一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法 |
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引用本文: | 傅兵,郭红.一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法[J].信息系统工程,2011(10):116-118. |
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作者姓名: | 傅兵 郭红 |
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作者单位: | 福州大学数学与计算机科学学院 |
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基金项目: | 福建省自然科学基金资助项目,福建省科技计划重点资助项目 |
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摘 要: | 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方法,运用此方法对蛋白质-配体复合物进行实验测试,实验结果与AutoDock3.05模拟退火算法和拉马克遗传算法在能量得分、对接精度和对接时间上进行对比分析,实验表明,AutoDockAIGA对接结果精确性高,收敛速度快,具有更高的寻优能力。
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关 键 词: | 免疫遗传算法 分子对接 构象搜索 autodock3.05 |
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