| 牛ANGPTL1基因的电子克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 马云,李芬,王启钊,甘祖平,左春生. 牛ANGPTL1基因的电子克隆与序列分析[J]. 平原大学学报, 2008, 0(4) |
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| 作者姓名： | 马云 李芬 王启钊 甘祖平 左春生 |
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| 作者单位： | 信阳师范学院生命科学学院 信阳农业高等专科学校动物科学系 |
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| 基金项目： | 河南省自然科学基金项目(项目编号:082300450490); 信阳师范学院青年骨干教师资助计划项目(项目编号:2006BAD04A16) |
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| 摘 要： | 以牛的ANGPTL1基因为研究对象,利用生物信息学方法,对牛的ANGPTL1基因进行了电子克隆和序列分析,并对推导出的ANGPTL1蛋白结构与性质进行了初步分析。结果表明,牛的ANGPTL1基因序列长为2576 bp,该基因的编码序列长为1 476 bp,编码492个氨基酸,编码序列的两翼有135 bp的5’非编码区和785 bp的3’非编码区。DNA序列的G+C百分含量为44.31%,A+T百分含量为55.69%。该基因的核苷酸序列与人、黑猩猩、鼠和狗ANGPTL1基因的cDNA序列的相似性分别为91%、90%、82%和93%。在氨基酸序列上与人、黑猩猩、鼠和狗的相似性分别为95%、95%、92%和95%。用氨基酸序列构建的进化树显示,在人、牛、黑猩猩、狗、褐鼠、原鸡几种动物中,牛与狗的亲缘关系最近。
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| 关 键 词： | 牛 ANGPTL1基因 序列分析 生物信息学 电子克隆 |
Cloning and Analyzing of the Bovine ANGPTL1 Gene in Silicon |
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| MA Yun,LI Fen,WANG Qi-zhao,GAN Zu-ping,ZUO Chun-sheng. Cloning and Analyzing of the Bovine ANGPTL1 Gene in Silicon[J]. Journal of Pingyuan University, 2008, 0(4) |
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| Authors: | MA Yun LI Fen WANG Qi-zhao GAN Zu-ping ZUO Chun-sheng |
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| Affiliation: | MA Yun1,LI Fen1,WANG Qi-zhao1,GAN Zu-ping1,ZUO Chun-sheng2(1.College of Life Science,Xinyang Normal University,Xinyang 464000,China2.Dept.of Animal Science,Xinyang Agricultural College,China) |
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| Abstract: | The study analyzed the ANGPTL1 sequence of cattle.Sequence analysis and bioinformatics study showed that this cDNA contained 2 576 nucleotides,with a 1 476 bp open reading frame(ORF) flanked by a 135 bp 5'UTR(incompletely) and a 785 bp 3'UTR.The CDS of the obtained bovine ANGPTL1 gene shows 91%,90%,82%,and 93% identity with the corresponding,human,chimpanzee,rattus and dog,respectively.The deduced amino acid sequence(492AA) shows 95%,95%,92% and 95% identity with the corresponding,human,chimpanzee,pig and d... |
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| Keywords: | cattle ANGPTL1 gene sequence study bioinformatics cloning in silicon |
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