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比较基因组学揭示植物乳杆菌ZJ316的生境适应性及潜在益生特性(英文)
摘    要:目的:前期研究发现植物乳杆菌ZJ316能显著抑制病原菌,促进仔猪生长,提高猪肉质量等,本研究拟在ZJ316全基因组测序的基础上,运用比较基因组学手段揭示与其生境适应性及益生特性相关基因。创新点:首次从基因水平上分析与植物乳杆菌ZJ316的生境适应性、抑菌活性及益生特性等相关的基因,为进一步揭示其生理功能打下基础。方法:运用BLASTN、Mauve和MUMmer等将植物乳杆菌ZJ316全基因组序列与已测序的8个植物乳杆菌全基因组序列进行比对及分析;用CRISPRFinder寻找CRISPR重复序列。结论:植物乳杆菌ZJ316包含碳水化合物的运输和代谢、蛋白水解酶系统和氨基酸的生物合成等相关基因,具有CRISPR、应激反应、耐胆盐、粘附宿主肠壁、胞外多糖、生物合成和细菌素生物合成等相关基因。这些基因的功能是其作为益生菌的重要特征和基础。

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