驴CSN3基因序列分析 |
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引用本文: | 陈建兴,陈海伟,毕晓丹,等.驴CSN3基因序列分析[J].赤峰学院学报(自然科学版),2014(14):11-13. |
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作者姓名: | 陈建兴 陈海伟 毕晓丹 |
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作者单位: | 赤峰学院生命科学学院;山东东阿阿胶股份有限公司; |
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基金项目: | 陈建兴主持2013年度内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZC13306)研究成果 |
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摘 要: | 家驴具有很大的市场开发潜力和价值.本研究通过生物信息学技术分析了家驴CSN3基因的序列特征,为家驴向肉用或乳用方向选育初步提供一定的分子依据.经分析研究发现家驴CSN3基因共包含五个外显子和四个内含子.初始转录物的前81nt为5'UTR区,后205nt为3'UTR区,中间的549nt为CDS区.整个CDS区翻译出182个氨基酸构成的多肽.家驴的κ酪蛋白中的氨基酸以脯氨酸所占的比例最高(14.286%),其次为缬氨酸(10.989%),最低的为半胱氨酸、色氨酸和甘氨酸(所占比例都为0.5495%).各物种κ酪蛋白氨基酸序列间每个位点氨基酸替代数的平均值的大小能够较好反映物种间亲缘关系的远近.κ酪蛋白氨基酸序列能够很好地反映物种之间的亲缘关系,适合用于系统发育分析.
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关 键 词: | 驴 CSN基因 κ酪蛋白 序列分析 |
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