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| 基于希尔伯特分形的基因组序列压缩算法 | |
| 摘 要： | 给出一种基于希尔伯特分形的基因组序列压缩算法.为充分利用碱基间的相关性,算法首先使用希尔伯特分形曲线将基因组序列从一维映射到二维,从而得到映射图像.再对映射图像使用Context加权建模熵编码技术进行压缩.在Context加权中,权值的确定与各Context模型对应的描述长度有关.当接收端收到压缩图像后,对其进行解码,然后根据拟希尔伯特逆矩阵将映射图像转为一维,从而获得基因组序列.实验结果表明,尽管基于希尔伯特空间填充的二维基因组Context建模会引入无效编码区,但最终的压缩结果要略好于其他直接进行Context建模的算法. |
| 关 键 词： | 基因组压缩 希尔伯特空间填充 Context加权 描述长度 |
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