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一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法
引用本文:傅兵,郭红.一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法[J].信息系统工程,2011(10):116-118.
作者姓名:傅兵  郭红
作者单位:福州大学数学与计算机科学学院
基金项目:福建省自然科学基金资助项目,福建省科技计划重点资助项目
摘    要:分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方法,运用此方法对蛋白质-配体复合物进行实验测试,实验结果与AutoDock3.05模拟退火算法和拉马克遗传算法在能量得分、对接精度和对接时间上进行对比分析,实验表明,AutoDockAIGA对接结果精确性高,收敛速度快,具有更高的寻优能力。

关 键 词:免疫遗传算法  分子对接  构象搜索  autodock3.05
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