鸡源NDV WF00C株F基因的测序与蛋白特性分析

用鸡源新城疫病毒凤阳分离株WF00C对9～10 日龄SPF鸡胚的尿囊腔接种,成功增殖了该病毒,采用一步法RT-PCR技术扩增WF00C病毒的F基因,获得了1条1.7kb的特异性条带.用PCR产物直接测序.测序结果表明,扩增片段大小为1782bp,含有1个1662bp的开放性阅读框,编码554个氨基酸.核苷酸同源性分析表明:WF00C株与国内外其他NDV F基因的同源性为84.8%～97.5%,其中与国内标准强毒株F48E9的同源性为87.1%,说明WF00C与国内外的传统毒株有较大变异.与Taiwan95株和J株的同源性为94.1%和97.5%,说明WF00C与Taiwan95株和J株亲缘关系较近,具有较高的相似性.F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112Arg-Arg-Gln-Lys -Arg-Phe117, 表明为NDV的强毒株.蛋白疏水性和抗原性分析表明与标准强毒株相比没有太大的变异.     

鸡新城疫病毒ND-xx08株F基因的克隆及分析

新城疫病毒(NDV)ND-xx08毒株经10 d龄SPF鸡胚增殖后,提取其基因组RNA并反转录成cDNA,用NDV F基因特异性引物,经PCR扩增后获得与F基因预期大小一致的DNA片段。将NDV F基因片段克隆到pMD18-T载体上,并进行EcoR I和Hind III双酶切鉴定和测序鉴定。结果显示,ND-xx08毒株F基因片段的长度为1 662 bp,共编码554个氨基酸,F蛋白的裂解位点为112R-R-Q-K-R-F117,是典型强毒株氨基酸序列结构。将NDV ND-xx08株F基因的47 bp到420 bp序列与新城疫病毒基因型I至基因型Ⅸ毒株的相同序列绘制病毒基因进化树,显示ND-xx08分离株属于基因Ⅶe型。将NDV ND-xx08株F全基因与国内外发表的23株NDV F基因核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比较分析,结果表明,其核苷酸序列的同源性在82.7%~97.8%之间,氨基酸同源性在87.5%~97.7%之间。     

基因3型猪戊型肝炎病毒浙江株全基因组序列分析（英文）

目的:扩增浙江地区基因3型戊型肝炎病毒全基因组序列,分析其分子特征及与国内外3型戊型肝炎病毒进行比较。创新点:首次分析报道浙江地区基因3型猪戊型肝炎病毒全序列。方法:利用套式PCR和末端快速扩增法对分离自浙江地区的戊型肝炎病毒进行分段扩增,经克隆测序后拼接全基因组。进一步利用生物信息学方法对基因组结构、开放阅读框及其基因型等进行分析,并与国内外戊型肝炎毒株进行比较分析。结论:浙江株戊型肝炎病毒(Zh J-PJ050-3)基因组由7223个核苷酸组成,其中3'非编码区含有23个碱基的poly(A)尾。全基因组包含ORF1、ORF2和ORF3三个主要基因,长度分别为5109、1983和342 bp。进化分析显示,ZhJ-PJ050-3为基因3型,与国内唯一报道的上海株3型毒株以及多数日本毒株共属3b亚型。与国内外戊型肝炎序列比对发现,ZhJ-PJ050-3基因组共有24个特有的点突变,且在ORF1中含有一个亮氨酸缺失。这些分子特征将为下一步的研究提供方向。     

猪源溶血性大肠杆菌fedA的克隆与表达

根据Imbereehts等报道的EHEC F18菌毛主要亚单位(fedA)基因序列设计一对引物，以重庆地区仔猪水肿病流行强毒株W96基因组DNA为模板，采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增到约500bp的核酸片段。用常规DNA重组技术将该片段克隆到表达载体pET28b( )的SalI-Hindm位点之间构建重组表达质粒pET28fedA，序列测定结果显示该克隆片段长447bp，同源性分析表明该基因片段与GenBank报道的fedA核苷酸序列有99．4％的同源性，W96株fedA基因三处核苷酸发生变异，其中两个为无义突变，另一个导致Q100R突变。将pET28fedA转入BL21(DE3)中进行诱导表达，经SDS—PAGE电泳检测上清存在约20KD的蛋白，6xHis affinity tag IMAC亲和层析显示该蛋白能被亲和纯化，说明是含有组氨酸标签的融合目的蛋白。     

珙桐rbcL基因的克隆与序列分析

根据已知植物rbcL基因设计引物,以珙桐叶片总DNA为模板,PCR扩增目的DNA片段,克隆入pDM19-T载体.阳性克隆鉴定后进行测序,序列分析结果表明:该基因片断长为1266 bp,包括1031 bp的编码区序列,编码343个氨基酸;其编码区氨基酸与烟草、菠菜、玉米、甘薯、拟南芥、水稻、葡萄、地钱和葡萄柚等9个物种的同源性94.13%以上,并构建了它们间的亲缘关系树.该基因片断的预测晶体结构与菠菜的最相近,推测Lys86、Lys60、Lys179等残基对酶的活性影响较大.     

犬冠状病毒TN449株纤突蛋白基因的克隆、序列分析

通过对犬冠状病毒TN449株纤突蛋白基因的克隆测序,将获得的序列与GeneBank中登陆的犬冠状病毒不同毒株S基因序列进行比较,分析它们的同源性、差异程度,同时绘制核苷酸序列及其氨基酸序列的系统进化树.有助于了解犬冠状病毒的抗原变异、血清型和毒力变化规律.     

南瓜种子中黄瓜绿斑驳花叶病毒IC-RT—PCR检测方法的建立

黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus, CGMMV)是葫芦科重要种传病毒之一.本文建立了免疫捕获RT-PCR(IC-RT-PCR)的分子检测方法直接从带毒种子中检测出该病毒,扩增获得其CP基因,并克隆到pMD18-T载体中,经核苷酸序列分析表明,该分离物CP基因全长为486个核苷酸,编码由161个氨基酸组成的17.3kDa蛋白,与国内外已报道的CGMMV的CP基因相比,其核苷酸序列的同源性为91.4%~99.4%,其推导的氨基酸同源性为98.8%~100%.IC-RT-PCR方法的建立,为检疫部门提供了从带毒种子中快速、准确检测该病毒的方法,很有应用前景.     

传播新冠病毒？蝙蝠做错了什么？

正2月3日,中国科学院武汉病毒所石正丽团队在国际顶级期刊《自然》(Nature)发表了一篇关于新型冠状病毒的文章。在该文章中,石教授团队发现2019-nCoV和SARS具有79%的基因同源性,在其团队发现的蝙蝠来源病毒基因库中,有一株病毒的基因序列能与2019-nCoV达到96%的相似度。目前,蝙蝠被认为是最有可能携带2019-nCoV病毒的野生动物。关于新型冠状病毒的自然宿主还需要进一步     

鹅副粘病毒的分离与鉴定

采用鸡胚接种法从安徽凤阳某患病鹅群中分离到一株病毒。经HA与HI试验、血清中和接种鸡胚试验、病毒回归试验确认为鹅副粘病毒 ,并命名为WF0 0 G株。参照新城疫病毒毒力判定的标准及其方法 ,测定该分离株的鸡胚最小致死量平均死亡时间 (MDT)、1日龄鸡脑接种致病指数 (ICPI)和 6周龄鸡静脉内接种致病指数 (IVPI)分别为 4 4 8h、1 81和 2 32 ,结果表明该分离株具有与新城疫病毒 (NDV)速发型相类似的毒力 ,属强毒力毒株。     

鹅副粘病毒的分离与鉴定

采用鸡胚接种法从安徽凤阳某患病鹅群中分离到一株病毒。经HA与HI试验、血清中和接种鸡胚试验、病毒回归试验确认为鹅副粘病毒，并命名为WF00G株，参照新城疫病毒毒力的判定的标准及其方法，测定该分离株的鸡胚最小致死量平均死亡时间（MDT）、1日龄鸡脑接种致病指数（ICPI）和6周龄鸡静脉内接种致病指数（IVPI）分别为44.8h、1.81和2.32，结果表明该分离株具有与新城疫病毒（NDV）速发型相类似的毒力，属强毒力毒株。     

排序定理的推广

从排序定理出发推导出两个新的排序不等式,并给出一些应用实例.     

Sequencing Tracing with Imagination

Educational Psychology Review - Cognitive load theory’s incorporation of evolutionary perspectives has generated several instructional designs based on movement, including the tracing effect,...     

蚓激酶基因克隆及序列分析

目的：克隆蚓激酶基因并在GENEBANK中进行序列分析．方法：采用RT—PCR技术，以蚯蚓总．RNA为模板进行扩增，克隆蚓激酶基因、用Blast软件对基因进行同源性分析．结果：克隆了一个cDNA片段，与GENEBANK中蚓激酶基因序列最高同源性为99％．结论：本方法实用可行，同源性分析表明克隆的cDNA片段具备完整的蚓激酶编码区，为下一步进行蚓激酶的表达研究奠定了良好的基础．     

顺序统计量及其分布

本文从分布函数的定义出发,对于一般的K(1≤k≤n)求出了X_K~(n)的分布函数,以及对于一般的i,j(1≤i相似文献   

SBR工艺污水处理技术

对SBR.工艺的特点、适用范围、常见的控制方法做了简要介绍,比较了用于SBR工艺中各种滗水器的优缺点.并借助相关文献的实验数据对SBR工艺的性能做出了分析.     

工件加工排序问题的研究

通过对在给定设备、按规定工序下多种工件加工排序问题的研究,得出了基于最短加工时间规则和优化加工顺序规则基础上的工件加工排序模型。该模型按工件加工时间长短,从短到长顺序排列,同时要求最紧张设备等待时间最小化。在设备等待时间最小化的前提下,优先加工在该设备上加工时间最短的工件,兼顾启发性的搜索方法,使平均流程时间最短。最后通过实例分析证实了该算法的有效性与实用性。     

DNA序列判读中的几个问题

通过对DNA序列判读过程中几个容易被忽视的问题的分析，提出了解决问题的方法以及进行序列正确判读的步骤。     

Sequencing and Differentiation in Young Children's Drawings

This paper reports a study of drawings of men and dogs by 80 British children aged 3-7 years, which are analysed for their degree of differentiation in relation to the graphic features and tools used, and also for the sequencing of the different features incorporated. In common with previous research, the degree and sophistication of differentiation is shown to generally increase with age. However, the production of different sequences of features within the two drawings is shown to be more closely and directly related to their degree of differentiation. It is argued that introducing young children to the use of different sequences in their drawings may facilitate their development in solving a range of graphic problems.     

水稻幼苗SAGE文库的构建和测序

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是功能基因组学研究中的一项功能强大的工具.对水稻幼苗SAGE文库的构建进行了探索试验,其主要操作步骤为:以磁珠法提取PolyA mRNA用于合成双链cDNA,再经过一系列的酶切、加接头序列、连接、PCR扩增,获得到26-bp的水稻双标签体,再将26-bp Ditag连接成标签链接体,并将其克隆进pZero-1载体中用于测序.DNA测序结果证明获得了水稻的SAGE标签.试验的各个中间步骤的结果均经过PCR验证.yh     

Assessing Error in Behavioral Data: Problems of Sequencing

Both classical test theory and generalizability theory focus on measurement error as a group property. Thus, common estimates o f errors o f measurement are developed for all members o f a group. But with behavioral data, unlike specifically test data, it is sometimes possible to estimate error separately for each individual. This enables one to ask questions about the relationships between error o f measurement and other characteristics o f the individual. Consequently, it also makes possible the use of regression techniques to call upon group data to improve the estimates o f individual measurement error. The focus on the individual also lays bare the possibility o f sequencing effects, and it is shown that, even in the absence o f trend, autocorrelation can cause standard procedures to grossly underestimate the magnitude o f measurement error. Classroom observation data are examined for autocorrelation, and recommendations are made about the scheduling o f data collection so as to minimize its effects.