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| 伞房属CCR基因PCR优化体系建立及多拷贝的发现和分析 | |
| 引用本文： | 陈碧华,Merv Shepherd,梁一池. 伞房属CCR基因PCR优化体系建立及多拷贝的发现和分析[J]. 三明学院学报, 2007, 24(2): 180-188 |
| 作者姓名： | 陈碧华 Merv Shepherd 梁一池 |
| 作者单位： | 1. 福建农林大学,福建,福州,350003;福建省林业科学研究院,福建,福州,350012 2. Southem Cross University,Lismore NSW 2480,Australia 3. 福建农林大学,福建,福州,350003;三明学院,福建,三明,365004 |
| 基金项目： | 澳大利亚研究学会科研项目 |
| 摘 要： | 对伞房属CCR基因进行扩增,对影响PCR的条件进行优化,结果筛选出引物对A-3198适宜的PCR循环条件为：94℃预变性5min;94℃变性30s,60℃退火lmin,72℃延伸2min,运行30个循环;最后72℃后延伸7min。对伞房属树种进行PCR扩增时,发现用同一引物对,一个样本可以扩增出不同长度的条带。将目的片段进行克隆测序,得到6个序列。所分析的基因片段从Exon3-Exon5,其中Exon3变异位点具有3个,Intron3无变异位点;Exon4变异位点具有7个,Intron4变异位点最多,达到276个,Exon5变异位点也只有6个。从变异位点所占百分数分析,所有外显子包括Exon3、Exon4和Exon5,变异数百分率很低,从1.67%-1.98%,说明外显子是相对保守和稳定的。Intron3最稳定,无任何差异位点。Intron4差异最大,差异百分数高达,19.99%。在Intron4有4处插入发生。第1处插入发生在第2041-2067,插入27个碱基。第2处插入发生在第2127-2289,插入163个碱基。第3处插入为PolyA,6个样本都存在PolyA。第4处为SSR序列。在外显子上未发现2个或2个以上碱基的插入/缺失。从氨基酸的变异来分析,所发生的核苷酸变异很多是无义突变,只有Exon3的2个氨基酸、Exon4的3个氨基酸,以及Exon5的2个氨基酸发生有义突变。本试验于国内外首次发现伞房属树种CCR基因具有多拷贝现象,而在桉树另外2个属桉属和杯果木属的CCR研究中未曾发现。 |
| 关 键 词： | 伞房属 斑皮柠檬桉 肉桂酰-辅酶A还原酶 聚合酶链式反应 多拷贝 |
| 文章编号： | 1673-4343（2007）02-0180-09 |
| 修稿时间： | 2007-05-18 |
The Optimization of CCR PCR Conditions, the New Discovery and Analysis of Multi-copy Gene in the Genus Corymbia |
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| CHEN Bi-hua,Merv Shepherd,LIANG Yi-chi. The Optimization of CCR PCR Conditions, the New Discovery and Analysis of Multi-copy Gene in the Genus Corymbia[J]. Journal of Sanming University, 2007, 24(2): 180-188 | |
| Authors: | CHEN Bi-hua Merv Shepherd LIANG Yi-chi |
| Affiliation: | 1.Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350003, China; 2. Southern Cross University, Lismore NSW 2480, Australia; 3. Samming University, Sanming 365004, China; 4. Fujian Academy of Forestry Sciences, Fuzhou 350012, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | Corymbia Corymbia citriodara subsp.variegata(CCV) cinnamyol Co-A reductase(CCR) PCR multi-copy |
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