家蚕bHLH转录因子BmASCa_4基因的生物信息学分析及功能预测

家蚕的基因测序工作已于2003年10月完成,但是对于其bHLH转录因子BmASCa4基因的生物信息学分析及功能预测鲜有报道。文章利用生物信息学的方法,就家蚕bHLH转录因子BmASCa4基因结构及功能进行了分析,研究结果表明：家蚕bHLH转录因子BmASCa4基因结构信息只来自一条EST序列,该基因在编码区内无内含子;BmASCa4由l＇sc基因编码,在促进神经前体的形成中发挥作用。     

互联网上的蛋白质二维凝胶电泳(2DE)数据库资源

为了有效地实现信息资源的交换和共享 ,很多国际知名的实验室和研究机构均建立了各种蛋白质相关数据库。相对蛋白质序列数据库而言 ,蛋白质双向凝胶电泳 ( Two-dimensional gel electrophoresis,2 DE)图谱数据库分布比较分散。本文介绍了发布蛋白质 2 DE数据的主要研究机构 ,分门别类地作了综合性、哺乳类、植物类、微生物和真菌类等专业蛋白质 2 DE数据库的数据内容、特色评价 ,并对两个 2 DE专业搜索引擎的数据来源、检索功能等方面作了描述与评价。本文最后提出 ,今后蛋白质 2 DE数据库的建设过程中应加强数据的标准化、图谱显示格式的统一化     

非专业研究生生物信息学课程教学探讨

生物信息学作为新兴的交叉学科,已经成为生物学研究的强有力的辅助工具之一。本文针对目前非专业研究生生物学信息学教学实践中的一些问题,提出在教学目的、教学内容、教学方法方面的思考,希望能够有助于推动非专业研究生生物信息学课程教学的开展。     

生物信息学案例在《数据结构》教学中的应用

为了改善《数据结构》课程的教学效果,提高学生的学习兴趣,将生物信息学中的一些案例按照其涉及的数据结构原理,引入到《数据结构》教学之中。其中,典型案例包括串联重复序列中的基因识别问题、双序列比对的动态规划算法和多序列比对中寻找折中序列的问题。教学实践表明,引入生物信息学案例能使学生加深对相关算法的理解。     

芥菜中PP2A的生物信息学初步分析

以芥菜(Brassica juncea)中具有抗逆作用的植物蛋白磷酸酶PP2A为例,对其进行了生物信息学的初步分析。预测了PP2A的一级结构,二级结构及其基本性质。为生物信息学在研究抗逆蛋白中的应用提供了方法参考,为进一步研究PP2A在抗逆生理中的功能提供了有用的理论依据。     

Perl语言环境下生物信息学的数据库技术

生物信息学是一个集成了生物学、数学和计算机科学的新兴学科.而Perl语言是一种在生物信息学研究领域功能强大的脚本语言.本文综述了在Perl语言环境下应用于生物信息学的数据库技术以及互联网应用.     

DNA序列数形表示的研究

DNA序列的数形表示是用数学方法和计算机处理方法分析生物分子序列首先要解决的问题。序列表示的优劣会对最终分析结果有直接的影响。本文介绍了现有几种DNA序列数形表示方法。     

生物信息学中的马尔可夫模型

随着人类基因组研究的不断发展,在世界各个（Genbank,SwissPort等）数据库中积累了大量蛋白质、核酸序列数据,如何分析和处理这些数据以获得更多的信息成为科学家们关心的核心问题,并由此产生了生物信息学。文章介绍了在生物信息学研究中常见的几种用于数据库搜索、序列比较、建立蛋白质模型、发现新基因等研究的马尔可夫模型。     

Emerging Bioinformatic Networks: Contesting the Public Meaning of Private and the Private Meaning of Public

This paper explores the complexity of public/private identities in the emerging global economies of gene sequence mapping and analysis. In so doing we seek to offer a less over-determined acccount of what it means to describe institutional actors as either 'public' or 'private'. Instead, these 'codes' can be seen to offer actors a means of mutual positioning that, more usually conceals broader interdependencies within the world's bioinformatics networks.     

基础生物学课程群构建与实践

生命科学是生物信息学专业的灵魂,其中"基础生物学课程群"的建设在专业建设中的地位尤为重要。将所有基础生物学理论课程及其实践教学搭建成基础生物学课程群,解决了多门生物学课程协调、协作、协力之原则下实现共同建设的大问题,教学改革效果明显。