的选择偏好,分析影响rG4形成的因素,检验基因特定区域rG4结构的选择压力,以揭示rG4在基因调控中的潜在作用.结果 表明,在5类...     

SARS及其他几种冠状病毒密码子使用偏性的位点差异

分析了SARS冠状病毒以及其他5种冠状病毒基因编码起始区与终止区的密码子使用偏性.结果表明,冠状病毒基因组的稀有密码子倾向于出现在编码起始区和终止区附近.起始区的这种倾向性对冠状病毒基因的表达具有负性调控作用,可以用"稀有密码子调控假说"解释.终止区的这种倾向性表明,这些出现在终止区的稀有密码子对基因的表达也有负性调节作用.研究结果同时暗示了"稀有密码子调控假说"不仅适用于细菌,而且还适用于某些病毒基因组.