NCBI基因序列数据库使用和检索方法

针对基因组信息在生物信息学中日益占据重要的地位，介绍NCBI基因序列数据库使用特点及其检索方法。     

家猫加入基因组“俱乐部”

为什么缅因猫喜欢被人拥抱而俄罗斯短毛猫却对人冷淡呢？答案或许就藏在刚刚“出炉”的第一张家猫基因组草图里。科学家们在这张基因序列图中已经发现了20285个基因，通过对它们的分析，将有可能帮助研究人员找到治疗某些人类疾病以及解读猫科动物驯化之谜的钥匙。[第一段]     

优秀孩子的身后站着不平凡的父母

2014年1月24日,美国中文电视报道说:"有‘小诺贝尔奖’之称的英特尔少年科学天才奖22日公布了总决赛的40强名单。来自硅谷的华裔女高中生孔祥悦因发现破解乳腺癌的基因序列入围。这位女孩是硅谷名校林布鲁克高中的高三学生。在与斯坦福大学博士后蔡尚合作中,她发现了一个能抑制癌细胞生长的基因序列,并因此入围在华盛顿举行的英特尔少年科学天才奖总决赛。"每当看到类似的消息,我总会在心里悄     

基因工程细菌“吃”水雷

通过重新编排细菌的基因序列，科学家很可能开发出种神奇的劳动力。     

基因组学：多系统生命科学研究体系

DNA(脱氧核糖核酸)序列是基因的“文字”。基因是生命的“语言”，生命的“剧本”就写在基因组中。生命的“戏”由基因产物RNA(核糖核酸)和蛋白质在细胞的“舞台”上演出。三十多亿年来生命的故事既一脉相承，又千变万化；三十多亿年来的“生命演义”，翻过了卷卷兴衰。人类自从认识了基因，就试图将可观察到的生物性状和生命现象     

进化基因组学简介

随着基因组学的迅猛发展和基因组数据的大量积累，近年来诞生了一个新的生命科学研究方向——进化基因组学。从目前的研究看来，进化基因组学的研究主要在两个方面上进行。一个是以进化生物学的手段注释基因组，或从基因组水平试图理解生物学功能和生命现象。第二个是依据     

人纤维蛋白原α、β、γ基因的克隆和表达研究

纤维蛋白原(fibrinogen,Fg)是凝血因子I,在体内经凝血酶(thrombin)作用下转变为纤维蛋白,发挥其凝血和止血功能。本研究通过反转录的方法,从杭州人肝脏中成功克隆到人纤维蛋白原α、β、γ基因,并将其定向插入原核表达载体中,人纤维蛋白原α、β、γ基因经成功诱导获得表达,进一步纯化获得人纤维蛋白原α、β、γ蛋白。序列经比对,与Genbank上公布的序列同源性达97%～99%,这项研究为我国汉族人群纤维蛋白原基因核苷酸多态性和单倍型研究发挥一定作用,并且对纤维蛋白封闭剂的开发,提供了重要的产业化实验依据和技术基础。     

领先世界的生命科学基础研究成果(二)——记清华大学颜宁团队在世界上首次揭示GLUT1的晶体结构

<正>确立中国结构生物学领先优势人类对葡萄糖跨膜转运的研究巳有约100年的历史。1977年第一次从红细胞里分离出了转运葡萄糖的蛋白质GLUT1,在1985年鉴定出GLUT1的基因序列。在此之后,获取     

垃圾DNA真是垃圾吗？

在人类基因组计划实施之前,对于这项人类历史上规模空前的世界性合作研究项目究竟该做些什么,存在一些争议。有一派观点认为,只需要测定编码蛋白质的那些DNA序列即可,因为对于DNA序列,我们只关心其中与基因相关的部分,而基因     

肺炎克雷伯菌膜孔蛋白OmpK35、OmpK36基因分析及模型构建

对耐碳青霉烯类药肺炎克雷伯菌膜孔蛋白相关基因进行分析,构造膜孔蛋白结构模型,以了解膜孔蛋白在其耐药中的作用。采用聚合酶链技术(PCR)对确认为产KPC和IMP型碳青霉烯酶29株肺炎克雷伯菌的膜孔蛋白Omp K35和Omp K36基因进行检测、序列测定和生物信息学技术分析。结果,29株肺类克雷伯菌表现为对碳青霉烯类药物耐药、均检出膜孔蛋白Omp K35和Omp K36基因;通过序列比对和同源性分析发现,各菌株间存正突变、同源性高,构建了分子进化树和膜孔蛋白结构模拟图。结果表明,膜孔蛋白在碳青霉烯类药物耐药机制中不起主要作用,并初步了解膜孔蛋白分子进化情况和膜孔蛋白结构。