低温几丁质酶chiA基因克隆、同源建模及序列分析 |
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作者单位: | ;1.大连大学生命科学与技术学院 |
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摘 要: | 从假交替单胞菌(Pseudoalteromonas sp.DL-6)中克隆低温几丁质酶chiA基因(Gen Bank登录号KF234015)。该序列全长3160个核苷酸,编码1053个氨基酸,预测相对分子质量113.5 KDa,等电点(pI)4.49,命名为chiA。功能结构域分析显示其编码区包含信号肽、2个几丁质结合域、2个成人多囊肾病结构域、18家族几丁质酶催化域与18家族糖苷水解酶C端部分序列。利用Discovery Studio平台以同源建模的方法构建低温几丁质酶chi A的催化域三维结构模型,并对其进行结构优化和评估,Ramachandram图谱检测和Verify-3D评估显示模拟出的模型结构合理,整体的相容性较为可信。本结果拟为后期低温几丁质酶chiA的催化机理研究提供理论依据。
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关 键 词: | 低温几丁质酶chiA 假交替单胞菌 同源模建 序列分析 |
Cloning,Homology Modeling and Sequecnce Analysis of Cold-Adapted chi A |
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